Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm45075-201ENSMUST00000208426 649 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm38590-201ENSMUST00000209515 970 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Cx3cl1-205ENSMUST00000211947 377 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 AC155834.1-201ENSMUST00000220033 498 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 AC154806.3-201ENSMUST00000227376 439 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 AC166369.2-201ENSMUST00000228403 308 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm8724-201ENSMUST00000081668 483 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm42455-201ENSMUST00000199761 2736 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Olfr123-203ENSMUST00000216051 2716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Akap4-201ENSMUST00000057101 2851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 Gm37875-201ENSMUST00000192101 1498 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Sft2d1Q5SSN7 3110080E11Rik-201ENSMUST00000210736 3477 ntBASIC4.09□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm8402-201ENSMUST00000118183 1770 ntBASIC4.09□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm8383-201ENSMUST00000121179 1770 ntBASIC4.09□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1196-202ENSMUST00000216928 4270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm45201-201ENSMUST00000207187 2679 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Rgs17-202ENSMUST00000064225 8191 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 F630028O10Rik-201ENSMUST00000133125 2771 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Zfp449-201ENSMUST00000101560 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Wwp1-201ENSMUST00000035982 4832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Dync2h1-201ENSMUST00000048417 13972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Tcrg-V6-201ENSMUST00000103555 403 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm25396-201ENSMUST00000103981 133 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm5925-201ENSMUST00000105016 1497 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm9112-201ENSMUST00000113610 420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Rps11-ps3-201ENSMUST00000117608 486 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm13491-201ENSMUST00000118267 235 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm8761-201ENSMUST00000121507 955 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm5843-201ENSMUST00000121631 476 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm25219-201ENSMUST00000157545 330 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Mir1953-201ENSMUST00000157866 89 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm23965-201ENSMUST00000157969 142 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 0610040B10Rik-201ENSMUST00000160231 501 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Iltifb-201ENSMUST00000163808 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm3696-202ENSMUST00000179898 612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm16701-202ENSMUST00000180995 934 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm27679-201ENSMUST00000184612 84 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Mir6987-201ENSMUST00000184789 73 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm37262-201ENSMUST00000192816 1818 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm38125-201ENSMUST00000194136 3438 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm37571-201ENSMUST00000195048 614 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm43388-201ENSMUST00000197818 1225 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Tmem243-203ENSMUST00000198935 849 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm35191-201ENSMUST00000200925 2475 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm31861-201ENSMUST00000204563 672 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm31749-201ENSMUST00000206873 598 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm44879-201ENSMUST00000207007 503 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 5930435M05Rik-201ENSMUST00000207572 3712 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm44992-214ENSMUST00000210787 1079 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 AC132232.1-201ENSMUST00000214667 1019 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1056-202ENSMUST00000216547 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm19174-201ENSMUST00000216944 956 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 AC156832.1-201ENSMUST00000217609 811 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 AC154219.1-201ENSMUST00000220764 1262 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm7712-201ENSMUST00000222214 337 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm33489-201ENSMUST00000223171 673 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 AC159252.1-201ENSMUST00000224450 553 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 CT025579.4-201ENSMUST00000224598 627 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 AC154461.5-201ENSMUST00000225429 774 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Naa16-201ENSMUST00000022597 13223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 A930017M01Rik-205ENSMUST00000227721 4167 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 AC139218.1-201ENSMUST00000228215 4287 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Ceacam2-201ENSMUST00000044547 2844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm26330-201ENSMUST00000082817 104 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm23508-201ENSMUST00000083079 72 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm24032-201ENSMUST00000083932 159 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Olfr263-201ENSMUST00000096006 1087 ntAPPRIS P1 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm45235-201ENSMUST00000208016 4465 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Peli1-202ENSMUST00000101477 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Fsd1l-207ENSMUST00000180164 7340 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r32-202ENSMUST00000227014 2661 ntAPPRIS P1 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1263-204ENSMUST00000217065 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm43913-201ENSMUST00000203924 3029 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm37733-201ENSMUST00000195478 2962 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm43166-201ENSMUST00000202871 4379 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 9130208D14Rik-201ENSMUST00000146911 7293 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Mbnl1-219ENSMUST00000194201 4319 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Ms4a13-202ENSMUST00000188464 1301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm43121-201ENSMUST00000199065 1305 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm13033-201ENSMUST00000117591 1057 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1083-ps-201ENSMUST00000117704 943 ntAPPRIS P1 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm4989-201ENSMUST00000118711 749 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm15331-201ENSMUST00000120225 385 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm13000-201ENSMUST00000120937 496 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm13232-201ENSMUST00000121816 632 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm23837-201ENSMUST00000122656 286 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 2310044K18Rik-201ENSMUST00000125131 618 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm12609-201ENSMUST00000129908 610 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm25770-201ENSMUST00000158566 115 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm16164-201ENSMUST00000160078 468 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Pfdn5-208ENSMUST00000170627 330 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm3715-201ENSMUST00000172308 617 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm4831-201ENSMUST00000174626 594 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm24303-201ENSMUST00000178237 126 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm8614-201ENSMUST00000182528 978 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm27238-201ENSMUST00000185180 417 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm5058-201ENSMUST00000187331 463 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm5285-201ENSMUST00000193089 666 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Mir409-201ENSMUST00000198153 79 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm43233-201ENSMUST00000200491 616 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.3 ms