Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Mir6412-201ENSMUST00000184477 97 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
PtprmP28828 Gm44234-201ENSMUST00000204246 900 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
PtprmP28828 Tpbpb-203ENSMUST00000223978 991 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PtprmP28828 Gm14393-201ENSMUST00000072895 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PtprmP28828 Trhr-201ENSMUST00000038856 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
PtprmP28828 Gria4-204ENSMUST00000212533 5207 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
PtprmP28828 Gm37914-201ENSMUST00000195317 2679 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
PtprmP28828 Trpm3-202ENSMUST00000074770 6710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
PtprmP28828 Trpm3-203ENSMUST00000087576 6740 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
PtprmP28828 Ccdc7a-205ENSMUST00000214889 5544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PtprmP28828 Kcnj16-202ENSMUST00000106636 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
PtprmP28828 Crtam-204ENSMUST00000188848 5001 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
PtprmP28828 Kcnmb2-203ENSMUST00000178668 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PtprmP28828 Cd44-203ENSMUST00000099673 2848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
PtprmP28828 Psg28-201ENSMUST00000019291 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
PtprmP28828 Heph-202ENSMUST00000079322 3904 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
PtprmP28828 Gdap10-201ENSMUST00000180613 5003 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
PtprmP28828 Gm13367-201ENSMUST00000119955 796 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
PtprmP28828 Gm13363-201ENSMUST00000122008 522 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
PtprmP28828 Gm11506-201ENSMUST00000122414 470 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
PtprmP28828 1700073E17Rik-202ENSMUST00000146858 382 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
PtprmP28828 Gm21885-202ENSMUST00000208510 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PtprmP28828 CT025617.1-201ENSMUST00000216487 725 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PtprmP28828 Olfr684-201ENSMUST00000060893 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PtprmP28828 F13a1-201ENSMUST00000037491 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
PtprmP28828 Gm17167-201ENSMUST00000169242 5054 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
PtprmP28828 Gm43488-201ENSMUST00000198874 2504 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PtprmP28828 Ttc33-202ENSMUST00000081640 1583 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PtprmP28828 Slc14a1-201ENSMUST00000091813 3665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PtprmP28828 Ablim1-201ENSMUST00000079360 7152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PtprmP28828 1700011H14Rik-205ENSMUST00000228936 3444 ntAPPRIS P2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PtprmP28828 Ktn1-203ENSMUST00000185940 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PtprmP28828 Ktn1-208ENSMUST00000187039 3875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PtprmP28828 Sorbs2os-201ENSMUST00000135116 2474 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PtprmP28828 Adamts12-201ENSMUST00000061318 8579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PtprmP28828 AC120375.1-201ENSMUST00000227034 3612 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PtprmP28828 Mgam2-ps-201ENSMUST00000195870 3745 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PtprmP28828 Olfr104-ps-201ENSMUST00000178766 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PtprmP28828 AL606496.1-201ENSMUST00000220673 4472 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PtprmP28828 Igkv14-111-201ENSMUST00000103320 368 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PtprmP28828 Gm25420-201ENSMUST00000104216 127 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PtprmP28828 Nlrp4a-202ENSMUST00000119386 3215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PtprmP28828 Gm11484-201ENSMUST00000119808 338 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PtprmP28828 Gm13220-201ENSMUST00000121535 508 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PtprmP28828 Rpl31-ps18-201ENSMUST00000180885 377 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PtprmP28828 Gm44474-201ENSMUST00000196525 127 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PtprmP28828 Gm33626-201ENSMUST00000206790 828 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PtprmP28828 Olfr224-202ENSMUST00000215322 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PtprmP28828 Robo2-203ENSMUST00000117785 8124 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PtprmP28828 Gm44901-201ENSMUST00000208157 3977 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PtprmP28828 Plch1-213ENSMUST00000177143 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PtprmP28828 Dleu2-202ENSMUST00000180917 3544 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
PtprmP28828 Fanci-201ENSMUST00000036865 4645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PtprmP28828 Gabrp-201ENSMUST00000020366 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
PtprmP28828 Amer1-201ENSMUST00000084535 8496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
PtprmP28828 D630030B08Rik-201ENSMUST00000202983 3479 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PtprmP28828 Asap1-210ENSMUST00000176384 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
PtprmP28828 Spag5-201ENSMUST00000045026 3887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
PtprmP28828 Plch1-203ENSMUST00000084105 6245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
PtprmP28828 Efcab2-201ENSMUST00000027775 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
PtprmP28828 Clasp1-202ENSMUST00000070989 7767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PtprmP28828 Gm12994-201ENSMUST00000119601 447 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PtprmP28828 1700003C15Rik-201ENSMUST00000185360 1224 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
PtprmP28828 Gm28747-201ENSMUST00000185366 571 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PtprmP28828 Snhg14-202ENSMUST00000185693 734 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PtprmP28828 Gm7299-201ENSMUST00000194441 581 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PtprmP28828 Chaer1-201ENSMUST00000201649 651 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PtprmP28828 Gm18016-201ENSMUST00000216119 801 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PtprmP28828 Gm10061-201ENSMUST00000073111 465 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PtprmP28828 Toporsl-202ENSMUST00000107671 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
PtprmP28828 Pax6os1-202ENSMUST00000149133 1464 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
PtprmP28828 Spta1-201ENSMUST00000027817 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
PtprmP28828 AC164567.3-201ENSMUST00000217743 2869 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PtprmP28828 Vmn1r86-202ENSMUST00000226604 6378 ntAPPRIS P2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PtprmP28828 Gm37077-201ENSMUST00000195723 3691 ntBASIC7.34□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Vmn1r39-201ENSMUST00000226217 2258 ntAPPRIS P2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Vmn1r39-204ENSMUST00000227555 2297 ntAPPRIS P2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Vmn1r39-205ENSMUST00000228008 2283 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Olfr472-203ENSMUST00000216937 5392 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Olfr976-201ENSMUST00000169307 2813 ntAPPRIS P2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Psd3-214ENSMUST00000212960 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Pramef6-202ENSMUST00000105767 1967 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Nlrp10-201ENSMUST00000055745 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Etl4-209ENSMUST00000114627 7413 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Ptprz1-204ENSMUST00000202102 4947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Olfr54-202ENSMUST00000215409 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Gm26075-201ENSMUST00000104062 121 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Gm15752-201ENSMUST00000117427 394 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Gm6071-201ENSMUST00000119561 440 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Gm1866-201ENSMUST00000120701 477 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Gm15533-201ENSMUST00000126205 465 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Olfr405-ps1-202ENSMUST00000127098 711 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Gm12707-201ENSMUST00000155789 489 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PtprmP28828 AC166056.1-201ENSMUST00000223139 441 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PtprmP28828 AC154283.1-201ENSMUST00000228417 389 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Olfr168-201ENSMUST00000078554 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Mir20a-201ENSMUST00000083508 107 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Gm14324-201ENSMUST00000121358 3051 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Ipo5-201ENSMUST00000032898 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
PtprmP28828 Dusp16-204ENSMUST00000149776 3305 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
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