Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

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Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm26085-201ENSMUST00000157900 116 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Aste1-207ENSMUST00000176940 1151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Gm5244-202ENSMUST00000189517 743 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 AC142273.1-201ENSMUST00000213723 673 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 AC153729.2-201ENSMUST00000215166 560 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Gm5750-201ENSMUST00000218711 801 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 1700112M02Rik-201ENSMUST00000221719 348 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 AC154527.3-201ENSMUST00000225519 989 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Gm24166-201ENSMUST00000082724 135 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Snora52-201ENSMUST00000082732 137 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Gm9077-201ENSMUST00000210657 2298 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Luzp1-201ENSMUST00000001116 7246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 AC131743.1-201ENSMUST00000222138 4024 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 CT025660.2-201ENSMUST00000217654 3539 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Slc44a1-205ENSMUST00000107651 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Zfp143-202ENSMUST00000169638 2914 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Ano5-202ENSMUST00000207044 3311 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Pramef6-202ENSMUST00000105767 1967 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 1500004A13Rik-203ENSMUST00000183966 3743 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Nxf2-203ENSMUST00000113189 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Olfr432-203ENSMUST00000213381 4533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Slco1c1-203ENSMUST00000203140 2771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Ktn1-209ENSMUST00000187262 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Gcnt3-201ENSMUST00000034751 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Acvr1c-202ENSMUST00000100085 4289 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Mug2-201ENSMUST00000081777 4579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r115-201ENSMUST00000168175 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 AC162467.3-201ENSMUST00000219716 2172 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Slc26a3-201ENSMUST00000001254 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Gm3985-201ENSMUST00000132101 2515 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Olfr733-203ENSMUST00000214756 3640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Aox4-201ENSMUST00000040442 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Trbv12-1-201ENSMUST00000103267 389 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Ighv5-9-1-201ENSMUST00000103452 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Gm23673-201ENSMUST00000157474 298 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Gm34583-202ENSMUST00000202537 451 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 AC155922.1-201ENSMUST00000220100 373 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 AC157515.1-201ENSMUST00000220953 450 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 AC154283.1-201ENSMUST00000228417 389 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 BC049715-201ENSMUST00000052702 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Defa26-201ENSMUST00000074343 372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Olfr552-201ENSMUST00000098223 954 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Gm18508-201ENSMUST00000215790 1642 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Gm37049-201ENSMUST00000194356 1983 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Shoc2-202ENSMUST00000169861 4065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Gm42531-201ENSMUST00000201648 4048 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Olfr132-202ENSMUST00000216804 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Ugt2b5-201ENSMUST00000067790 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Gm43283-201ENSMUST00000199138 2548 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Olfr1348-209ENSMUST00000213549 2714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Nlrp4a-201ENSMUST00000068767 4259 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Trpm3-202ENSMUST00000074770 6710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Trpm3-203ENSMUST00000087576 6740 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Asxl2-201ENSMUST00000092003 11934 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 4930533I22Rik-201ENSMUST00000176290 2564 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 AC154329.1-201ENSMUST00000224408 3129 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Cps1-201ENSMUST00000027144 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Cetn2-202ENSMUST00000114550 1124 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Gm15333-201ENSMUST00000118825 364 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Gm23171-201ENSMUST00000157159 264 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Gm24444-201ENSMUST00000157244 308 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Gm23906-201ENSMUST00000157573 128 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Gm23069-201ENSMUST00000158240 311 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Gm6632-201ENSMUST00000168425 954 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Pkib-209ENSMUST00000177325 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Gm27568-201ENSMUST00000184220 99 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Pinc-202ENSMUST00000190487 961 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
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Col5a3Q9JLI2 AC136146.1-201ENSMUST00000196180 91 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Gm45261-201ENSMUST00000211023 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
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Col5a3Q9JLI2 AC159809.1-201ENSMUST00000216235 520 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 CT030242.3-201ENSMUST00000221231 581 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Nfyc-202ENSMUST00000097906 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Rabgap1-203ENSMUST00000112920 4847 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Gm45183-201ENSMUST00000207937 1497 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 F630028O10Rik-201ENSMUST00000133125 2771 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Crb1-204ENSMUST00000198445 6135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Sspn-202ENSMUST00000111701 4512 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Psd3-201ENSMUST00000038959 11319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Unc13c-202ENSMUST00000184666 8796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Nsd2-202ENSMUST00000066854 6919 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Nlrp1b-204ENSMUST00000108516 4134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Gabrg2-203ENSMUST00000109290 2868 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Olfr131-203ENSMUST00000215940 1614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r12-202ENSMUST00000226866 6639 ntAPPRIS P2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Gm44026-201ENSMUST00000203985 2088 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Gm17101-201ENSMUST00000169520 1588 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Olfr15-202ENSMUST00000214238 6135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 AC103672.3-201ENSMUST00000227649 3243 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Slc14a1-201ENSMUST00000091813 3665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Olfr122-204ENSMUST00000217119 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Gm11911-201ENSMUST00000117938 1023 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Gm11196-201ENSMUST00000119052 395 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Gm14408-202ENSMUST00000126726 279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Magea9-ps-201ENSMUST00000140655 732 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Gm16321-201ENSMUST00000155184 574 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Gm25278-201ENSMUST00000157267 120 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Col5a3Q9JLI2 Magea9-ps-202ENSMUST00000167328 899 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms