Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Vmn1r196-205ENSMUST00000228557 5790 ntAPPRIS P2 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Gm21985-201ENSMUST00000141047 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Slc14a1-201ENSMUST00000091813 3665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 AC126439.1-201ENSMUST00000226772 2104 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Olfr734-203ENSMUST00000217152 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Zfp989-202ENSMUST00000146688 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 March1-204ENSMUST00000110253 2748 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Gm44723-201ENSMUST00000207369 4000 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Dmxl1-201ENSMUST00000041772 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Sulf1-202ENSMUST00000177608 5598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Gm15333-201ENSMUST00000118825 364 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Abca15-202ENSMUST00000121265 5335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Gm22395-201ENSMUST00000177427 96 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Kat6b-ps1-201ENSMUST00000187624 3433 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 A430093F15Rik-206ENSMUST00000189565 651 ntTSL 3 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Gm30043-201ENSMUST00000196689 733 ntTSL 2 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Gm43567-201ENSMUST00000197581 1978 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Gm44138-201ENSMUST00000204939 271 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 AC124581.3-201ENSMUST00000224270 1624 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 AC121978.1-201ENSMUST00000228357 380 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Olfr693-201ENSMUST00000057817 952 ntAPPRIS P1 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Abca15-201ENSMUST00000076272 5335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Celf2-202ENSMUST00000100429 7491 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Gm21122-201ENSMUST00000191548 3452 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Gm42772-201ENSMUST00000199945 3041 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Vmn1r77-202ENSMUST00000226525 8252 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Gm13582-201ENSMUST00000146034 2655 ntTSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Ktn1-203ENSMUST00000185940 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Ktn1-208ENSMUST00000187039 3875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 8430419K02Rik-201ENSMUST00000128654 1870 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Ptprd-213ENSMUST00000173376 4793 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Ncoa7-203ENSMUST00000213836 2989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Hlcs-209ENSMUST00000228910 4150 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Tnr-202ENSMUST00000192069 12202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Fabp12-202ENSMUST00000117917 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Gm12423-201ENSMUST00000118334 135 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Gm15227-201ENSMUST00000121844 399 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Gm15738-201ENSMUST00000131985 275 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Gm12707-201ENSMUST00000155789 489 ntTSL 3 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Gm23501-201ENSMUST00000157744 256 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Fabp7-202ENSMUST00000165013 880 ntTSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Gm27568-201ENSMUST00000184220 99 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Gm28957-201ENSMUST00000190174 373 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 4930567H12Rik-204ENSMUST00000213085 801 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Gm30676-201ENSMUST00000214000 1165 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Gm29502-201ENSMUST00000185979 3739 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Gm45838-201ENSMUST00000207355 2447 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 P2ry12-202ENSMUST00000170388 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Vmn2r-ps38-201ENSMUST00000173752 2573 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Gm5444-201ENSMUST00000065956 2468 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 D5Ertd577e-201ENSMUST00000094593 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Gm6729-202ENSMUST00000219485 2209 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Gm37925-201ENSMUST00000195352 4255 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Ccna2-205ENSMUST00000196316 2001 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 AC160029.1-201ENSMUST00000219628 2678 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Olfr281-202ENSMUST00000217517 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Gm11447-201ENSMUST00000118983 858 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Gm15338-201ENSMUST00000151884 552 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Pkib-209ENSMUST00000177325 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Cox6b2-202ENSMUST00000182048 465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Olr1-204ENSMUST00000183258 468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 1700060O08Rik-201ENSMUST00000185390 281 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Gm37088-201ENSMUST00000193887 406 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 AC136146.1-201ENSMUST00000196180 91 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Specc1-201ENSMUST00000049836 6091 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Gm2832-201ENSMUST00000172412 1760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Amy2a3-201ENSMUST00000179314 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Amy2a4-201ENSMUST00000179568 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Amy2a2-201ENSMUST00000098667 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Gm43843-201ENSMUST00000202396 1587 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Gm37766-201ENSMUST00000192244 2567 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Tank-205ENSMUST00000112502 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Gm42798-201ENSMUST00000200853 3972 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Slc22a29-205ENSMUST00000222533 1473 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 1500005C15Rik-201ENSMUST00000199867 2394 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Tfec-201ENSMUST00000031533 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Nlrp9c-201ENSMUST00000041845 2631 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Trbv12-1-201ENSMUST00000103267 389 ntAPPRIS P1 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Igkv4-70-201ENSMUST00000103348 379 ntAPPRIS P1 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Gm23594-201ENSMUST00000104307 134 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Gm22493-201ENSMUST00000104494 132 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Plgrkt-201ENSMUST00000016639 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Gm6632-201ENSMUST00000168425 954 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Gm4842-201ENSMUST00000183237 835 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Gm19585-201ENSMUST00000186007 587 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 4930598F16Rik-201ENSMUST00000187352 761 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Gm29196-201ENSMUST00000189239 618 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Gm40323-201ENSMUST00000200649 645 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Gm3189-201ENSMUST00000205595 832 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Gm6657-204ENSMUST00000211288 1091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Gm19186-201ENSMUST00000219922 333 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Herc1-201ENSMUST00000042824 15153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Pcsk1-201ENSMUST00000022075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Zfp143-202ENSMUST00000169638 2914 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Nipal1-201ENSMUST00000087212 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Dock10-201ENSMUST00000077946 7198 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Vmn2r52-201ENSMUST00000164918 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Gm42531-201ENSMUST00000201648 4048 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Rpl23a-201ENSMUST00000102483 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Lrrc69-202ENSMUST00000108276 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.1 ms