Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Gm35940-201ENSMUST00000213355 4797 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Fam20bQ8VCS3 Psg-ps1-202ENSMUST00000206181 1943 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Fam20bQ8VCS3 Agbl2-208ENSMUST00000170320 4507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Fam20bQ8VCS3 Olfr145-201ENSMUST00000086062 6796 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Fam20bQ8VCS3 AC115910.1-201ENSMUST00000221188 4275 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Fam20bQ8VCS3 Vmn1r31-205ENSMUST00000228586 2115 ntAPPRIS P2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Fam20bQ8VCS3 Olfr536-201ENSMUST00000064392 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Fam20bQ8VCS3 Lrp2bp-203ENSMUST00000110381 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Fam20bQ8VCS3 Olfr1262-202ENSMUST00000111508 6068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Fam20bQ8VCS3 Dcdc2c-204ENSMUST00000189735 1434 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Fam20bQ8VCS3 Gm13119-201ENSMUST00000094526 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Fam20bQ8VCS3 Ttc37-205ENSMUST00000224386 6976 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Fam20bQ8VCS3 Olfr50-203ENSMUST00000217041 1507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Fam20bQ8VCS3 Lama2-207ENSMUST00000189575 4244 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Fam20bQ8VCS3 Gm43637-201ENSMUST00000202206 2926 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Fam20bQ8VCS3 Dusp16-204ENSMUST00000149776 3305 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Fam20bQ8VCS3 Tmprss11a-201ENSMUST00000101073 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Fam20bQ8VCS3 Igkv5-37-201ENSMUST00000103372 359 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Fam20bQ8VCS3 Gm25785-201ENSMUST00000104129 125 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Fam20bQ8VCS3 Olfr26-201ENSMUST00000104874 931 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Fam20bQ8VCS3 Cd47-202ENSMUST00000114496 867 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Fam20bQ8VCS3 Olfr595-ps1-201ENSMUST00000118180 954 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Fam20bQ8VCS3 H3f3c-201ENSMUST00000119459 411 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Fam20bQ8VCS3 Gm13751-201ENSMUST00000120280 752 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Fam20bQ8VCS3 Gm14383-201ENSMUST00000121637 386 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Fam20bQ8VCS3 Klra11-ps-201ENSMUST00000122033 810 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Fam20bQ8VCS3 Gm13837-201ENSMUST00000126326 337 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Fam20bQ8VCS3 AI847159-202ENSMUST00000138431 952 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Fam20bQ8VCS3 Med9os-202ENSMUST00000139794 446 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Fam20bQ8VCS3 4933407I08Rik-201ENSMUST00000151215 1294 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Fam20bQ8VCS3 Sox5os2-201ENSMUST00000156443 627 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Fam20bQ8VCS3 Gm6133-201ENSMUST00000164064 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Fam20bQ8VCS3 Gm17085-201ENSMUST00000165425 502 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Fam20bQ8VCS3 Gm18560-201ENSMUST00000173463 1123 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Fam20bQ8VCS3 Vmn2r-ps62-201ENSMUST00000174119 616 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Fam20bQ8VCS3 Gm24369-201ENSMUST00000175387 96 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Fam20bQ8VCS3 Gm20713-201ENSMUST00000176344 435 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Fam20bQ8VCS3 Nrg3os-201ENSMUST00000177141 927 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Fam20bQ8VCS3 Gm25244-201ENSMUST00000178089 132 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Fam20bQ8VCS3 Gm29337-201ENSMUST00000185425 284 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Fam20bQ8VCS3 AV026068-209ENSMUST00000189143 517 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Fam20bQ8VCS3 Gm17953-201ENSMUST00000192061 667 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Fam20bQ8VCS3 Gm38281-201ENSMUST00000192301 315 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Fam20bQ8VCS3 Gm37979-201ENSMUST00000193065 712 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Fam20bQ8VCS3 Gm7626-201ENSMUST00000195801 353 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Fam20bQ8VCS3 Csn2-202ENSMUST00000196163 722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Fam20bQ8VCS3 Gm9236-201ENSMUST00000196892 587 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Fam20bQ8VCS3 Gm43241-201ENSMUST00000198375 364 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Fam20bQ8VCS3 Gm42625-201ENSMUST00000198611 922 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Fam20bQ8VCS3 Gm36696-201ENSMUST00000205418 438 