Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Stag2-202ENSMUST00000115072 5955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Olfr123-202ENSMUST00000214770 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Tfpi-205ENSMUST00000111717 2962 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm42397-206ENSMUST00000208808 1358 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm21119-201ENSMUST00000178438 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Cc2d2b-203ENSMUST00000207801 3730 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm21037-201ENSMUST00000209086 2608 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Sirpb1b-201ENSMUST00000091319 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm14806-201ENSMUST00000116606 2110 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm6288-201ENSMUST00000100778 1590 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Mrgprb1-201ENSMUST00000094384 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm45223-201ENSMUST00000207037 5138 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Aadacl3-201ENSMUST00000105749 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Kcnrg-201ENSMUST00000051184 1766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm19176-201ENSMUST00000222149 1831 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Zfp37-207ENSMUST00000222748 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Il12rb2-202ENSMUST00000117441 2600 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm7709-201ENSMUST00000199391 1858 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Cep290-201ENSMUST00000164751 8006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Zfy1-201ENSMUST00000065545 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Ear-ps2-201ENSMUST00000100689 466 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm26144-201ENSMUST00000104475 132 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Cep112-203ENSMUST00000106718 839 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Lrrc51-207ENSMUST00000106967 675 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Otc-202ENSMUST00000115528 2997 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm14576-201ENSMUST00000118073 1111 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm11848-201ENSMUST00000121207 973 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm23883-201ENSMUST00000122686 290 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm24690-201ENSMUST00000157759 97 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Rps11-ps1-201ENSMUST00000171632 475 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm20519-201ENSMUST00000173684 359 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm2539-203ENSMUST00000181352 746 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 1110046J04Rik-203ENSMUST00000181800 777 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm27820-201ENSMUST00000183628 175 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm27855-201ENSMUST00000184122 128 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm28652-201ENSMUST00000187008 599 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 1700110C19Rik-202ENSMUST00000188715 717 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm6693-201ENSMUST00000189583 813 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 1700031M16Rik-206ENSMUST00000191037 711 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm42663-201ENSMUST00000199883 351 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm45069-201ENSMUST00000208604 317 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm45269-201ENSMUST00000210359 282 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 AC183268.2-201ENSMUST00000214513 446 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm7607-201ENSMUST00000214920 518 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm19174-201ENSMUST00000216944 956 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 AC121788.1-201ENSMUST00000218514 1046 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Wfdc15a-201ENSMUST00000063251 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 1700013H16Rik-201ENSMUST00000067940 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 4933411G06Rik-201ENSMUST00000075909 1022 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Mir99a-201ENSMUST00000083596 65 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Scgb2b27-201ENSMUST00000085620 512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm44433-201ENSMUST00000203540 4832 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Hdx-202ENSMUST00000113422 9534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Mctp1-201ENSMUST00000109583 2283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Als2cr12-203ENSMUST00000188772 1382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Polk-205ENSMUST00000221899 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Olfr78-201ENSMUST00000060187 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Cpb2-201ENSMUST00000022576 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 A430027C01Rik-201ENSMUST00000194599 1644 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Akap4-202ENSMUST00000115750 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm10933-201ENSMUST00000221891 1861 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1252-203ENSMUST00000216203 3243 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Npat-201ENSMUST00000035850 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm44801-201ENSMUST00000207644 2060 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r39-203ENSMUST00000227285 2245 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm43312-201ENSMUST00000201655 2466 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r204-202ENSMUST00000228195 2936 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Rprd2-202ENSMUST00000197449 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Trbv12-2-201ENSMUST00000103269 385 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm22372-201ENSMUST00000104589 136 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Ppih-202ENSMUST00000106317 613 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Mir466f-4-201ENSMUST00000116930 121 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm3931-201ENSMUST00000119038 455 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm12303-201ENSMUST00000119506 673 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm16200-201ENSMUST00000120385 331 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm15044-201ENSMUST00000120703 598 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 1700048M11Rik-201ENSMUST00000132861 485 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm14974-201ENSMUST00000139112 804 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm13211-201ENSMUST00000141649 697 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Crem-235ENSMUST00000154705 529 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm22724-201ENSMUST00000158091 127 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm24731-201ENSMUST00000158227 131 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm22411-201ENSMUST00000175462 126 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm22002-201ENSMUST00000175622 125 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm6472-201ENSMUST00000178147 651 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 1500015L24Rik-202ENSMUST00000179640 780 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm3696-202ENSMUST00000179898 612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm16617-201ENSMUST00000181008 675 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Rps12-ps24-201ENSMUST00000182321 381 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm28238-201ENSMUST00000188102 383 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm21617-201ENSMUST00000188297 691 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm29475-201ENSMUST00000190767 312 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm37571-201ENSMUST00000195048 614 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm18702-201ENSMUST00000196923 588 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm3970-201ENSMUST00000198001 334 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm44360-201ENSMUST00000200081 82 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm31305-202ENSMUST00000200435 761 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Gstm2-ps1-201ENSMUST00000201478 657 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Rprd1bQ9CSU0 Gm8719-201ENSMUST00000203602 534 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76 ms