Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Cyp2c70-201ENSMUST00000051846 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr780-202ENSMUST00000215503 2910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Lrrtm2Q8BGA3 Vmn2r-ps102-201ENSMUST00000222577 2203 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr1238-203ENSMUST00000217237 5761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13648-201ENSMUST00000138361 1536 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Lrrtm2Q8BGA3 Tnpo1-201ENSMUST00000109399 8445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp607a-203ENSMUST00000205715 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Lrrtm2Q8BGA3 Abcc9-203ENSMUST00000100827 7306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Lrrtm2Q8BGA3 Txlng-202ENSMUST00000112314 3348 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Lrrtm2Q8BGA3 Nlrp9c-201ENSMUST00000041845 2631 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Lrrtm2Q8BGA3 Cpb2-201ENSMUST00000022576 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Lrrtm2Q8BGA3 Lrrc9-206ENSMUST00000162159 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Lrrtm2Q8BGA3 Btbd35f21-201ENSMUST00000105017 1943 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Lrrtm2Q8BGA3 Btbd35f27-201ENSMUST00000178143 1943 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Lrrtm2Q8BGA3 Btbd35f2-201ENSMUST00000179991 1949 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Lrrtm2Q8BGA3 Btbd35f16-201ENSMUST00000185755 1949 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26078-201ENSMUST00000104067 128 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14744-201ENSMUST00000114039 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Lrrtm2Q8BGA3 Hmgn2l6-201ENSMUST00000115986 267 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14874-201ENSMUST00000118995 438 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15754-201ENSMUST00000119191 478 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Lrrtm2Q8BGA3 Mup-ps19-201ENSMUST00000120390 519 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Lrrtm2Q8BGA3 Tex35-204ENSMUST00000121911 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Lrrtm2Q8BGA3 Tnfsf13os-202ENSMUST00000144033 578 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Lrrtm2Q8BGA3 Lgals8-208ENSMUST00000144283 1148 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Lrrtm2Q8BGA3 Gm24685-201ENSMUST00000157764 285 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Lrrtm2Q8BGA3 Vmn1r-ps45-201ENSMUST00000174106 955 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Lrrtm2Q8BGA3 Gm27855-201ENSMUST00000184122 128 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Lrrtm2Q8BGA3 Gm27887-201ENSMUST00000184367 102 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Lrrtm2Q8BGA3 Gm28083-201ENSMUST00000186533 538 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Lrrtm2Q8BGA3 Gm18036-201ENSMUST00000195256 272 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Lrrtm2Q8BGA3 Mir6516-201ENSMUST00000196236 110 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43078-201ENSMUST00000197222 168 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43444-201ENSMUST00000198123 291 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Lrrtm2Q8BGA3 Mir219c-201ENSMUST00000199860 60 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Lrrtm2Q8BGA3 4930443G03Rik-201ENSMUST00000203475 1282 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45789-201ENSMUST00000213038 364 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Lrrtm2Q8BGA3 AC156802.1-201ENSMUST00000223623 579 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Lrrtm2Q8BGA3 CT956049.1-201ENSMUST00000225671 763 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Lrrtm2Q8BGA3 AC123665.4-201ENSMUST00000228790 249 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Lrrtm2Q8BGA3 Rps4x-201ENSMUST00000033683 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Lrrtm2Q8BGA3 Dppa3-201ENSMUST00000049644 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr1107-201ENSMUST00000099865 1109 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Lrrtm2Q8BGA3 Abca13-201ENSMUST00000042740 16011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr1140-201ENSMUST00000214723 1421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Lrrtm2Q8BGA3 Ankrd12-201ENSMUST00000038116 8991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Lrrtm2Q8BGA3 Vmn1r202-202ENSMUST00000228020 5441 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37776-201ENSMUST00000193471 2497 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Lrrtm2Q8BGA3 Vmn1r171-213ENSMUST00000228681 2633 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr376-203ENSMUST00000170592 3211 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Lrrtm2Q8BGA3 