Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 AC168062.2-201ENSMUST00000228907 422 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Skap2Q3UND0 Olfr1491-201ENSMUST00000052737 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Skap2Q3UND0 Gm7984-201ENSMUST00000060640 538 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Skap2Q3UND0 Olfr198-201ENSMUST00000064452 1054 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Skap2Q3UND0 Olfr365-201ENSMUST00000074168 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Skap2Q3UND0 Gm26107-201ENSMUST00000083972 107 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Skap2Q3UND0 Gm94-201ENSMUST00000096570 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Skap2Q3UND0 Olfr720-204ENSMUST00000217642 4832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Skap2Q3UND0 Olfr740-202ENSMUST00000214792 4103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Skap2Q3UND0 Gm4513-201ENSMUST00000207881 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Skap2Q3UND0 Gm4565-201ENSMUST00000208134 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Skap2Q3UND0 Zfp78-201ENSMUST00000086323 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Skap2Q3UND0 Olfr127-202ENSMUST00000217223 3733 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Skap2Q3UND0 Bbx-203ENSMUST00000089404 4024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Skap2Q3UND0 Klrk1-205ENSMUST00000168919 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Skap2Q3UND0 Gabrg1-201ENSMUST00000031119 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Skap2Q3UND0 Gm36963-201ENSMUST00000193506 2324 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Skap2Q3UND0 Zfp78-203ENSMUST00000207314 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Skap2Q3UND0 Gm10648-201ENSMUST00000207552 2902 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Skap2Q3UND0 Mfsd4b4-201ENSMUST00000178045 3508 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Skap2Q3UND0 AC154841.1-201ENSMUST00000227263 1479 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Skap2Q3UND0 Clec12a-201ENSMUST00000065289 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Skap2Q3UND0 Tdrkh-207ENSMUST00000197901 2652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Skap2Q3UND0 Olfr60-203ENSMUST00000211031 2650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Skap2Q3UND0 Olfr60-204ENSMUST00000215023 2692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Skap2Q3UND0 Ugt2a1-201ENSMUST00000147854 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Skap2Q3UND0 Gm28965-201ENSMUST00000186015 1500 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
Skap2Q3UND0 Kcnma1-202ENSMUST00000074983 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
Skap2Q3UND0 Serpinb6b-202ENSMUST00000110293 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Skap2Q3UND0 Gm5141-201ENSMUST00000167516 1743 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Skap2Q3UND0 Ms4a4c-201ENSMUST00000072729 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Skap2Q3UND0 Abcd2-201ENSMUST00000069511 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Skap2Q3UND0 Copg2-201ENSMUST00000048774 3961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Skap2Q3UND0 Trbv29-201ENSMUST00000103281 353 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Skap2Q3UND0 Gm26417-201ENSMUST00000104274 135 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Skap2Q3UND0 Gm25379-201ENSMUST00000104338 114 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Skap2Q3UND0 Dppa1-202ENSMUST00000109227 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Skap2Q3UND0 Clec1b-202ENSMUST00000112079 455 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Skap2Q3UND0 Swi5-204ENSMUST00000113400 522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Skap2Q3UND0 Gm7485-201ENSMUST00000119502 1109 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Skap2Q3UND0 Gm13711-201ENSMUST00000119708 453 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Skap2Q3UND0 Gm14766-201ENSMUST00000121689 367 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Skap2Q3UND0 Gm24781-201ENSMUST00000157636 117 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Skap2Q3UND0 Mir1930-201ENSMUST00000158799 84 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Skap2Q3UND0 1700016C15Rik-201ENSMUST00000016106 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Skap2Q3UND0 Gm16094-201ENSMUST00000162784 427 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Skap2Q3UND0 Gm18953-201ENSMUST00000175694 300 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Skap2Q3UND0 Gm20691-201ENSMUST00000176889 333 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Skap2Q3UND0 Gm26365-201ENSMUST00000179177 94 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Skap2Q3UND0 Gm15099-201ENSMUST00000179833 573 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Skap2Q3UND0 Gm3543-202ENSMUST00000179947 