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Fam20bQ8VCS3 Gm7351-201ENSMUST00000210745 580 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Fam20bQ8VCS3 Gm4032-201ENSMUST00000210886 487 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Fam20bQ8VCS3 Gm7639-201ENSMUST00000212608 484 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Fam20bQ8VCS3 Tecr-214ENSMUST00000212990 648 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Fam20bQ8VCS3 AC117688.1-201ENSMUST00000213142 832 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Fam20bQ8VCS3 AC154295.1-201ENSMUST00000217210 621 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Fam20bQ8VCS3 AC157017.1-201ENSMUST00000220148 364 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Fam20bQ8VCS3 Gm30738-201ENSMUST00000221346 502 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Fam20bQ8VCS3 AC159239.1-201ENSMUST00000221767 603 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Fam20bQ8VCS3 AC158750.1-201ENSMUST00000226163 634 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Fam20bQ8VCS3 AC154738.7-201ENSMUST00000228606 579 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Fam20bQ8VCS3 Uqcrh-ps1-201ENSMUST00000038391 270 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Fam20bQ8VCS3 Cd160-201ENSMUST00000047702 1121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Fam20bQ8VCS3 Olfr309-201ENSMUST00000055690 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Fam20bQ8VCS3 Gm22977-201ENSMUST00000082615 107 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Fam20bQ8VCS3 Atp2c1-202ENSMUST00000085133 4665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Fam20bQ8VCS3 1700034E13Rik-201ENSMUST00000091904 439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Fam20bQ8VCS3 Pcdh9-207ENSMUST00000195376 5096 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Fam20bQ8VCS3 Kif18a-201ENSMUST00000028527 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Fam20bQ8VCS3 Mnat1-202ENSMUST00000187549 3688 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Fam20bQ8VCS3 Gm3629-201ENSMUST00000171706 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Fam20bQ8VCS3 Gm44209-201ENSMUST00000204556 4153 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Fam20bQ8VCS3 CT009480.3-201ENSMUST00000224051 3032 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Fam20bQ8VCS3 Ehf-201ENSMUST00000090475 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Fam20bQ8VCS3 Tlr1-201ENSMUST00000059349 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Fam20bQ8VCS3 Vmn1r201-203ENSMUST00000226965 4741 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Fam20bQ8VCS3 Olfr535-204ENSMUST00000214296 5120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Fam20bQ8VCS3 Olfr1494-202ENSMUST00000207836 2100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Fam20bQ8VCS3 Gm34069-201ENSMUST00000214060 2441 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Fam20bQ8VCS3 C1s1-203ENSMUST00000160505 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Fam20bQ8VCS3 Ttll6-202ENSMUST00000167258 3205 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Fam20bQ8VCS3 Gm33680-203ENSMUST00000219610 4117 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Fam20bQ8VCS3 Spef2-201ENSMUST00000041840 4247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Fam20bQ8VCS3 Chd9-202ENSMUST00000109614 11565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Fam20bQ8VCS3 Gm6866-202ENSMUST00000206653 3081 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Fam20bQ8VCS3 Gm9968-201ENSMUST00000147504 2990 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Fam20bQ8VCS3 Ythdc1-201ENSMUST00000038384 2960 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Fam20bQ8VCS3 Gm44584-201ENSMUST00000208395 2880 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Fam20bQ8VCS3 2900079G21Rik-204ENSMUST00000163302 2764 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Fam20bQ8VCS3 Scn9a-206ENSMUST00000164384 7530 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Fam20bQ8VCS3 Cdk14-202ENSMUST00000115450 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Fam20bQ8VCS3 Gm30849-201ENSMUST00000214503 1379 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Fam20bQ8VCS3 Olfr612-201ENSMUST00000104879 972 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Fam20bQ8VCS3 Defb45-201ENSMUST00000109834 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Fam20bQ8VCS3 Gm12433-201ENSMUST00000119659 255 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Fam20bQ8VCS3 Gm13121-201ENSMUST00000120637 632 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Fam20bQ8VCS3 Gm12639-201ENSMUST00000121400 493 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Fam20bQ8VCS3 1700057H15Rik-201ENSMUST00000127913 595 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Fam20bQ8VCS3 Junos-206ENSMUST00000133772 635 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Fam20bQ8VCS3 Gm12279-201ENSMUST00000142533 294 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 144.9 ms