Ireb2-201ENSMUST00000034843 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Lrrtm2Q8BGA3 9630010A21Rik-201ENSMUST00000192348 2703 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Lrrtm2Q8BGA3 Tsga10-207ENSMUST00000155852 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Lrrtm2Q8BGA3 C230071H17Rik-201ENSMUST00000196044 2973 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Lrrtm2Q8BGA3 Gm33609-201ENSMUST00000198559 2694 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Lrrtm2Q8BGA3 Vmn1r35-205ENSMUST00000227961 1789 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr395-202ENSMUST00000215690 4275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5844-201ENSMUST00000119417 2191 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Lrrtm2Q8BGA3 Slc6a15-201ENSMUST00000074204 3607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Lrrtm2Q8BGA3 Vmn2r85-201ENSMUST00000171811 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp78-201ENSMUST00000086323 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr1224-ps1-204ENSMUST00000216833 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43437-201ENSMUST00000198535 3955 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Lrrtm2Q8BGA3 Gm22592-201ENSMUST00000104242 131 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14308-202ENSMUST00000117267 777 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15981-201ENSMUST00000119196 457 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13077-201ENSMUST00000121941 484 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Lrrtm2Q8BGA3 n-R5s30-201ENSMUST00000122624 122 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Lrrtm2Q8BGA3 Crem-236ENSMUST00000154715 1167 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Lrrtm2Q8BGA3 Gm23774-201ENSMUST00000158990 131 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Lrrtm2Q8BGA3 Gm22420-201ENSMUST00000178795 126 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Lrrtm2Q8BGA3 6330403N20Rik-201ENSMUST00000180467 1189 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Lrrtm2Q8BGA3 Gm27985-201ENSMUST00000185112 378 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Lrrtm2Q8BGA3 Gm2950-201ENSMUST00000185530 520 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Lrrtm2Q8BGA3 Gm18802-201ENSMUST00000186270 888 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Lrrtm2Q8BGA3 Gm28652-201ENSMUST00000187008 599 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37932-201ENSMUST00000192258 1167 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37659-201ENSMUST00000194574 111 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Lrrtm2Q8BGA3 Gm42912-201ENSMUST00000197195 716 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Lrrtm2Q8BGA3 Tprkb-208ENSMUST00000200680 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Lrrtm2Q8BGA3 Gm36864-201ENSMUST00000205530 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Lrrtm2Q8BGA3 4930505K13Rik-201ENSMUST00000208641 546 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Lrrtm2Q8BGA3 Ncoa7-203ENSMUST00000213836 2989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Lrrtm2Q8BGA3 AC183268.2-201ENSMUST00000214513 446 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Lrrtm2Q8BGA3 Ang5-201ENSMUST00000066719 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Lrrtm2Q8BGA3 Wac-217ENSMUST00000172018 1965 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37779-201ENSMUST00000194221 3380 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26523-201ENSMUST00000180713 1658 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Lrrtm2Q8BGA3 Zfand6-201ENSMUST00000069537 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Lrrtm2Q8BGA3 Fgf14-202ENSMUST00000095529 3608 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Lrrtm2Q8BGA3 Epha7-203ENSMUST00000108191 6615 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Lrrtm2Q8BGA3 Kcnh7-201ENSMUST00000075052 13321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Lrrtm2Q8BGA3 Gm31258-201ENSMUST00000194532 3297 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Lrrtm2Q8BGA3 Ush2a-201ENSMUST00000060479 15695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Lrrtm2Q8BGA3 Vmn1r6-203ENSMUST00000227131 8330 ntAPPRIS P2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Lrrtm2Q8BGA3 Nlrp4a-204ENSMUST00000146907 3479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Lrrtm2Q8BGA3 Gm19035-201ENSMUST00000193299 1742 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Lrrtm2Q8BGA3 Zbtb38-212ENSMUST00000152594 7406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
Lrrtm2Q8BGA3 Gm4759-201ENSMUST00000183414 6622 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Lrrtm2Q8BGA3 Pum2-210ENSMUST00000169089 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.6 ms