Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gm44110-201ENSMUST00000203871 475 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Gm44232-201ENSMUST00000204537 225 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Gm31749-201ENSMUST00000206873 598 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Lrrc72-201ENSMUST00000020853 660 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Olfr228-201ENSMUST00000216534 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Prl2c2-203ENSMUST00000221612 596 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 A930023M06Rik-201ENSMUST00000223270 1093 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 CT030194.2-201ENSMUST00000225752 379 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Vmn1r16-201ENSMUST00000227168 912 ntAPPRIS P2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 AC165437.1-201ENSMUST00000228640 536 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 1110012L19Rik-201ENSMUST00000053981 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Trappc1-201ENSMUST00000060956 628 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Bcl2l15-201ENSMUST00000062945 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Gmfg-201ENSMUST00000078845 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 n-R5s205-201ENSMUST00000083149 125 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Mpp5-201ENSMUST00000082024 5470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Cc2d2b-203ENSMUST00000207801 3730 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Olfr578-202ENSMUST00000215606 3665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Gm37529-201ENSMUST00000195618 4321 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Gm37056-201ENSMUST00000192141 1865 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Impg1-201ENSMUST00000085289 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Cyp2c70-201ENSMUST00000051846 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Homer1-202ENSMUST00000079086 4287 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Gm43319-201ENSMUST00000198036 2270 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Senp7-203ENSMUST00000089362 4825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 AC112972.2-201ENSMUST00000228702 2210 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Cftr-204ENSMUST00000129452 2835 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Zfp113-201ENSMUST00000049393 6470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 AC166344.3-203ENSMUST00000228117 1466 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 AC192616.2-201ENSMUST00000221482 3841 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Gm7919-201ENSMUST00000202043 1389 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Tyr-201ENSMUST00000004770 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Olfr1385-202ENSMUST00000214948 4412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Pramef8-202ENSMUST00000059790 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Cldn34b4-201ENSMUST00000101419 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Tmsb15b1-201ENSMUST00000113071 439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Cd200r3-204ENSMUST00000114612 731 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Gm13924-201ENSMUST00000119899 486 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Gm11805-201ENSMUST00000121238 600 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Gm23883-201ENSMUST00000122686 290 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Zfp783-203ENSMUST00000130463 537 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Gm14012-201ENSMUST00000136025 677 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 4933430M04Rik-201ENSMUST00000152726 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Gm7609-204ENSMUST00000161424 461 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Gm8358-201ENSMUST00000167222 555 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Rab11a-206ENSMUST00000169058 462 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Klrb1a-202ENSMUST00000171306 989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Cd200r3-210ENSMUST00000171779 1223 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Obox1-205ENSMUST00000173443 835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Obox2-204ENSMUST00000174305 834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Gm4831-201ENSMUST00000174626 594 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Mir6903-201ENSMUST00000183597 88 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Il6st-204ENSMUST00000183829 612 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Gm27541-201ENSMUST00000184078 122 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Gm29596-201ENSMUST00000185710 385 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Gm28652-201ENSMUST00000187008 599 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Scgb3a2-202ENSMUST00000187157 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Gm29474-201ENSMUST00000187688 379 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 1700111N16Rik-201ENSMUST00000188663 1133 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Gm40190-201ENSMUST00000196570 471 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 1700065J11Rik-201ENSMUST00000201560 424 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Gm17984-201ENSMUST00000205286 859 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Gm18205-201ENSMUST00000209215 841 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Olfr27-201ENSMUST00000214052 1076 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Gm7607-201ENSMUST00000214920 518 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 4933411E02Rik-201ENSMUST00000216779 1030 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Gm19256-201ENSMUST00000218550 231 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 AC138330.1-201ENSMUST00000220690 1127 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Gm6049-201ENSMUST00000222369 458 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 CT010575.2-201ENSMUST00000222876 496 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 AC131745.2-201ENSMUST00000225736 565 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Clec2d-201ENSMUST00000032260 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Cd200r3-201ENSMUST00000048479 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 C130073F10Rik-201ENSMUST00000051043 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Cd200r3-202ENSMUST00000077178 767 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Mir129-1-201ENSMUST00000083535 73 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Olfr1242-201ENSMUST00000099777 1053 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Olfr1160-201ENSMUST00000099839 960 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Enox2-201ENSMUST00000033437 3170 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Vmn2r112-201ENSMUST00000097381 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Nlrp5-203ENSMUST00000108441 3375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Sult1c1-201ENSMUST00000024738 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm14857-201ENSMUST00000117862 3185 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm5796-201ENSMUST00000096184 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Rgs2-202ENSMUST00000127206 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Ugt8a-203ENSMUST00000198610 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 4930435E12Rik-201ENSMUST00000122078 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm5141-201ENSMUST00000167516 1743 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Lcp2-201ENSMUST00000052413 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gab3-203ENSMUST00000114109 2093 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm42600-201ENSMUST00000202081 3588 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Clec2g-203ENSMUST00000142388 2404 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm20826-202ENSMUST00000185348 4605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Olfr738-203ENSMUST00000214853 2046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Vmn1r27-203ENSMUST00000228530 3115 ntAPPRIS P2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm11975-201ENSMUST00000118772 481 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Xlr3e-ps-201ENSMUST00000119644 682 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm7350-201ENSMUST00000120964 636 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Xlr3d-ps-201ENSMUST00000121687 658 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Grik3B1AS29 Gm13024-201ENSMUST00000121756 718 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.4 ms