Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Mageb6-ps-201ENSMUST00000126612 1032 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
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Ccl20O89093 Gm24295-201ENSMUST00000158298 131 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Gm22991-201ENSMUST00000178126 121 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Gm25754-201ENSMUST00000178653 121 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Gm22419-201ENSMUST00000178780 121 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Gm24802-201ENSMUST00000178897 121 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Gm25208-201ENSMUST00000178964 121 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Gm24567-201ENSMUST00000179294 121 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Gm23943-201ENSMUST00000179712 121 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Gm25228-201ENSMUST00000180121 121 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Gm23304-201ENSMUST00000180209 121 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Gm2042-202ENSMUST00000180706 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Gm26925-201ENSMUST00000182470 957 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Gm28468-201ENSMUST00000188536 615 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 2810429I04Rik-209ENSMUST00000188642 674 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Gm18969-201ENSMUST00000189423 730 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Gm38131-201ENSMUST00000192449 430 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Gm37223-206ENSMUST00000195070 699 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Gm9480-201ENSMUST00000198038 616 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Gm43928-201ENSMUST00000203737 409 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 AC138284.2-201ENSMUST00000213982 567 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 AC164624.1-201ENSMUST00000219148 1025 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 CT030184.2-201ENSMUST00000223064 263 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Lcn12-201ENSMUST00000028312 716 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Vmn1r233-201ENSMUST00000056339 960 ntAPPRIS P1 BASIC4.37□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Defb35-201ENSMUST00000076786 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Olfr1359-201ENSMUST00000077843 991 ntAPPRIS P1 BASIC4.37□□□□□ -1.71
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Ccl20O89093 Xlr5b-201ENSMUST00000097221 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Gcc2-208ENSMUST00000162860 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 AC154573.1-201ENSMUST00000225913 4659 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
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Ccl20O89093 Sdr16c6-201ENSMUST00000095151 1834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Pnpla8-201ENSMUST00000043082 13507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Zfp65-201ENSMUST00000073157 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Fbxw13-201ENSMUST00000061456 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
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Ccl20O89093 Lair1-201ENSMUST00000068865 6828 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
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Ccl20O89093 Cnot2-213ENSMUST00000169921 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
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Ccl20O89093 Ifi202b-201ENSMUST00000000266 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Ceacam5-201ENSMUST00000081907 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Olfr1270-205ENSMUST00000216354 4836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
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Ccl20O89093 Gm24170-201ENSMUST00000104124 133 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Gm11032-201ENSMUST00000109941 102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
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Ccl20O89093 Gm12074-201ENSMUST00000120189 219 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
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Ccl20O89093 Snhg1-207ENSMUST00000205909 709 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
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Ccl20O89093 CT025548.1-201ENSMUST00000227459 257 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Orm3-201ENSMUST00000006687 773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Defb18-201ENSMUST00000097818 258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Olfr357-202ENSMUST00000213218 5367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
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Ccl20O89093 Pde1a-204ENSMUST00000102653 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
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Ccl20O89093 Gm42397-205ENSMUST00000208692 1449 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
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Ccl20O89093 Pfpl-201ENSMUST00000168148 3918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Map3k19-201ENSMUST00000061512 3936 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 4933423P22Rik-201ENSMUST00000126219 4595 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Zfy1-201ENSMUST00000065545 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Tsga10-207ENSMUST00000155852 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Olfr18-203ENSMUST00000212943 2896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Vmn1r71-204ENSMUST00000227702 5034 ntAPPRIS P2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Rnf213-201ENSMUST00000093902 16716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
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