231 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Skap2Q3UND0 Anks1b-207ENSMUST00000182045 544 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Skap2Q3UND0 Platr10-201ENSMUST00000190602 1026 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Skap2Q3UND0 Gm4742-201ENSMUST00000200261 771 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Skap2Q3UND0 Gm44613-202ENSMUST00000205962 691 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Skap2Q3UND0 Helt-202ENSMUST00000210652 1282 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Skap2Q3UND0 Olfr291-201ENSMUST00000211582 1159 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Skap2Q3UND0 Olfr534-ps1-201ENSMUST00000211776 870 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Skap2Q3UND0 AC122327.2-201ENSMUST00000220883 120 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Skap2Q3UND0 AC122327.3-201ENSMUST00000221852 120 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Skap2Q3UND0 Gm40658-202ENSMUST00000221900 701 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Skap2Q3UND0 AC163354.1-203ENSMUST00000222356 643 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Skap2Q3UND0 AC166341.1-201ENSMUST00000223360 105 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Skap2Q3UND0 AC158511.1-201ENSMUST00000223622 764 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Skap2Q3UND0 AC108947.1-201ENSMUST00000224274 1000 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Skap2Q3UND0 AC161275.1-201ENSMUST00000224668 208 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Skap2Q3UND0 AC137871.2-201ENSMUST00000226482 289 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Skap2Q3UND0 AC116319.2-201ENSMUST00000228159 984 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Skap2Q3UND0 Ocm-201ENSMUST00000031622 658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Skap2Q3UND0 Mucl2-201ENSMUST00000037685 639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Skap2Q3UND0 Krtap6-1-201ENSMUST00000076906 594 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Skap2Q3UND0 Gm25587-201ENSMUST00000082498 166 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Skap2Q3UND0 AC158232.1-201ENSMUST00000217882 2071 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Skap2Q3UND0 Gm10475-201ENSMUST00000084713 1796 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Skap2Q3UND0 Mttp-202ENSMUST00000098580 3072 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Skap2Q3UND0 Gtpbp4-204ENSMUST00000222098 8783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Skap2Q3UND0 Atp10b-201ENSMUST00000077659 6825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Skap2Q3UND0 Ect2l-201ENSMUST00000095817 2900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Skap2Q3UND0 Zfp426-203ENSMUST00000163348 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Skap2Q3UND0 Gm45633-201ENSMUST00000210669 3253 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Skap2Q3UND0 Gm11590-201ENSMUST00000118999 1455 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Skap2Q3UND0 Gm17435-201ENSMUST00000181452 2994 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Skap2Q3UND0 Pbrm1-202ENSMUST00000022474 4843 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Skap2Q3UND0 Gm37186-201ENSMUST00000195629 2861 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Skap2Q3UND0 Dnase1l1-202ENSMUST00000075821 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Skap2Q3UND0 C230099D08Rik-201ENSMUST00000215772 2727 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Skap2Q3UND0 4833413G10Rik-201ENSMUST00000199632 1946 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Skap2Q3UND0 Vmn1r208-202ENSMUST00000227136 3156 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Skap2Q3UND0 Olfr406-202ENSMUST00000214303 2842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Skap2Q3UND0 Zfp457-201ENSMUST00000049705 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Skap2Q3UND0 Gm18796-201ENSMUST00000190440 1767 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Skap2Q3UND0 Gm37951-201ENSMUST00000192963 3032 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Skap2Q3UND0 Gm30292-201ENSMUST00000194198 3000 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Skap2Q3UND0 Emsy-202ENSMUST00000205276 7693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Skap2Q3UND0 Frem2-201ENSMUST00000091137 12348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Skap2Q3UND0 Olfr591-202ENSMUST00000216581 4802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Skap2Q3UND0 Olfr1036-201ENSMUST00000164985 3203 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Skap2Q3UND0 Ppip5k2-205ENSMUST00000171129 3425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Skap2Q3UND0 Gm10727-201ENSMUST00000197107 1602 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Skap2Q3UND0 Atp12a-201ENSMUST00000007340 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms