Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Wfdc15b-201ENSMUST00000018355 510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm28550-201ENSMUST00000189125 618 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm28460-202ENSMUST00000190590 618 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm29130-201ENSMUST00000191015 618 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm28086-201ENSMUST00000191586 317 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Ighv1-10-201ENSMUST00000194372 355 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm9632-201ENSMUST00000195934 643 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 AC099760.1-201ENSMUST00000196300 153 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm8454-201ENSMUST00000196980 811 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm3189-201ENSMUST00000205595 832 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Fxyd1-212ENSMUST00000206305 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm18672-201ENSMUST00000208035 270 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm30694-201ENSMUST00000209278 1230 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm36607-201ENSMUST00000222750 1087 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 AC164295.1-201ENSMUST00000224861 186 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 AC154431.2-201ENSMUST00000225215 1055 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 AC154718.1-201ENSMUST00000226676 250 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 AC133203.1-201ENSMUST00000228241 301 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 1700028P14Rik-201ENSMUST00000035849 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Abcd2-201ENSMUST00000069511 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Skint11-201ENSMUST00000079915 820 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm26108-201ENSMUST00000083973 191 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Olfr262-201ENSMUST00000087818 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Ube2v2-201ENSMUST00000096234 609 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Olfr568-201ENSMUST00000098216 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm37216-201ENSMUST00000193817 3478 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm43953-201ENSMUST00000203709 2867 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Meis1-208ENSMUST00000177417 5308 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm26648-201ENSMUST00000181925 5831 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Ctage5-217ENSMUST00000176892 2784 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Akap4-202ENSMUST00000115750 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 3732407C23Rik-201ENSMUST00000222770 3540 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm26717-201ENSMUST00000181713 1418 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Mybpc1-202ENSMUST00000121629 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Psd3-214ENSMUST00000212960 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Homez-201ENSMUST00000081162 5609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Olfr292-201ENSMUST00000080165 3211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Fam135a-208ENSMUST00000187752 5194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Cfap70-202ENSMUST00000022349 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r22-206ENSMUST00000228905 2394 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r193-204ENSMUST00000228303 6653 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Nlrc3-204ENSMUST00000180200 3842 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Kif27-201ENSMUST00000043605 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm36799-202ENSMUST00000215783 1634 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Olfr419-202ENSMUST00000214725 2685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm10309-201ENSMUST00000095186 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm26608-202ENSMUST00000181503 1362 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Kidins220-201ENSMUST00000066652 7409 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Zfp825-203ENSMUST00000221173 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Mef2c-214ENSMUST00000197722 3517 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Dcp2-201ENSMUST00000025350 8616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Rnf145-202ENSMUST00000101327 4214 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Olfr328-202ENSMUST00000108824 1199 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Amelx-202ENSMUST00000112118 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm12565-201ENSMUST00000119004 649 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm14229-201ENSMUST00000121178 850 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
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Dsg1bQ7TSF1 Gm26353-201ENSMUST00000158224 255 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm22668-201ENSMUST00000158716 260 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm9587-201ENSMUST00000172449 454 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm29160-201ENSMUST00000190094 699 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r82-202ENSMUST00000191002 918 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm37353-201ENSMUST00000194497 313 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 9430087J23Rik-201ENSMUST00000195414 1152 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
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Dsg1bQ7TSF1 RMST_1.1-205ENSMUST00000218060 997 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 CT010456.3-201ENSMUST00000221210 523 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm7045-201ENSMUST00000221466 605 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm7240-202ENSMUST00000221961 353 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
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Dsg1bQ7TSF1 Olfr694-201ENSMUST00000052535 1123 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
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Dsg1bQ7TSF1 Olfr694-202ENSMUST00000082091 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Olfr57-201ENSMUST00000082244 1080 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 n-R5s89-201ENSMUST00000083532 104 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 1700109H08Rik-201ENSMUST00000008451 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r86-201ENSMUST00000094828 951 ntAPPRIS P2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Ddr2-205ENSMUST00000194690 8590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Nostrin-201ENSMUST00000041865 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Mgat4a-206ENSMUST00000154819 2796 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Kynu-203ENSMUST00000112826 1587 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Dlg2-204ENSMUST00000107196 7490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm37254-201ENSMUST00000193542 3901 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm38699-201ENSMUST00000221301 1740 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Emsy-202ENSMUST00000205276 7693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 4921539E11Rik-201ENSMUST00000030245 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 2700049A03Rik-201ENSMUST00000045907 4507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Cd200r4-202ENSMUST00000176321 2005 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Coro2a-203ENSMUST00000107757 4124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Zfp263-207ENSMUST00000162207 2452 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Bivm-201ENSMUST00000035991 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Cep70-201ENSMUST00000093795 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm10825-201ENSMUST00000180537 4478 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm26581-201ENSMUST00000181953 4479 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.37
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