Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Gm25795-201ENSMUST00000104421 132 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Hps4Q99KG7 Olfr1079-202ENSMUST00000111582 2141 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hps4Q99KG7 Gm12386-201ENSMUST00000117380 688 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Hps4Q99KG7 Gm13114-201ENSMUST00000117605 106 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Hps4Q99KG7 Hspe1-ps4-201ENSMUST00000119538 286 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Hps4Q99KG7 Gm16445-201ENSMUST00000120399 714 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Hps4Q99KG7 Gm5646-201ENSMUST00000120568 714 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Hps4Q99KG7 Gm14766-201ENSMUST00000121689 367 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Hps4Q99KG7 Gm26349-201ENSMUST00000157530 130 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Hps4Q99KG7 Gm16557-201ENSMUST00000159182 191 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Hps4Q99KG7 Gm3727-201ENSMUST00000168458 995 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hps4Q99KG7 Gm22132-201ENSMUST00000175316 100 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Hps4Q99KG7 Gm25246-201ENSMUST00000175476 69 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Hps4Q99KG7 Gm15143-201ENSMUST00000178180 714 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Hps4Q99KG7 D630011A20Rik-201ENSMUST00000180858 500 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hps4Q99KG7 1810053B23Rik-201ENSMUST00000185242 634 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hps4Q99KG7 Gm28885-201ENSMUST00000185615 563 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Hps4Q99KG7 Rpl23a-ps9-201ENSMUST00000188369 463 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Hps4Q99KG7 Gm29000-207ENSMUST00000190152 1160 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hps4Q99KG7 Gm18291-201ENSMUST00000190791 301 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Hps4Q99KG7 Rpl23a-ps11-201ENSMUST00000191583 463 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Hps4Q99KG7 Csn1s2b-204ENSMUST00000197301 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hps4Q99KG7 Gm45189-201ENSMUST00000208567 363 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Hps4Q99KG7 Gm33312-201ENSMUST00000222443 332 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Hps4Q99KG7 CT009713.9-201ENSMUST00000223604 389 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Hps4Q99KG7 AV026068-216ENSMUST00000223874 328 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Hps4Q99KG7 AC165106.1-201ENSMUST00000227580 408 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Hps4Q99KG7 Gm8256-203ENSMUST00000228692 591 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Hps4Q99KG7 Gm24268-201ENSMUST00000082990 110 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Hps4Q99KG7 Gramd1b-204ENSMUST00000121357 7334 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hps4Q99KG7 Pole-201ENSMUST00000007296 7163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hps4Q99KG7 Poln-201ENSMUST00000042954 2897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hps4Q99KG7 Gm8126-201ENSMUST00000169587 1764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hps4Q99KG7 Poln-205ENSMUST00000202409 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hps4Q99KG7 AC155941.4-201ENSMUST00000219731 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hps4Q99KG7 Cd160-202ENSMUST00000107074 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hps4Q99KG7 Kat6b-ps2-201ENSMUST00000188339 1600 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Hps4Q99KG7 Mat2a-202ENSMUST00000205335 3387 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hps4Q99KG7 Gm43549-201ENSMUST00000198856 2661 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hps4Q99KG7 Gm5141-201ENSMUST00000167516 1743 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hps4Q99KG7 Hnrnpc-207ENSMUST00000227536 1301 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hps4Q99KG7 A230028O05Rik-201ENSMUST00000181655 2793 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hps4Q99KG7 Dennd6a-204ENSMUST00000224248 2775 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hps4Q99KG7 Rlim-201ENSMUST00000070705 7429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hps4Q99KG7 Dab2-201ENSMUST00000078019 3793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hps4Q99KG7 Vangl1-202ENSMUST00000159388 3207 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hps4Q99KG7 Tcrg-V7-201ENSMUST00000103553 368 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hps4Q99KG7 Gm22019-201ENSMUST00000104359 96 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hps4Q99KG7 Prl-202ENSMUST00000110369 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hps4Q99KG7 Gm14307-201ENSMUST00000118930 291 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hps4Q99KG7 Gm12837-201ENSMUST00000120131 373 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hps4Q99KG7 Gm14574-201ENSMUST00000120644 279 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hps4Q99KG7 Gm14986-201ENSMUST00000121262 1002 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hps4Q99KG7 Gm14297-201ENSMUST00000129110 291 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hps4Q99KG7 R3hcc1l-202ENSMUST00000160107 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hps4Q99KG7 Runx2os3-201ENSMUST00000160203 738 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hps4Q99KG7 Klrc1-204ENSMUST00000169545 676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hps4Q99KG7 Gm17054-201ENSMUST00000169811 259 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hps4Q99KG7 Gm20647-201ENSMUST00000176396 857 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hps4Q99KG7 Gm8221-201ENSMUST00000178052 564 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hps4Q99KG7 Rian-203ENSMUST00000181527 989 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hps4Q99KG7 1110008L16Rik-203ENSMUST00000183654 943 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hps4Q99KG7 Gm8241-201ENSMUST00000189286 816 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hps4Q99KG7 Gm3933-201ENSMUST00000195391 439 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hps4Q99KG7 Gm7626-201ENSMUST00000195801 353 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hps4Q99KG7 Gm42465-201ENSMUST00000197036 492 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hps4Q99KG7 Gm42865-201ENSMUST00000197981 613 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hps4Q99KG7 Med7-201ENSMUST00000020665 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hps4Q99KG7 Gm18467-201ENSMUST00000208805 434 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hps4Q99KG7 Gm7624-201ENSMUST00000209702 435 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hps4Q99KG7 Olfr1324-203ENSMUST00000219631 1152 ntAPPRIS P2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hps4Q99KG7 AC159263.3-201ENSMUST00000223434 460 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hps4Q99KG7 AC154481.1-201ENSMUST00000223532 331 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hps4Q99KG7 AC166574.3-201ENSMUST00000226725 367 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hps4Q99KG7 AC120375.2-202ENSMUST00000228722 397 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hps4Q99KG7 Pmch-201ENSMUST00000048621 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hps4Q99KG7 Olfr1324-201ENSMUST00000050044 1152 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hps4Q99KG7 Olfr103-201ENSMUST00000058826 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hps4Q99KG7 Olfr186-201ENSMUST00000062380 1005 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hps4Q99KG7 Mmp12-202ENSMUST00000065079 1185 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hps4Q99KG7 Gm26111-201ENSMUST00000083969 106 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hps4Q99KG7 Olfr1000-201ENSMUST00000099921 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hps4Q99KG7 Mkks-201ENSMUST00000028730 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hps4Q99KG7 Cyld-202ENSMUST00000098519 7954 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hps4Q99KG7 Gm7133-201ENSMUST00000187797 2039 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hps4Q99KG7 Ctage5-217ENSMUST00000176892 2784 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hps4Q99KG7 Tcf7l2-209ENSMUST00000111656 3629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hps4Q99KG7 Slc22a8-202ENSMUST00000170817 3398 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hps4Q99KG7 Gm10256-201ENSMUST00000179404 1358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hps4Q99KG7 Gm38081-201ENSMUST00000192680 1645 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hps4Q99KG7 Fgf10-201ENSMUST00000022246 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hps4Q99KG7 Vmn1r44-204ENSMUST00000226171 1877 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hps4Q99KG7 Ceacam1-203ENSMUST00000098669 2873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hps4Q99KG7 Ccr2-203ENSMUST00000168841 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hps4Q99KG7 Pde7a-201ENSMUST00000091314 4454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hps4Q99KG7 Zfp473-204ENSMUST00000120798 3559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hps4Q99KG7 Gm6757-201ENSMUST00000189810 1706 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hps4Q99KG7 Gm28278-201ENSMUST00000185603 1499 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hps4Q99KG7 4921524L21Rik-201ENSMUST00000044829 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hps4Q99KG7 Nexn-201ENSMUST00000046045 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
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