Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Gm37927-201ENSMUST00000192238 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Gm37544-201ENSMUST00000192803 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Gm37635-201ENSMUST00000193129 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Gm21809-202ENSMUST00000194072 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Gm44456-201ENSMUST00000196554 89 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Q3U6N9 4930519L02Rik-202ENSMUST00000200254 452 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Gm5-202ENSMUST00000202386 420 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Gm44110-201ENSMUST00000203871 475 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Gm45156-201ENSMUST00000207255 439 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Gm44813-201ENSMUST00000207921 361 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Gm44845-201ENSMUST00000208773 335 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Gm45474-201ENSMUST00000209471 408 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Q3U6N9 AC167250.1-202ENSMUST00000213629 672 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Q3U6N9 4933411E02Rik-201ENSMUST00000216779 1030 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Q3U6N9 AC134537.2-201ENSMUST00000217770 575 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Q3U6N9 AC154755.1-201ENSMUST00000225244 537 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Q3U6N9 AC131745.2-201ENSMUST00000225736 565 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Q3U6N9 AC154452.1-201ENSMUST00000225819 241 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Q3U6N9 AC192088.2-201ENSMUST00000227590 411 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Trappc1-201ENSMUST00000060956 628 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Olfr871-201ENSMUST00000073122 1147 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Mir449a-201ENSMUST00000083641 91 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Rpl29-ps2-201ENSMUST00000086508 478 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Olfr1056-201ENSMUST00000099893 1079 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Vmn1r203-202ENSMUST00000227520 8227 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Olfr1505-202ENSMUST00000216623 3567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Pcdh9-202ENSMUST00000192221 5161 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Tbx22-204ENSMUST00000168403 1715 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Gm42923-201ENSMUST00000198438 2896 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Nsun6-201ENSMUST00000028034 2897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Q3U6N9 1700080O16Rik-201ENSMUST00000033449 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Gm37250-201ENSMUST00000194919 2388 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Trim24-202ENSMUST00000120238 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Flrt2-201ENSMUST00000057324 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Gm6871-202ENSMUST00000110214 1638 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Vmn1r39-201ENSMUST00000226217 2258 ntAPPRIS P2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Vmn1r39-204ENSMUST00000227555 2297 ntAPPRIS P2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Vmn1r39-205ENSMUST00000228008 2283 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Slc7a2-203ENSMUST00000117077 7626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Vmn1r90-206ENSMUST00000227566 6901 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Olfr963-202ENSMUST00000215649 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Cftr-204ENSMUST00000129452 2835 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Q3U6N9 4930555F03Rik-202ENSMUST00000126285 3604 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Q3U6N9 S100pbp-201ENSMUST00000049081 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Zfp825-203ENSMUST00000221173 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Zp3r-202ENSMUST00000128128 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Gm26563-202ENSMUST00000181152 1931 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Olfr328-204ENSMUST00000216725 2904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Nlrp5-201ENSMUST00000015866 3508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Gm16513-202ENSMUST00000201663 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Clec4a2-202ENSMUST00000041779 2481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Gm45632-201ENSMUST00000211532 1888 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Olfr1299-201ENSMUST00000207228 1678 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Q3U6N9 AC166344.3-203ENSMUST00000228117 1466 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Gm23692-201ENSMUST00000101881 160 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Vmn1r124-201ENSMUST00000105200 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Gm11561-201ENSMUST00000117429 417 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Gm11781-201ENSMUST00000118328 472 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Gm11975-201ENSMUST00000118772 481 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Gm13991-201ENSMUST00000120190 648 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Gm12808-201ENSMUST00000120597 404 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Gm11805-201ENSMUST00000121238 600 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Mup-ps15-201ENSMUST00000121741 539 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Tex35-204ENSMUST00000121911 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Gm12701-201ENSMUST00000134206 659 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Q3U6N9 9030204H09Rik-201ENSMUST00000139455 653 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Gm15892-201ENSMUST00000152627 439 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Gm10269-201ENSMUST00000165229 372 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Gm20397-201ENSMUST00000174520 362 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Gm21909-201ENSMUST00000178260 439 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Gm10251-201ENSMUST00000178788 384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Q3U6N9 6330403N20Rik-201ENSMUST00000180467 1189 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Gm29596-201ENSMUST00000185710 385 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Q3U6N9 1700015G11Rik-202ENSMUST00000185758 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Gm28873-201ENSMUST00000186130 667 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Gm29474-201ENSMUST00000187688 379 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Gm18553-201ENSMUST00000194152 634 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Gm37215-201ENSMUST00000194927 1259 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Gm43390-201ENSMUST00000196614 421 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Q3U6N9 1700065J11Rik-201ENSMUST00000201560 424 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Gm44137-201ENSMUST00000203670 367 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Gm44048-201ENSMUST00000204531 361 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Gm18468-201ENSMUST00000207321 369 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Gm18470-201ENSMUST00000207467 420 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Gm18465-201ENSMUST00000207468 369 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Gm18464-201ENSMUST00000207803 420 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Gm18458-201ENSMUST00000207908 369 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Gm18461-201ENSMUST00000208421 420 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Lrrc72-201ENSMUST00000020853 660 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Gm44516-201ENSMUST00000208794 833 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Gm18205-201ENSMUST00000209215 841 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Q3U6N9 CT025665.1-201ENSMUST00000215251 1199 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Gm19256-201ENSMUST00000218550 231 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Lrrc72-203ENSMUST00000221155 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Gm6049-201ENSMUST00000222369 458 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Olfr148-201ENSMUST00000050807 1017 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Rpl21-ps13-201ENSMUST00000072532 483 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Olfr1537-201ENSMUST00000073248 945 ntAPPRIS P2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Spink7-201ENSMUST00000076194 258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Q3U6N9 Gm12185-201ENSMUST00000059930 5252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
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