Protein–RNA interactions for Protein: P0C1T1

Hoxb2, Homeobox protein Hox-B2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb2P0C1T1 Cd200r3-202ENSMUST00000077178 767 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm26130-201ENSMUST00000083171 138 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm9573-201ENSMUST00000164502 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Olfr1220-203ENSMUST00000213288 4223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm27179-201ENSMUST00000184652 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Tm4sf1-205ENSMUST00000196979 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm29194-201ENSMUST00000189250 2167 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Ttf1-201ENSMUST00000100237 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 AC135119.1-202ENSMUST00000228435 2203 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Phc3-204ENSMUST00000108255 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Tcaf3-201ENSMUST00000069023 3110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Idh3a-201ENSMUST00000167866 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Olfr1045-202ENSMUST00000215763 2960 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Tgfbr1-203ENSMUST00000107725 1713 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Slc26a7-201ENSMUST00000042221 5165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Oxgr1-201ENSMUST00000058213 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm34294-201ENSMUST00000191912 4263 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Zfp266-201ENSMUST00000068296 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Prokr2-204ENSMUST00000142766 3932 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Fchsd2-201ENSMUST00000032931 4453 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Prokr2-201ENSMUST00000049997 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Ank3-230ENSMUST00000182795 3557 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm38278-201ENSMUST00000194715 1365 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 E330035G20Rik-202ENSMUST00000223323 3578 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm37127-201ENSMUST00000192924 3036 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Wdr64-203ENSMUST00000194087 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gja10-201ENSMUST00000056517 2117 ntAPPRIS P2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 C030017G13Rik-201ENSMUST00000202959 2331 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Vmn1r181-204ENSMUST00000227637 4587 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Cep192-201ENSMUST00000025425 8093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Csmd1-201ENSMUST00000082104 14182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Vmn2r-ps159-203ENSMUST00000189559 2560 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm37364-201ENSMUST00000192533 3920 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Olfr976-202ENSMUST00000213171 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Slc25a40-202ENSMUST00000170496 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm37945-201ENSMUST00000192536 4367 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm12887-201ENSMUST00000106265 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gstm6-203ENSMUST00000106683 745 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm16073-201ENSMUST00000116032 517 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Serpinb1-ps1-201ENSMUST00000118548 586 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm14106-201ENSMUST00000119382 438 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm5843-201ENSMUST00000121631 476 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm13029-201ENSMUST00000137283 594 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm13963-201ENSMUST00000143525 892 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm15485-201ENSMUST00000149095 258 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm23583-201ENSMUST00000158533 289 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm16298-201ENSMUST00000161107 420 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm23968-201ENSMUST00000175047 125 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Platr2-201ENSMUST00000180834 521 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm26863-201ENSMUST00000181144 624 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm3605-201ENSMUST00000185858 440 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Mrgprc4-ps-201ENSMUST00000186018 964 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Ly6c2-203ENSMUST00000188214 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm37758-201ENSMUST00000194275 629 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm43114-201ENSMUST00000198298 343 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm40348-201ENSMUST00000199648 452 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm32816-202ENSMUST00000206497 496 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm44923-201ENSMUST00000206673 85 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm45024-201ENSMUST00000208274 623 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Dynlrb2-202ENSMUST00000213007 527 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm5119-201ENSMUST00000215858 634 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 AC174082.1-201ENSMUST00000221106 307 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 AC154558.1-201ENSMUST00000222278 415 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 AC138329.1-201ENSMUST00000225040 471 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 AC125539.2-201ENSMUST00000228339 753 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Olfr1257-201ENSMUST00000060795 1016 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Olfr891-201ENSMUST00000062535 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Bcl2a1c-201ENSMUST00000066460 444 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Mup14-202ENSMUST00000075206 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Olfr739-201ENSMUST00000075261 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Olfr885-201ENSMUST00000081985 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Olfr477-201ENSMUST00000091605 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Olfr23-201ENSMUST00000092917 978 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Hyal5-202ENSMUST00000200968 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm38381-201ENSMUST00000193594 2275 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Sncaip-206ENSMUST00000178678 3724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Trappc13-203ENSMUST00000141557 3502 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm37595-201ENSMUST00000192668 1742 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Olfr119-201ENSMUST00000080483 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Slmap-204ENSMUST00000112330 3962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm28818-201ENSMUST00000187553 2989 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm28431-201ENSMUST00000185592 2166 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm28681-201ENSMUST00000187387 2166 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm44704-201ENSMUST00000208963 1990 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm4847-201ENSMUST00000046662 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Cnot2-203ENSMUST00000105267 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 BC035044-201ENSMUST00000160290 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm43335-201ENSMUST00000198299 3276 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Lhx9-203ENSMUST00000093486 4551 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm10143-202ENSMUST00000150038 3332 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Zfp433-201ENSMUST00000085664 1800 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Wdr12-201ENSMUST00000027173 10012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm35850-201ENSMUST00000210956 4653 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Gm37925-201ENSMUST00000195352 4255 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Lin54-204ENSMUST00000137750 4056 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Wfdc8-203ENSMUST00000109339 3227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Kmo-202ENSMUST00000097458 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 4930550L24Rik-202ENSMUST00000118305 1684 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Olfr396-ps1-201ENSMUST00000143750 1675 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxb2P0C1T1 Vmn2r88-201ENSMUST00000022438 2574 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.1 ms