Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

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Length 425 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Gm5715-201ENSMUST00000196854 1465 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Rbbp4Q60972 Olfr1097-202ENSMUST00000217403 4430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Rbbp4Q60972 Gm13961-201ENSMUST00000119282 4772 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Rbbp4Q60972 Cnga1-205ENSMUST00000201463 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Rbbp4Q60972 Vmn1r200-205ENSMUST00000228726 5525 ntAPPRIS P2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Rbbp4Q60972 Gm38368-201ENSMUST00000193181 1335 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Rbbp4Q60972 Slc6a15-202ENSMUST00000179636 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Rbbp4Q60972 Ryr3-202ENSMUST00000091818 15410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Rbbp4Q60972 Gm17101-201ENSMUST00000169520 1588 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Rbbp4Q60972 Ank2-207ENSMUST00000182064 12413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Rbbp4Q60972 Gm43831-201ENSMUST00000200461 2598 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Rbbp4Q60972 Olfr47-202ENSMUST00000215569 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Rbbp4Q60972 Gm43845-201ENSMUST00000202462 1820 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Rbbp4Q60972 Olfr1493-ps1-202ENSMUST00000208667 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Rbbp4Q60972 Olfr919-203ENSMUST00000217508 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Rbbp4Q60972 Ttc39d-201ENSMUST00000053168 2022 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Rbbp4Q60972 Cyp4a12a-201ENSMUST00000084343 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Rbbp4Q60972 Vmn1r34-204ENSMUST00000226999 3048 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Rbbp4Q60972 Spata17-202ENSMUST00000110945 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Rbbp4Q60972 Gm13532-201ENSMUST00000120373 240 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Rbbp4Q60972 Gm13259-201ENSMUST00000120792 456 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Rbbp4Q60972 Gm12288-201ENSMUST00000121054 1282 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Rbbp4Q60972 4930412B13Rik-201ENSMUST00000149239 1276 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Rbbp4Q60972 Gm23897-201ENSMUST00000158110 158 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Rbbp4Q60972 Vmn1r-ps66-201ENSMUST00000173436 612 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Rbbp4Q60972 Clec4e-207ENSMUST00000177367 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Rbbp4Q60972 Gm6055-201ENSMUST00000180532 378 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Rbbp4Q60972 Gm2914-201ENSMUST00000186120 328 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Rbbp4Q60972 Gm29376-201ENSMUST00000189357 835 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Rbbp4Q60972 Rpap3-ps1-201ENSMUST00000190928 454 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Rbbp4Q60972 Gm37517-201ENSMUST00000194004 1289 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Rbbp4Q60972 Gm42753-201ENSMUST00000196718 1268 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Rbbp4Q60972 AC160413.1-201ENSMUST00000217909 932 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Rbbp4Q60972 A930023M06Rik-201ENSMUST00000223270 1093 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Rbbp4Q60972 AC158388.1-201ENSMUST00000225441 256 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Rbbp4Q60972 AC114572.1-201ENSMUST00000227262 300 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Rbbp4Q60972 AC154738.4-201ENSMUST00000228310 414 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Rbbp4Q60972 Rpl27a-ps2-201ENSMUST00000080234 450 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Rbbp4Q60972 Snora44-201ENSMUST00000082670 129 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Rbbp4Q60972 Olfr592-201ENSMUST00000098207 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Rbbp4Q60972 Ttn-202ENSMUST00000099980 16891 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Rbbp4Q60972 Carf-201ENSMUST00000027171 2102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Rbbp4Q60972 Vmn1r30-204ENSMUST00000228577 1968 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Rbbp4Q60972 Sult1c1-201ENSMUST00000024738 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Rbbp4Q60972 Gnat3-201ENSMUST00000030561 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Rbbp4Q60972 Zfp788-202ENSMUST00000098508 3775 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Rbbp4Q60972 Scfd1-201ENSMUST00000021335 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Rbbp4Q60972 Ccdc66-202ENSMUST00000223689 4262 ntAPPRIS P2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Rbbp4Q60972 Olfr427-202ENSMUST00000213832 3866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Rbbp4Q60972 Olfr13-202ENSMUST00000216179 3677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Rbbp4Q60972 Tfpi-201ENSMUST00000028487 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Rbbp4Q60972 Dmxl2-202ENSMUST00000118600 9465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Rbbp4Q60972 4933400C23Rik-201ENSMUST00000188610 1708 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Rbbp4Q60972 B530045E10Rik-202ENSMUST00000189035 3138 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Rbbp4Q60972 Gm10377-201ENSMUST00000100695 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Rbbp4Q60972 Gm3676-201ENSMUST00000111869 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Rbbp4Q60972 Gm3543-201ENSMUST00000111870 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Rbbp4Q60972 Amelx-204ENSMUST00000112120 727 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Rbbp4Q60972 Ncald-202ENSMUST00000116445 858 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
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Rbbp4Q60972 Gm15185-201ENSMUST00000117397 746 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
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Rbbp4Q60972 Gm12482-201ENSMUST00000120435 630 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
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Rbbp4Q60972 Gm10376-202ENSMUST00000169756 900 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Rbbp4Q60972 Klrb1a-202ENSMUST00000171306 989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
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Rbbp4Q60972 Faiml-201ENSMUST00000178051 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
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Rbbp4Q60972 Gm8298-201ENSMUST00000179799 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Rbbp4Q60972 Obox4-ps13-201ENSMUST00000180123 1137 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Rbbp4Q60972 Gm27887-201ENSMUST00000184367 102 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Rbbp4Q60972 Rhoay-ps2-201ENSMUST00000186362 581 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Rbbp4Q60972 Gm2325-201ENSMUST00000186637 581 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Rbbp4Q60972 AV026068-210ENSMUST00000189169 877 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Rbbp4Q60972 Gm28319-201ENSMUST00000189560 226 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
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Rbbp4Q60972 Clec2g-206ENSMUST00000204259 893 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Rbbp4Q60972 Gm2961-201ENSMUST00000211074 772 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Rbbp4Q60972 Gm45908-201ENSMUST00000212977 1177 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Rbbp4Q60972 AC153955.1-201ENSMUST00000217458 663 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
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Rbbp4Q60972 Gm5750-201ENSMUST00000218711 801 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Rbbp4Q60972 Mrpl42-203ENSMUST00000218893 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Rbbp4Q60972 AC102435.1-205ENSMUST00000221064 1097 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Rbbp4Q60972 AC134254.2-201ENSMUST00000221262 170 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Rbbp4Q60972 AV026068-224ENSMUST00000224827 928 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Rbbp4Q60972 CT030194.2-201ENSMUST00000225752 379 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Rbbp4Q60972 AC107711.2-203ENSMUST00000227827 762 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Rbbp4Q60972 Olfr150-201ENSMUST00000078557 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Rbbp4Q60972 Gm23508-201ENSMUST00000083079 72 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Rbbp4Q60972 Gm14391-203ENSMUST00000109056 1956 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Rbbp4Q60972 Gm37244-201ENSMUST00000191748 1981 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120.8 ms