Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Olfr1250-203ENSMUST00000215730 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
RxraP28700 Vmn2r60-201ENSMUST00000166447 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm12641-201ENSMUST00000117874 985 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm14106-201ENSMUST00000119382 438 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm11484-201ENSMUST00000119808 338 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm14725-201ENSMUST00000120324 828 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
RxraP28700 Atf1-ps-201ENSMUST00000120608 810 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm3835-201ENSMUST00000120752 403 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm14368-201ENSMUST00000145305 415 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm11339-201ENSMUST00000154766 490 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm22158-201ENSMUST00000158411 126 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm15995-201ENSMUST00000159897 574 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm9294-201ENSMUST00000165198 789 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
RxraP28700 1700091H14Rik-201ENSMUST00000167772 590 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
RxraP28700 Ctla2b-202ENSMUST00000171347 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
RxraP28700 5730522E02Rik-208ENSMUST00000179180 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm28747-201ENSMUST00000185366 571 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm29534-201ENSMUST00000187328 382 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
RxraP28700 1700064J06Rik-201ENSMUST00000187551 386 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm28526-201ENSMUST00000187731 419 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm21654-201ENSMUST00000188086 691 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
RxraP28700 4930434B07Rik-201ENSMUST00000190254 1020 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm38185-201ENSMUST00000193195 694 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm18009-201ENSMUST00000203239 1016 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm34549-202ENSMUST00000207356 970 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm45525-201ENSMUST00000210800 389 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
RxraP28700 AL772397.1-201ENSMUST00000216707 606 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
RxraP28700 AC117797.1-201ENSMUST00000223977 695 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
RxraP28700 AC156016.5-201ENSMUST00000228742 355 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
RxraP28700 1700111E14Rik-201ENSMUST00000031863 908 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
RxraP28700 4930567H17Rik-201ENSMUST00000092405 840 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
RxraP28700 Fpr-rs7-201ENSMUST00000095637 1017 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
RxraP28700 Olfr1016-201ENSMUST00000099915 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
RxraP28700 C87977-203ENSMUST00000105755 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
RxraP28700 Gm14643-201ENSMUST00000144412 1848 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
RxraP28700 Vmn1r235-201ENSMUST00000060603 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
RxraP28700 Zkscan8-204ENSMUST00000224362 6954 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
RxraP28700 Zfp11-201ENSMUST00000049778 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
RxraP28700 Olfr963-202ENSMUST00000215649 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
RxraP28700 Rbm46-202ENSMUST00000182637 2058 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm3978-201ENSMUST00000163406 2512 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
RxraP28700 Vmn1r189-202ENSMUST00000227357 3245 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
RxraP28700 Olfr1499-202ENSMUST00000216659 1834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm14857-201ENSMUST00000117862 3185 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
RxraP28700 Adgb-205ENSMUST00000179956 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
RxraP28700 Samt2-201ENSMUST00000101137 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
RxraP28700 Pifo-201ENSMUST00000010280 956 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
RxraP28700 Trbv12-2-201ENSMUST00000103269 385 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
RxraP28700 Mup19-202ENSMUST00000107477 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
RxraP28700 Smim8-202ENSMUST00000108131 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm14772-201ENSMUST00000116562 514 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm14769-201ENSMUST00000118590 432 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm7079-201ENSMUST00000119726 171 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
RxraP28700 Olfr1376-ps1-201ENSMUST00000121306 955 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm25291-201ENSMUST00000122795 144 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm13470-201ENSMUST00000123911 421 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
RxraP28700 Prg4-206ENSMUST00000161611 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm18343-201ENSMUST00000172802 604 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm25246-201ENSMUST00000175476 69 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
RxraP28700 A730017C20Rik-206ENSMUST00000175830 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
RxraP28700 Rps12-ps21-201ENSMUST00000178172 402 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm26970-201ENSMUST00000182990 964 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
RxraP28700 Mir3473g-201ENSMUST00000183494 136 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm3428-202ENSMUST00000184555 416 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm29474-201ENSMUST00000187688 379 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
RxraP28700 1700104B16Rik-202ENSMUST00000187948 722 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm28396-201ENSMUST00000190309 379 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm28640-201ENSMUST00000190918 550 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm37609-201ENSMUST00000191778 678 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm9989-202ENSMUST00000193125 258 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm40263-201ENSMUST00000197468 580 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
RxraP28700 Oaz3-204ENSMUST00000199678 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm44360-201ENSMUST00000200081 82 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
RxraP28700 Zfp78-206ENSMUST00000208390 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm45524-201ENSMUST00000211374 1250 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
RxraP28700 AC157085.1-201ENSMUST00000216343 162 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
RxraP28700 AC164629.1-201ENSMUST00000220250 1113 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
RxraP28700 Lrrc72-203ENSMUST00000221155 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
RxraP28700 AC121947.1-201ENSMUST00000221755 1145 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm32526-201ENSMUST00000221878 981 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
RxraP28700 Olfr313-201ENSMUST00000082220 1074 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
RxraP28700 Mir143-201ENSMUST00000083511 63 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
RxraP28700 Fpr-rs4-201ENSMUST00000095651 972 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
RxraP28700 Cdc27-201ENSMUST00000093923 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm19514-201ENSMUST00000206856 4489 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm44829-201ENSMUST00000208008 3193 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
RxraP28700 Macf1-204ENSMUST00000106213 18957 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
RxraP28700 Agbl2-202ENSMUST00000037219 3462 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
RxraP28700 AC122357.3-201ENSMUST00000221260 2293 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
RxraP28700 Phc3-209ENSMUST00000168645 10976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm37221-201ENSMUST00000194472 3007 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
RxraP28700 Vmn2r-ps102-201ENSMUST00000222577 2203 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
RxraP28700 AC131720.1-201ENSMUST00000218629 2132 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
RxraP28700 Gm42479-201ENSMUST00000198654 1356 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
RxraP28700 Olfr690-202ENSMUST00000211006 2048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
RxraP28700 Vmn1r34-204ENSMUST00000226999 3048 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
RxraP28700 Ms4a13-202ENSMUST00000188464 1301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
RxraP28700 4930554C24Rik-203ENSMUST00000216802 1346 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
RxraP28700 Olfr1406-202ENSMUST00000201132 2952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
RxraP28700 Vmn2r-ps38-201ENSMUST00000173752 2573 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
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