Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 Olfr1181-201ENSMUST00000099823 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Shcbp1lQ3TTP0 Gm44440-201ENSMUST00000203139 2373 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Shcbp1lQ3TTP0 Nsun6-208ENSMUST00000195749 3149 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Shcbp1lQ3TTP0 E330013P04Rik-201ENSMUST00000065383 2070 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Shcbp1lQ3TTP0 Olfr1036-201ENSMUST00000164985 3203 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp871-201ENSMUST00000057501 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Shcbp1lQ3TTP0 Gm20356-201ENSMUST00000193390 2477 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Shcbp1lQ3TTP0 Rhbdd1-202ENSMUST00000140020 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Shcbp1lQ3TTP0 Tor1aip2-203ENSMUST00000097526 2589 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Shcbp1lQ3TTP0 Vwc2l-201ENSMUST00000053922 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Shcbp1lQ3TTP0 Gm37370-201ENSMUST00000191996 1410 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Shcbp1lQ3TTP0 Csn1s1-201ENSMUST00000094641 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Shcbp1lQ3TTP0 Olfr635-202ENSMUST00000209473 8565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Shcbp1lQ3TTP0 AC154841.1-201ENSMUST00000227263 1479 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Shcbp1lQ3TTP0 Gm5415-201ENSMUST00000171322 3609 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Shcbp1lQ3TTP0 Usp26-202ENSMUST00000114869 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Shcbp1lQ3TTP0 Usp26-201ENSMUST00000069509 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Shcbp1lQ3TTP0 Ralgapa2-202ENSMUST00000109986 11030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Shcbp1lQ3TTP0 Gm4954-201ENSMUST00000135069 1601 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Shcbp1lQ3TTP0 Ifi205-201ENSMUST00000059226 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Shcbp1lQ3TTP0 Olfr1385-202ENSMUST00000214948 4412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Shcbp1lQ3TTP0 Olfr922-202ENSMUST00000213164 4028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Shcbp1lQ3TTP0 Fancd2-201ENSMUST00000036340 5512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Shcbp1lQ3TTP0 Bclaf1-203ENSMUST00000185800 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Shcbp1lQ3TTP0 Gm15478-201ENSMUST00000145914 2172 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Shcbp1lQ3TTP0 AC154627.2-201ENSMUST00000227028 4669 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Shcbp1lQ3TTP0 Gm44288-201ENSMUST00000205061 2795 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Shcbp1lQ3TTP0 n-R5s16-201ENSMUST00000104555 119 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Shcbp1lQ3TTP0 Gm14326-201ENSMUST00000108928 767 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp967-201ENSMUST00000108997 417 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp969-201ENSMUST00000109027 417 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp965-203ENSMUST00000109043 417 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Shcbp1lQ3TTP0 Mir466f-4-201ENSMUST00000116930 121 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Shcbp1lQ3TTP0 Csnk2a1-ps-201ENSMUST00000118846 1175 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Shcbp1lQ3TTP0 Mup-ps21-201ENSMUST00000119998 448 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Shcbp1lQ3TTP0 Gm12768-201ENSMUST00000120055 759 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Shcbp1lQ3TTP0 Mup-ps28-201ENSMUST00000120686 289 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Shcbp1lQ3TTP0 Gm26424-201ENSMUST00000122530 104 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Shcbp1lQ3TTP0 Gm4764-201ENSMUST00000130207 1233 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Shcbp1lQ3TTP0 4930519D14Rik-201ENSMUST00000151471 1137 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Shcbp1lQ3TTP0 Gm25826-201ENSMUST00000157090 137 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Shcbp1lQ3TTP0 Gm22895-201ENSMUST00000157508 308 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Shcbp1lQ3TTP0 Gm25981-201ENSMUST00000157921 295 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Shcbp1lQ3TTP0 Gm24395-201ENSMUST00000158139 125 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Shcbp1lQ3TTP0 Gm24768-201ENSMUST00000158512 94 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Shcbp1lQ3TTP0 Gm9006-201ENSMUST00000165520 841 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Shcbp1lQ3TTP0 Gm17024-201ENSMUST00000165676 634 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Shcbp1lQ3TTP0 Gypc-201ENSMUST00000172434 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Shcbp1lQ3TTP0 Gm9457-201ENSMUST00000180176 372 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Shcbp1lQ3TTP0 Gm26665-201ENSMUST00000181378 839 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Shcbp1lQ3TTP0 