Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 4930405D11Rik-201ENSMUST00000132218 568 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm13599-201ENSMUST00000134476 678 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm12343-201ENSMUST00000138817 414 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 1700095A21Rik-201ENSMUST00000145269 1069 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm12301-201ENSMUST00000152963 523 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Sox5os3-202ENSMUST00000154167 765 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm25966-201ENSMUST00000157169 117 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm23441-201ENSMUST00000157268 127 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm25445-201ENSMUST00000158996 299 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Vmn1r122-201ENSMUST00000164409 918 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Vmn1r159-201ENSMUST00000167871 918 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Vmn1r128-201ENSMUST00000169165 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Vmn2r-ps64-201ENSMUST00000173690 523 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm20401-201ENSMUST00000173717 212 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm20523-201ENSMUST00000174340 1124 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Mir3097-201ENSMUST00000175356 67 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm27044-201ENSMUST00000183033 796 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm28011-201ENSMUST00000184097 175 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm27208-201ENSMUST00000184323 604 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm29124-201ENSMUST00000186576 452 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Rpap3-ps1-201ENSMUST00000190928 454 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm38131-201ENSMUST00000192449 430 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm34716-201ENSMUST00000194060 621 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm37341-201ENSMUST00000194680 371 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm37386-201ENSMUST00000194755 72 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm30353-202ENSMUST00000195486 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Mir6906-201ENSMUST00000198998 58 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm6702-201ENSMUST00000208496 471 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 CT033754.1-201ENSMUST00000216941 531 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 AC138290.1-201ENSMUST00000219242 820 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm5457-201ENSMUST00000022260 333 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 CU062626.1-201ENSMUST00000225248 505 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 CT030194.2-201ENSMUST00000225752 379 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Pate4-201ENSMUST00000034610 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Prl8a1-201ENSMUST00000006664 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Magea6-201ENSMUST00000076986 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Olfr777-201ENSMUST00000080313 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Mir99a-201ENSMUST00000083596 65 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm23502-201ENSMUST00000083902 145 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Olfr1181-201ENSMUST00000099823 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Slc6a15-201ENSMUST00000074204 3607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Sycp2-201ENSMUST00000081134 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Nat2-201ENSMUST00000093470 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Zfp119b-202ENSMUST00000189452 2078 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm38259-201ENSMUST00000194602 3534 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Olfr1443-201ENSMUST00000049724 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Dnah3-204ENSMUST00000209154 12265 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Vmn1r200-204ENSMUST00000227326 5449 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Rbm46os-201ENSMUST00000131274 3261 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm38307-201ENSMUST00000195630 1840 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Olfr362-202ENSMUST00000213817 4059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm15581-201ENSMUST00000131334 5640 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Olfr1130-201ENSMUST00000213103 2643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Zfp976-203ENSMUST00000187616 1908 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm36936-201ENSMUST00000194508 2749 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm37244-201ENSMUST00000191748 1981 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Angel2-201ENSMUST00000027947 3562 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm42540-201ENSMUST00000200319 2008 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Ccdc144b-203ENSMUST00000200469 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Igkv5-37-201ENSMUST00000103372 359 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm11105-201ENSMUST00000112781 478 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm15225-201ENSMUST00000120449 1017 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm12372-201ENSMUST00000121654 768 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm16135-201ENSMUST00000129470 568 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
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Sh3bp1P55194 Tmem258-204ENSMUST00000166412 447 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
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Sh3bp1P55194 Gm26665-201ENSMUST00000181378 839 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Snhg14-205ENSMUST00000186345 456 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
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Sh3bp1P55194 Gm32950-201ENSMUST00000193336 232 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm37719-201ENSMUST00000194615 292 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm43467-201ENSMUST00000197441 437 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm43825-201ENSMUST00000199650 734 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm19761-201ENSMUST00000205372 391 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm31510-202ENSMUST00000206795 239 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm45750-201ENSMUST00000211966 354 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm39336-201ENSMUST00000214933 260 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 AC171204.1-201ENSMUST00000215867 975 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 AC158633.1-201ENSMUST00000219892 649 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 AC138330.1-201ENSMUST00000220690 1127 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm26861-206ENSMUST00000222633 1039 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 AC116724.1-201ENSMUST00000227900 972 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 CT009600.1-201ENSMUST00000228771 337 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Vmn1r47-201ENSMUST00000074881 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm13078-201ENSMUST00000078695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm23624-201ENSMUST00000082463 321 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Gm23737-201ENSMUST00000082547 159 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Olfr263-201ENSMUST00000096006 1087 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Olfr1217-201ENSMUST00000099799 1105 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Olfr741-202ENSMUST00000205518 3406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Olfr1195-202ENSMUST00000213545 2585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Olfr110-202ENSMUST00000216472 1721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Sh3bp1P55194 Tmem67-201ENSMUST00000050686 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Sh3bp1P55194 B830012L14Rik-201ENSMUST00000182785 4505 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
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