Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Ighv1-75-201ENSMUST00000103544 373 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Ncald-202ENSMUST00000116445 858 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm13141-201ENSMUST00000117417 456 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Zfp286os-201ENSMUST00000128292 713 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm13629-202ENSMUST00000152740 645 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Sox5os3-202ENSMUST00000154167 765 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm22216-201ENSMUST00000157557 114 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm23276-201ENSMUST00000157913 138 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm3326-201ENSMUST00000164656 1043 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Arpp19-211ENSMUST00000170310 899 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Tshb-203ENSMUST00000172026 604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm24415-201ENSMUST00000180218 107 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm26654-201ENSMUST00000180455 256 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm27999-201ENSMUST00000183539 193 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm27158-201ENSMUST00000183813 238 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm27640-201ENSMUST00000184580 147 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 4930556G22Rik-201ENSMUST00000185689 741 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm28817-201ENSMUST00000187598 830 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm29470-201ENSMUST00000188007 696 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm7867-201ENSMUST00000189856 546 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm21088-201ENSMUST00000190875 316 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 4930449A18Rik-202ENSMUST00000192453 1200 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm37616-201ENSMUST00000193974 322 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Ighv1-29-201ENSMUST00000194116 342 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Ighv1-10-201ENSMUST00000194372 355 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm9632-201ENSMUST00000195934 643 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 5033403H07Rik-203ENSMUST00000198580 467 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm43892-201ENSMUST00000204373 265 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 1810049I09Rik-202ENSMUST00000206760 556 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm45530-201ENSMUST00000211658 225 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Noxred1-201ENSMUST00000021423 1101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Olfr1324-203ENSMUST00000219631 1152 ntAPPRIS P2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 AC120540.1-201ENSMUST00000221879 324 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 1700030L22Rik-202ENSMUST00000222223 704 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 A930023M06Rik-201ENSMUST00000223270 1093 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 AC163660.1-201ENSMUST00000223696 818 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Lgals2-201ENSMUST00000044584 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Cd200r3-201ENSMUST00000048479 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Olfr1324-201ENSMUST00000050044 1152 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Olfr161-201ENSMUST00000061541 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Faddos-201ENSMUST00000097928 1053 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Olfr1046-201ENSMUST00000099902 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Wars2-201ENSMUST00000004343 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm5157-201ENSMUST00000185914 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Cnpy1-205ENSMUST00000141601 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Rab3b-202ENSMUST00000106650 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Pde10a-208ENSMUST00000115724 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm15169-201ENSMUST00000126095 2753 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Mapk10-203ENSMUST00000112847 7196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Olfr1426-202ENSMUST00000208703 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 AC168056.3-201ENSMUST00000225395 2540 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Nav1-201ENSMUST00000040599 12767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Olfr615-203ENSMUST00000215673 3469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Olfr1386-202ENSMUST00000204518 2553 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gabpb2-204ENSMUST00000107209 8357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Usp14-202ENSMUST00000116669 2019 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Bbx-205ENSMUST00000114488 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 4930516K23Rik-201ENSMUST00000074064 6133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Sox5-214ENSMUST00000170367 7184 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Rc3h1-202ENSMUST00000161609 11006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Klhl13-203ENSMUST00000115316 3064 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 AL606496.1-201ENSMUST00000220673 4472 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Tgtp1-201ENSMUST00000068063 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm15813-201ENSMUST00000142286 2541 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 AC158981.2-201ENSMUST00000227565 1537 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Prokr2-204ENSMUST00000142766 3932 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Nexn-201ENSMUST00000046045 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Plch1-213ENSMUST00000177143 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm43369-201ENSMUST00000196373 1552 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Olfr60-205ENSMUST00000216027 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Vmn2r87-201ENSMUST00000164227 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 A130050O07Rik-201ENSMUST00000191963 3023 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Dclk1-202ENSMUST00000070418 7012 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Mbnl3-204ENSMUST00000136404 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm42645-201ENSMUST00000201573 1627 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 AC154597.1-201ENSMUST00000224095 2713 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Igkv3-5-201ENSMUST00000103400 382 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm25093-201ENSMUST00000103993 132 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm25565-201ENSMUST00000104605 105 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm23988-201ENSMUST00000117034 122 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm11813-201ENSMUST00000118586 291 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm14046-201ENSMUST00000119389 509 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm5793-201ENSMUST00000119393 630 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm14238-201ENSMUST00000120227 323 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm5166-201ENSMUST00000121332 573 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm9428-201ENSMUST00000127214 769 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 0610043K17Rik-202ENSMUST00000142581 372 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm11274-201ENSMUST00000146857 481 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm25395-201ENSMUST00000157343 272 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm24059-201ENSMUST00000157493 312 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm25989-201ENSMUST00000158761 133 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm2343-201ENSMUST00000161177 1042 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm17196-201ENSMUST00000164074 345 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Vmn1r-ps64-201ENSMUST00000173746 655 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Platr2-201ENSMUST00000180834 521 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Mir7212-201ENSMUST00000184098 61 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm28141-201ENSMUST00000186676 342 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm29156-201ENSMUST00000187764 499 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm28117-201ENSMUST00000188472 371 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm28080-201ENSMUST00000188552 722 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms