Protein–RNA interactions for Protein: Q3USL1

Klhdc9, Kelch domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc9Q3USL1 Vmn1r11-202ENSMUST00000226968 2522 ntAPPRIS P2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Klhdc9Q3USL1 AC158938.1-201ENSMUST00000225372 6720 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Klhdc9Q3USL1 Prr14l-201ENSMUST00000120129 9959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Klhdc9Q3USL1 Ncoa7-202ENSMUST00000092610 2590 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Klhdc9Q3USL1 Zfp101-201ENSMUST00000167107 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Klhdc9Q3USL1 Trbv12-1-201ENSMUST00000103267 389 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Klhdc9Q3USL1 Cetn2-202ENSMUST00000114550 1124 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Klhdc9Q3USL1 Gm8202-201ENSMUST00000117682 310 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Klhdc9Q3USL1 Gm8145-201ENSMUST00000118220 745 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Klhdc9Q3USL1 Gm12423-201ENSMUST00000118334 135 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Klhdc9Q3USL1 Gm13149-201ENSMUST00000122071 339 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Klhdc9Q3USL1 Ccdc34os-201ENSMUST00000123633 979 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Klhdc9Q3USL1 1700061H18Rik-201ENSMUST00000139488 634 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Klhdc9Q3USL1 Gm5353-201ENSMUST00000139800 793 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Klhdc9Q3USL1 Scgb2a2-201ENSMUST00000179814 1107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Klhdc9Q3USL1 Gm26950-201ENSMUST00000182734 498 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Klhdc9Q3USL1 Olfr1391-201ENSMUST00000187509 938 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Klhdc9Q3USL1 Gm2497-201ENSMUST00000189539 601 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Klhdc9Q3USL1 Gm28692-202ENSMUST00000189645 621 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Klhdc9Q3USL1 Xrn1-209ENSMUST00000190665 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Klhdc9Q3USL1 Gm29332-201ENSMUST00000190829 227 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Klhdc9Q3USL1 Gm37884-201ENSMUST00000191857 818 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Klhdc9Q3USL1 Gm37684-201ENSMUST00000192779 355 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Klhdc9Q3USL1 Gm37815-201ENSMUST00000195665 411 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Klhdc9Q3USL1 Gm32554-201ENSMUST00000196310 970 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Klhdc9Q3USL1 Gm18719-201ENSMUST00000196696 1413 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Klhdc9Q3USL1 Rnu3a-202ENSMUST00000196710 213 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Klhdc9Q3USL1 AL645522.1-201ENSMUST00000197692 104 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Klhdc9Q3USL1 4930443G03Rik-201ENSMUST00000203475 1282 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Klhdc9Q3USL1 Rho-205ENSMUST00000203877 939 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Klhdc9Q3USL1 Gm18791-201ENSMUST00000204611 726 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Klhdc9Q3USL1 Gm4290-201ENSMUST00000206897 814 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Klhdc9Q3USL1 B130024G19Rik-205ENSMUST00000207952 485 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Klhdc9Q3USL1 Olfr1460-ps1-201ENSMUST00000208975 899 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Klhdc9Q3USL1 Olfr540-ps1-201ENSMUST00000210499 612 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Klhdc9Q3USL1 Jakmip1-216ENSMUST00000212997 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Klhdc9Q3USL1 4930532I03Rik-201ENSMUST00000218463 1724 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Klhdc9Q3USL1 AC156576.2-202ENSMUST00000222525 411 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Klhdc9Q3USL1 AC099934.5-201ENSMUST00000222699 945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Klhdc9Q3USL1 AC241593.2-201ENSMUST00000225099 510 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Klhdc9Q3USL1 AC161269.1-201ENSMUST00000228426 318 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Klhdc9Q3USL1 Dcp2-201ENSMUST00000025350 8616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Klhdc9Q3USL1 Cetn2-201ENSMUST00000033713 1026 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Klhdc9Q3USL1 Olfr738-201ENSMUST00000058972 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Klhdc9Q3USL1 Olfr68-201ENSMUST00000072513 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Klhdc9Q3USL1 Atp12a-201ENSMUST00000007340 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Klhdc9Q3USL1 Rnu3a-201ENSMUST00000083936 214 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Klhdc9Q3USL1 Spata22-202ENSMUST00000092926 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Klhdc9Q3USL1 AC131329.1-201ENSMUST00000221204 3487 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Klhdc9Q3USL1 Serpinb3b-202ENSMUST00000166100 