Gm3605-201ENSMUST00000185858 440 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Shcbp1lQ3TTP0 Gm28640-201ENSMUST00000190918 550 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Shcbp1lQ3TTP0 Gm37193-201ENSMUST00000193087 513 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Shcbp1lQ3TTP0 4931440P22Rik-205ENSMUST00000194448 474 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Shcbp1lQ3TTP0 Gm9057-201ENSMUST00000198791 296 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Shcbp1lQ3TTP0 Gm34149-201ENSMUST00000203547 304 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Shcbp1lQ3TTP0 Gm32591-202ENSMUST00000204063 403 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Shcbp1lQ3TTP0 Olfr1353-202ENSMUST00000204849 1015 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Shcbp1lQ3TTP0 Gm33248-202ENSMUST00000206954 486 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Shcbp1lQ3TTP0 Olfr949-ps1-201ENSMUST00000215546 949 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Shcbp1lQ3TTP0 AC132384.3-201ENSMUST00000219709 472 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Shcbp1lQ3TTP0 Gm19134-201ENSMUST00000221203 487 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Shcbp1lQ3TTP0 AC183092.2-201ENSMUST00000225542 1153 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Shcbp1lQ3TTP0 CT030684.2-201ENSMUST00000228946 826 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Shcbp1lQ3TTP0 Psma4-201ENSMUST00000034848 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Shcbp1lQ3TTP0 Gm4861-201ENSMUST00000068546 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Shcbp1lQ3TTP0 Gm16335-201ENSMUST00000077495 309 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Shcbp1lQ3TTP0 Rpl35a-ps7-201ENSMUST00000080603 333 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Shcbp1lQ3TTP0 Scgb2b27-201ENSMUST00000085620 512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Shcbp1lQ3TTP0 Cd59b-201ENSMUST00000090429 796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Shcbp1lQ3TTP0 Fat1-203ENSMUST00000189017 14651 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Shcbp1lQ3TTP0 Hyal5-201ENSMUST00000031689 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Shcbp1lQ3TTP0 Pja2-203ENSMUST00000172733 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Shcbp1lQ3TTP0 Usp17lc-202ENSMUST00000106892 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Shcbp1lQ3TTP0 Dclre1a-204ENSMUST00000182276 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Shcbp1lQ3TTP0 Als2cr12-203ENSMUST00000188772 1382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Shcbp1lQ3TTP0 Olfr303-205ENSMUST00000216409 4106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Shcbp1lQ3TTP0 Scp2-ps2-203ENSMUST00000216438 1370 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Shcbp1lQ3TTP0 Gm5868-201ENSMUST00000031124 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Shcbp1lQ3TTP0 Enox2-209ENSMUST00000167659 3632 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Shcbp1lQ3TTP0 Olfr39-202ENSMUST00000212983 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Shcbp1lQ3TTP0 Gm28322-201ENSMUST00000185627 1475 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Shcbp1lQ3TTP0 F830016B08Rik-201ENSMUST00000171297 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Shcbp1lQ3TTP0 Vmn1r90-206ENSMUST00000227566 6901 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Shcbp1lQ3TTP0 Ncoa4-201ENSMUST00000111994 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Shcbp1lQ3TTP0 Gm7108-201ENSMUST00000118038 3407 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Shcbp1lQ3TTP0 Olfr1056-202ENSMUST00000216547 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Shcbp1lQ3TTP0 Gm16751-201ENSMUST00000142212 1685 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Shcbp1lQ3TTP0 Cyp3a16-201ENSMUST00000031633 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Shcbp1lQ3TTP0 Vmn1r36-201ENSMUST00000226142 1770 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Shcbp1lQ3TTP0 Gm31218-202ENSMUST00000221428 1823 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Shcbp1lQ3TTP0 Olfr373-202ENSMUST00000213940 4145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Shcbp1lQ3TTP0 Gm6125-201ENSMUST00000217983 3472 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Shcbp1lQ3TTP0 Cyp2j6-201ENSMUST00000030303 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Shcbp1lQ3TTP0 Vmn2r44-201ENSMUST00000166499 3660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Shcbp1lQ3TTP0 Ipo5-201ENSMUST00000032898 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Shcbp1lQ3TTP0 Xlr4d-ps-201ENSMUST00000118894 646 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Shcbp1lQ3TTP0 Vmn1r-ps132-201ENSMUST00000120434 892 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Shcbp1lQ3TTP0 Gm14515-201ENSMUST00000121327 216 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Shcbp1lQ3TTP0 Gm12488-201ENSMUST00000122449 499 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.6 ms