Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44820-201ENSMUST00000207420 396 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Ccdc88cQ6VGS5 RMST_1.1-205ENSMUST00000218060 997 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr738-201ENSMUST00000058972 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Ccdc88cQ6VGS5 Gm24166-201ENSMUST00000082724 135 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Ccdc88cQ6VGS5 Dnase2b-202ENSMUST00000200633 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc186-201ENSMUST00000076085 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp455-201ENSMUST00000117110 2556 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Ccdc88cQ6VGS5 Clec2g-203ENSMUST00000142388 2404 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Ccdc88cQ6VGS5 Ctsj-202ENSMUST00000224224 1421 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6645-201ENSMUST00000118505 2726 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Ccdc88cQ6VGS5 Cdh6-201ENSMUST00000036439 8167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr285-202ENSMUST00000216901 5330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr488-202ENSMUST00000211508 4624 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr488-203ENSMUST00000215173 4605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr204-202ENSMUST00000216261 5371 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr591-202ENSMUST00000216581 4802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Ccdc88cQ6VGS5 Dctn4-201ENSMUST00000025505 3738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Ccdc88cQ6VGS5 AC162908.1-201ENSMUST00000219164 4563 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
Ccdc88cQ6VGS5 Defa-ps14-201ENSMUST00000121373 418 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12893-201ENSMUST00000121732 275 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15868-201ENSMUST00000144291 520 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Ccdc88cQ6VGS5 Stx5a-215ENSMUST00000176570 563 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43136-201ENSMUST00000200403 636 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
Ccdc88cQ6VGS5 Gm19617-201ENSMUST00000202977 308 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
Ccdc88cQ6VGS5 Gm32591-202ENSMUST00000204063 403 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Ccdc88cQ6VGS5 AC142273.1-201ENSMUST00000213723 673 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
Ccdc88cQ6VGS5 AC158633.1-201ENSMUST00000219892 649 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
Ccdc88cQ6VGS5 Iqca-207ENSMUST00000212394 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Ccdc88cQ6VGS5 Myo3b-201ENSMUST00000060208 6256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Ccdc88cQ6VGS5 Dleu2-202ENSMUST00000180917 3544 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Ccdc88cQ6VGS5 9830107B12Rik-201ENSMUST00000063481 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccdc88cQ6VGS5 Map9-201ENSMUST00000091014 6218 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccdc88cQ6VGS5 Mga-201ENSMUST00000046717 11982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn2r1-201ENSMUST00000029406 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r81-204ENSMUST00000228482 13495 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccdc88cQ6VGS5 Mmp12-203ENSMUST00000120655 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr516-202ENSMUST00000216092 1493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccdc88cQ6VGS5 Vav3-202ENSMUST00000106576 3123 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42727-201ENSMUST00000202446 2823 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn2r99-201ENSMUST00000176107 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr75-ps1-203ENSMUST00000144832 2655 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccdc88cQ6VGS5 Gm25103-201ENSMUST00000122671 318 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccdc88cQ6VGS5 Ang5-201ENSMUST00000066719 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
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Ccdc88cQ6VGS5 Stag2-203ENSMUST00000115073 6171 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
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Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1279-203ENSMUST00000216697 3385 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
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Ccdc88cQ6VGS5 Zfp229-203ENSMUST00000182603 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccdc88cQ6VGS5 Ugt1a7c-202ENSMUST00000113135 3302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr911-ps1-202ENSMUST00000216496 3576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccdc88cQ6VGS5 Vps13d-201ENSMUST00000020441 15665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccdc88cQ6VGS5 Gm23274-201ENSMUST00000104056 130 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26146-201ENSMUST00000104478 185 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm13867-201ENSMUST00000120844 395 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccdc88cQ6VGS5 0610043K17Rik-201ENSMUST00000123107 614 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
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Ccdc88cQ6VGS5 4930551O13Rik-201ENSMUST00000145585 1065 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17430-201ENSMUST00000171339 474 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm27266-201ENSMUST00000184521 123 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
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Ccdc88cQ6VGS5 Lingo2-210ENSMUST00000164772 3562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
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Ccdc88cQ6VGS5 Wrn-202ENSMUST00000033991 6262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
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Ccdc88cQ6VGS5 Cyp3a16-201ENSMUST00000031633 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccdc88cQ6VGS5 Trav2-201ENSMUST00000103568 325 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccdc88cQ6VGS5 Ppih-202ENSMUST00000106317 613 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16128-201ENSMUST00000117855 626 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r57-201ENSMUST00000170780 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccdc88cQ6VGS5 Mir7669-201ENSMUST00000183442 58 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42952-201ENSMUST00000196393 731 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43390-201ENSMUST00000196614 421 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccdc88cQ6VGS5 Gm4321-201ENSMUST00000200520 442 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccdc88cQ6VGS5 AC154576.2-203ENSMUST00000224736 253 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
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Ccdc88cQ6VGS5 Olfr221-202ENSMUST00000214071 3044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr198-202ENSMUST00000208244 2200 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp975-201ENSMUST00000107992 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15737-201ENSMUST00000113434 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13615-201ENSMUST00000120242 1612 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15169-201ENSMUST00000126095 2753 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp65-201ENSMUST00000073157 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccdc88cQ6VGS5 Ctsm-202ENSMUST00000223778 1905 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccdc88cQ6VGS5 Gm19136-201ENSMUST00000190706 2067 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r90-203ENSMUST00000226510 6674 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccdc88cQ6VGS5 C130079G13Rik-201ENSMUST00000049476 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37400-201ENSMUST00000193148 3605 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1286-203ENSMUST00000213210 3740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp26-203ENSMUST00000159569 11276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11313-201ENSMUST00000118779 432 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
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