Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Mir6960-201ENSMUST00000183449 61 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Ccdc18Q640L5 Gm43350-201ENSMUST00000196382 711 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Ccdc18Q640L5 Gm42982-201ENSMUST00000198574 687 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Ccdc18Q640L5 Gm19617-201ENSMUST00000202977 308 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Ccdc18Q640L5 Pglyrp3-201ENSMUST00000047660 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Ccdc18Q640L5 Nfyc-202ENSMUST00000097906 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Ccdc18Q640L5 Pdc-202ENSMUST00000185698 3335 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Ccdc18Q640L5 Il6-203ENSMUST00000199183 2343 ntTSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Ccdc18Q640L5 Gm38368-201ENSMUST00000193181 1335 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Ccdc18Q640L5 Gm13881-201ENSMUST00000149025 3716 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Ccdc18Q640L5 Gm42598-201ENSMUST00000200110 2437 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Ccdc18Q640L5 C230085N15Rik-201ENSMUST00000194893 4327 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Ccdc18Q640L5 Fbxw15-201ENSMUST00000056745 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Ccdc18Q640L5 Olfr1183-202ENSMUST00000213115 8258 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Ccdc18Q640L5 Gm20644-201ENSMUST00000176721 2063 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Ccdc18Q640L5 Vmn2r1-201ENSMUST00000029406 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Ccdc18Q640L5 Gm18186-201ENSMUST00000192239 1580 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Ccdc18Q640L5 G930045G22Rik-201ENSMUST00000101402 480 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Ccdc18Q640L5 Olfr328-202ENSMUST00000108824 1199 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Ccdc18Q640L5 Olfr337-ps1-201ENSMUST00000120380 456 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Ccdc18Q640L5 1700007M16Rik-201ENSMUST00000129075 435 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Ccdc18Q640L5 Gm25913-201ENSMUST00000157617 135 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Ccdc18Q640L5 Gm18382-201ENSMUST00000194394 582 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Ccdc18Q640L5 Gm37167-201ENSMUST00000194946 396 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Ccdc18Q640L5 Gm44214-201ENSMUST00000204153 606 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Ccdc18Q640L5 Gm5339-201ENSMUST00000210551 1102 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Ccdc18Q640L5 Olfr574-202ENSMUST00000211329 1039 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Ccdc18Q640L5 AC153917.1-201ENSMUST00000218959 856 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Ccdc18Q640L5 Dnah12-202ENSMUST00000073309 611 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Ccdc18Q640L5 Olfr345-201ENSMUST00000076850 936 ntAPPRIS P1 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Ccdc18Q640L5 Kncn-201ENSMUST00000097918 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Ccdc18Q640L5 Bsph1-201ENSMUST00000098811 822 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Ccdc18Q640L5 Gm14399-201ENSMUST00000099029 192 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Ccdc18Q640L5 1110008L16Rik-205ENSMUST00000184766 2250 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Ccdc18Q640L5 Pramef6-202ENSMUST00000105767 1967 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Ccdc18Q640L5 Gm42843-201ENSMUST00000196328 3616 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Ccdc18Q640L5 Dnm3os-201ENSMUST00000139662 7928 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Ccdc18Q640L5 Gm15910-201ENSMUST00000127564 2971 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Ccdc18Q640L5 AC155634.1-201ENSMUST00000221687 2706 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Ccdc18Q640L5 Abcd2-201ENSMUST00000069511 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Ccdc18Q640L5 Vmn1r26-204ENSMUST00000228951 4591 ntAPPRIS P1 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Ccdc18Q640L5 Clk4-202ENSMUST00000109111 1427 ntTSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Ccdc18Q640L5 Rgsl1-201ENSMUST00000124558 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Ccdc18Q640L5 Zpld1-201ENSMUST00000036412 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Ccdc18Q640L5 Rgs7-207ENSMUST00000195324 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Ccdc18Q640L5 Plch1-206ENSMUST00000159676 6560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Ccdc18Q640L5 Vmn1r200-204ENSMUST00000227326 5449 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Ccdc18Q640L5 Gm12413-201ENSMUST00000121508 312 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
Ccdc18Q640L5 4930551O13Rik-201ENSMUST00000145585 1065 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Ccdc18Q640L5 Zakit-201ENSMUST00000157677 308 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
Ccdc18Q640L5 Spink10-205ENSMUST00000162365 1076 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Ccdc18Q640L5 Gm27564-201ENSMUST00000185196 96 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
Ccdc18Q640L5 Rps27a-ps1-201ENSMUST00000191424 463 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
Ccdc18Q640L5 Gm37079-201ENSMUST00000194114 2135 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
Ccdc18Q640L5 Gm43136-201ENSMUST00000200403 636 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
Ccdc18Q640L5 Spam1-203ENSMUST00000202569 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Ccdc18Q640L5 Gm39363-201ENSMUST00000214251 723 ntTSL 3 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Ccdc18Q640L5 Gm32526-201ENSMUST00000221878 981 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
Ccdc18Q640L5 Olfr448-202ENSMUST00000213952 3024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Ccdc18Q640L5 9330159M07Rik-201ENSMUST00000180712 2702 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Ccdc18Q640L5 Cul5-202ENSMUST00000120122 5945 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Ccdc18Q640L5 Rbm41-203ENSMUST00000113007 3691 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Ccdc18Q640L5 Gm37057-201ENSMUST00000192624 1916 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
Ccdc18Q640L5 C630031E19Rik-201ENSMUST00000218114 3059 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 AC123705.3-201ENSMUST00000223531 2069 ntBASIC8.4□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Ercc6l-201ENSMUST00000056904 5302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Gm10727-201ENSMUST00000197107 1602 ntBASIC8.4□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Sis-202ENSMUST00000167334 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Tenm4-203ENSMUST00000107166 13172 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Nyap2-203ENSMUST00000123285 7501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Vmn1r171-210ENSMUST00000228484 2421 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Gm16041-201ENSMUST00000144339 3725 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Gm11911-201ENSMUST00000117938 1023 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Gm18128-201ENSMUST00000172625 511 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Gm26765-201ENSMUST00000180844 692 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Gm27528-201ENSMUST00000183544 205 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Mir6907-201ENSMUST00000183764 71 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Gm4854-201ENSMUST00000185902 574 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Gm28692-202ENSMUST00000189645 621 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Gm37878-201ENSMUST00000192108 387 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Gm43700-201ENSMUST00000200967 316 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Gm40293-201ENSMUST00000202596 485 ntTSL 3 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Vmn1r27-201ENSMUST00000095862 912 ntAPPRIS P2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Gm37018-201ENSMUST00000192441 3869 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Gm37304-201ENSMUST00000193833 2886 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Slfn14-201ENSMUST00000163961 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Gnrhr-203ENSMUST00000113372 2265 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Kat6a-202ENSMUST00000110696 9041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Zfp995-201ENSMUST00000106026 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Gm10030-203ENSMUST00000197321 3824 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Gm3020-201ENSMUST00000112801 450 ntTSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Gm15245-201ENSMUST00000129410 1186 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Gm6223-201ENSMUST00000178436 871 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Mir7222-201ENSMUST00000183740 75 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Gm9442-201ENSMUST00000194242 319 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Gm31786-202ENSMUST00000212428 676 ntTSL 3 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Icos-201ENSMUST00000027162 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Tas2r120-201ENSMUST00000071707 892 ntAPPRIS P1 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Fam24a-201ENSMUST00000084505 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Ccdc18Q640L5 Olfr1241-201ENSMUST00000099778 945 ntAPPRIS P1 BASIC8.38□□□□□ -1.07
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