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Klhdc9Q3USL1 Zfp143-201ENSMUST00000084727 3003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Klhdc9Q3USL1 Gm44175-201ENSMUST00000204863 4256 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Klhdc9Q3USL1 Nfatc3-206ENSMUST00000212742 3207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Klhdc9Q3USL1 Mug4-ps-201ENSMUST00000203118 3578 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Klhdc9Q3USL1 Vmn2r5-201ENSMUST00000170270 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Klhdc9Q3USL1 Gm37254-201ENSMUST00000193542 3901 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Klhdc9Q3USL1 Gm3604-202ENSMUST00000187656 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Klhdc9Q3USL1 AC160029.1-201ENSMUST00000219628 2678 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Klhdc9Q3USL1 Ankar-203ENSMUST00000212573 3952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Klhdc9Q3USL1 Pcdh15-203ENSMUST00000105424 6932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Klhdc9Q3USL1 Gm44739-201ENSMUST00000205294 1426 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Klhdc9Q3USL1 Gm38257-201ENSMUST00000195881 2761 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Klhdc9Q3USL1 Gm12849-201ENSMUST00000120013 739 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Klhdc9Q3USL1 Gm14732-201ENSMUST00000121372 545 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Klhdc9Q3USL1 Gm15227-201ENSMUST00000121844 399 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Klhdc9Q3USL1 Gm14011-201ENSMUST00000145178 302 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Klhdc9Q3USL1 Gm23673-201ENSMUST00000157474 298 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Klhdc9Q3USL1 Gm26607-201ENSMUST00000180661 867 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Klhdc9Q3USL1 Gm26765-201ENSMUST00000180844 692 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Klhdc9Q3USL1 C130060C02Rik-201ENSMUST00000181731 1142 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Klhdc9Q3USL1 Vmn1r82-202ENSMUST00000191002 918 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Klhdc9Q3USL1 1700084F23Rik-205ENSMUST00000191362 743 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Klhdc9Q3USL1 Gng12-208ENSMUST00000204511 739 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Klhdc9Q3USL1 Gm44237-201ENSMUST00000205183 936 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Klhdc9Q3USL1 AC121986.1-201ENSMUST00000218588 781 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Klhdc9Q3USL1 Gm1000-201ENSMUST00000220520 801 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Klhdc9Q3USL1 Vmn2r2-201ENSMUST00000077958 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Klhdc9Q3USL1 Olfr1564-202ENSMUST00000208645 5213 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Klhdc9Q3USL1 Nop58-215ENSMUST00000191142 9507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Klhdc9Q3USL1 Mdm4-210ENSMUST00000188090 7105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Klhdc9Q3USL1 Rfx4-202ENSMUST00000060397 3534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Klhdc9Q3USL1 Gm37775-201ENSMUST00000194120 2313 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Klhdc9Q3USL1 Gm45183-201ENSMUST00000207937 1497 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Klhdc9Q3USL1 Rnf2-204ENSMUST00000187048 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Klhdc9Q3USL1 Ccna2-205ENSMUST00000196316 2001 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Klhdc9Q3USL1 Gm37400-201ENSMUST00000193148 3605 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Klhdc9Q3USL1 Rgs7-207ENSMUST00000195324 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Klhdc9Q3USL1 Pcdh15-211ENSMUST00000126920 6866 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Klhdc9Q3USL1 Postn-202ENSMUST00000081564 2670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Klhdc9Q3USL1 Tsga10-203ENSMUST00000114902 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Klhdc9Q3USL1 Vmn2r1-201ENSMUST00000029406 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Klhdc9Q3USL1 Lrrn3-201ENSMUST00000043884 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Klhdc9Q3USL1 Postn-204ENSMUST00000117373 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Klhdc9Q3USL1 Cyp2c50-201ENSMUST00000068094 1643 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Klhdc9Q3USL1 Tyr-201ENSMUST00000004770 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Klhdc9Q3USL1 Zfp65-201ENSMUST00000073157 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Klhdc9Q3USL1 Olfr328-202ENSMUST00000108824 1199 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Klhdc9Q3USL1 Gm14791-201ENSMUST00000119061 1166 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Klhdc9Q3USL1 Gm11790-201ENSMUST00000119569 455 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Klhdc9Q3USL1 4930440I19Rik-202ENSMUST00000145972 676 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
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