Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm18186-201ENSMUST00000192239 1580 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 AC168274.1-201ENSMUST00000218657 1864 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Olfr147-202ENSMUST00000214648 5356 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Gm9700-201ENSMUST00000193786 1617 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Gm18163-201ENSMUST00000197877 1643 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Vmn1r71-202ENSMUST00000226874 5194 ntAPPRIS P2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 St18-213ENSMUST00000163727 5604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Vmn1r219-203ENSMUST00000227388 7948 ntAPPRIS P1 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Zfp62-202ENSMUST00000109197 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Gm9577-201ENSMUST00000174655 2620 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Olfr874-202ENSMUST00000216982 2632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Amd1-201ENSMUST00000099945 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Vmn1r21-201ENSMUST00000203310 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Trps1-202ENSMUST00000165201 9859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 B530045E10Rik-202ENSMUST00000189035 3138 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Serpinb5-202ENSMUST00000112729 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Zfp120-201ENSMUST00000089207 4127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Gm23750-201ENSMUST00000104222 132 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Kpna2-202ENSMUST00000106768 541 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Olfr637-ps1-201ENSMUST00000120386 471 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Gm7670-201ENSMUST00000121272 641 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Gm8061-201ENSMUST00000122380 350 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Gm16347-201ENSMUST00000131707 622 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Gm23964-201ENSMUST00000157966 107 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Gm9027-201ENSMUST00000165914 661 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Gm17268-201ENSMUST00000171515 66 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Vmn1r-ps45-201ENSMUST00000174106 955 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Gm20545-201ENSMUST00000174739 210 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Gm20528-202ENSMUST00000174821 802 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Pinc-202ENSMUST00000190487 961 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Gm42428-201ENSMUST00000198677 302 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Gm44307-201ENSMUST00000204466 764 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Gm2926-201ENSMUST00000205625 239 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 AC153954.2-201ENSMUST00000213811 287 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 AC122332.1-201ENSMUST00000214384 285 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 9530014B07Rik-201ENSMUST00000221882 744 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Olfr1341-201ENSMUST00000061215 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Ranbp3l-201ENSMUST00000053308 3017 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Gucy2f-201ENSMUST00000042530 8122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Ryr3-202ENSMUST00000091818 15410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Gm29112-201ENSMUST00000188962 3487 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Zscan4c-201ENSMUST00000131379 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Cyp2j5-201ENSMUST00000030299 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Gm45644-201ENSMUST00000210255 2740 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Olfr584-202ENSMUST00000214215 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Igkv4-71-201ENSMUST00000101325 288 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Gm12683-201ENSMUST00000117528 415 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Gm13771-201ENSMUST00000117988 238 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Gm14925-201ENSMUST00000120611 438 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Gm14233-201ENSMUST00000149576 439 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Gm24395-201ENSMUST00000158139 125 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Gm24175-201ENSMUST00000158931 129 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Atxn3-204ENSMUST00000160251 998 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Trav6-5-202ENSMUST00000183488 335 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Gm37882-201ENSMUST00000195254 196 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Gm33952-201ENSMUST00000197795 408 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Gm43033-201ENSMUST00000199682 425 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Gm44516-201ENSMUST00000208794 833 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 RMST_1.1-205ENSMUST00000218060 997 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Gm34719-201ENSMUST00000222231 382 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 AC129085.4-201ENSMUST00000224536 570 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 CT009600.1-201ENSMUST00000228771 337 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Tas2r109-201ENSMUST00000067539 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Prelid2-201ENSMUST00000070949 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Gm10061-201ENSMUST00000073111 465 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Rpl26-201ENSMUST00000073471 526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 n-R5s62-201ENSMUST00000082780 96 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Olfr33-201ENSMUST00000084817 957 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Vmn2r115-201ENSMUST00000168175 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Ccdc47Q9D024 Slc5a12-202ENSMUST00000111026 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Erbin-204ENSMUST00000169083 5435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Cdh17-201ENSMUST00000029871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Zfp353-ps-201ENSMUST00000107130 1650 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Cyp2j12-201ENSMUST00000097972 1675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Tsga10-207ENSMUST00000155852 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Vmn1r210-203ENSMUST00000226294 3500 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm43921-201ENSMUST00000204296 1792 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Piga-201ENSMUST00000033754 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Mcf2-203ENSMUST00000101531 3671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Far1-202ENSMUST00000067929 4935 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm24789-201ENSMUST00000104282 131 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm23910-201ENSMUST00000104597 132 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm17014-201ENSMUST00000120765 168 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm14957-201ENSMUST00000121069 817 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm14330-201ENSMUST00000155455 455 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm22596-201ENSMUST00000157601 316 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm24685-201ENSMUST00000157764 285 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm25861-201ENSMUST00000158251 109 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Znrf1-215ENSMUST00000174454 494 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm18802-201ENSMUST00000186270 888 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm9317-201ENSMUST00000197055 862 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm42542-201ENSMUST00000197978 268 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Gm2762-204ENSMUST00000201815 537 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 Olfr489-ps1-201ENSMUST00000210404 967 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 AC159379.1-201ENSMUST00000218192 620 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 AC162467.1-201ENSMUST00000220254 621 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 CT009754.4-201ENSMUST00000221430 565 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 CT010575.2-201ENSMUST00000222876 496 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 CT030182.2-201ENSMUST00000223569 620 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Ccdc47Q9D024 AC165953.1-201ENSMUST00000226386 357 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms