Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Gm42761-201ENSMUST00000201899 738 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1452-ps1-201ENSMUST00000208396 925 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ctdnep1Q3TP92 BC024386-203ENSMUST00000209817 825 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ctdnep1Q3TP92 Gm19095-201ENSMUST00000220533 730 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ctdnep1Q3TP92 Gm9269-201ENSMUST00000221661 578 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ctdnep1Q3TP92 AC125484.1-201ENSMUST00000223218 234 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ctdnep1Q3TP92 AC154806.4-201ENSMUST00000227406 439 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1302-201ENSMUST00000054004 948 ntAPPRIS P2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ctdnep1Q3TP92 Gm45129-201ENSMUST00000208444 2224 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ctdnep1Q3TP92 Rfx3-202ENSMUST00000165566 9146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ctdnep1Q3TP92 Tet1-201ENSMUST00000050826 13986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Ctdnep1Q3TP92 Gm37558-201ENSMUST00000193684 2983 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
Ctdnep1Q3TP92 Vcan-203ENSMUST00000109546 12427 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Ctdnep1Q3TP92 Gm15675-201ENSMUST00000130486 3681 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Ctdnep1Q3TP92 Slamf7-203ENSMUST00000192195 3975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ctdnep1Q3TP92 Gm37780-201ENSMUST00000194117 1873 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ctdnep1Q3TP92 Ryr3-211ENSMUST00000208290 15468 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ctdnep1Q3TP92 Vmn2r88-202ENSMUST00000159674 3098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ctdnep1Q3TP92 Akap4-202ENSMUST00000115750 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ctdnep1Q3TP92 Ash1l-201ENSMUST00000090933 11268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ctdnep1Q3TP92 Gm43312-201ENSMUST00000201655 2466 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ctdnep1Q3TP92 Amd2-201ENSMUST00000080898 3218 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ctdnep1Q3TP92 Olfr726-208ENSMUST00000217422 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ctdnep1Q3TP92 Mmp16-201ENSMUST00000029881 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ctdnep1Q3TP92 Olfr738-203ENSMUST00000214853 2046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ctdnep1Q3TP92 Gm17021-202ENSMUST00000214413 2371 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ctdnep1Q3TP92 Gm15073-201ENSMUST00000117432 634 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ctdnep1Q3TP92 Gm12039-201ENSMUST00000118219 180 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ctdnep1Q3TP92 Gm12704-201ENSMUST00000119789 464 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ctdnep1Q3TP92 Gm7189-201ENSMUST00000119811 429 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ctdnep1Q3TP92 Gm13537-201ENSMUST00000120467 267 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ctdnep1Q3TP92 Gm16463-201ENSMUST00000120527 721 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ctdnep1Q3TP92 n-R5s24-201ENSMUST00000122518 117 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ctdnep1Q3TP92 Gm12519-201ENSMUST00000134099 693 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ctdnep1Q3TP92 Gm15017-201ENSMUST00000141989 632 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ctdnep1Q3TP92 Gm12602-202ENSMUST00000154352 707 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ctdnep1Q3TP92 Gas5-209ENSMUST00000159663 346 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ctdnep1Q3TP92 Mrgprb9-ps-201ENSMUST00000188739 892 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ctdnep1Q3TP92 Gm8999-201ENSMUST00000204951 969 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ctdnep1Q3TP92 Gm31749-201ENSMUST00000206873 598 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ctdnep1Q3TP92 Gm44776-201ENSMUST00000207212 381 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ctdnep1Q3TP92 Olfr563-ps1-201ENSMUST00000210909 873 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ctdnep1Q3TP92 AC121264.1-201ENSMUST00000214412 269 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ctdnep1Q3TP92 AC160635.2-201ENSMUST00000216368 734 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1537-201ENSMUST00000073248 945 ntAPPRIS P2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ctdnep1Q3TP92 Gm5941-201ENSMUST00000096371 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ctdnep1Q3TP92 Hrnr-201ENSMUST00000090856 10656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ctdnep1Q3TP92 Gm14643-201ENSMUST00000144412 1848 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ctdnep1Q3TP92 Nlrp1b-203ENSMUST00000108515 4131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ctdnep1Q3TP92 Gm43490-201ENSMUST00000197593 2652 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Ctdnep1Q3TP92 Pnpla8-204ENSMUST00000143771 2974 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ctdnep1Q3TP92 Olfr736-203ENSMUST00000213755 2338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ctdnep1Q3TP92 Gm8369-201ENSMUST00000079855 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1299-201ENSMUST00000207228 1678 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1449-203ENSMUST00000214079 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ctdnep1Q3TP92 Ush2a-201ENSMUST00000060479 15695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ctdnep1Q3TP92 Fam135a-206ENSMUST00000187369 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ctdnep1Q3TP92 Gm25418-201ENSMUST00000104214 129 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Ctdnep1Q3TP92 Olfr328-202ENSMUST00000108824 1199 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ctdnep1Q3TP92 Gm14995-201ENSMUST00000117135 391 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Ctdnep1Q3TP92 Gm7973-201ENSMUST00000122107 488 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Ctdnep1Q3TP92 Gm23965-201ENSMUST00000157969 142 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Ctdnep1Q3TP92 1700111N16Rik-201ENSMUST00000188663 1133 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ctdnep1Q3TP92 Gm38326-201ENSMUST00000194030 686 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ctdnep1Q3TP92 Gm37030-201ENSMUST00000194254 295 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Ctdnep1Q3TP92 Gm37659-201ENSMUST00000194574 111 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Ctdnep1Q3TP92 Gm5842-201ENSMUST00000195073 622 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Ctdnep1Q3TP92 1700126G02Rik-201ENSMUST00000204351 725 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ctdnep1Q3TP92 AC131720.3-201ENSMUST00000219113 275 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Ctdnep1Q3TP92 AC101709.1-201ENSMUST00000220276 909 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ctdnep1Q3TP92 AC154305.3-201ENSMUST00000224661 552 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r234-201ENSMUST00000079633 990 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ctdnep1Q3TP92 Gm42503-201ENSMUST00000199080 3706 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Ctdnep1Q3TP92 Macc1-202ENSMUST00000221866 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1217-202ENSMUST00000213669 3839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ctdnep1Q3TP92 Il1a-201ENSMUST00000028882 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ctdnep1Q3TP92 Gm38128-201ENSMUST00000192085 3250 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Ctdnep1Q3TP92 Gm830-201ENSMUST00000142458 3502 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ctdnep1Q3TP92 Kcnu1-201ENSMUST00000098858 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ctdnep1Q3TP92 Zfp78-201ENSMUST00000086323 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ctdnep1Q3TP92 Macf1-202ENSMUST00000084301 23398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ctdnep1Q3TP92 Zscan4a-201ENSMUST00000210573 2279 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Ctdnep1Q3TP92 Gm43266-201ENSMUST00000201049 1771 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Ctdnep1Q3TP92 Ptprq-201ENSMUST00000050702 7393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ctdnep1Q3TP92 Gm22370-201ENSMUST00000102422 83 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Ctdnep1Q3TP92 Csn1s2b-203ENSMUST00000113279 745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ctdnep1Q3TP92 Gm12820-201ENSMUST00000119233 342 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Ctdnep1Q3TP92 Glipr1-204ENSMUST00000162508 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ctdnep1Q3TP92 Gm4831-201ENSMUST00000174626 594 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Ctdnep1Q3TP92 Arhgap39-209ENSMUST00000177026 371 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ctdnep1Q3TP92 Pou6f2-206ENSMUST00000184299 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ctdnep1Q3TP92 Mir7674-201ENSMUST00000184964 63 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Ctdnep1Q3TP92 1700031M16Rik-204ENSMUST00000189724 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ctdnep1Q3TP92 1700031M16Rik-207ENSMUST00000191513 847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ctdnep1Q3TP92 4930447N08Rik-201ENSMUST00000196290 497 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ctdnep1Q3TP92 Igkv3-8-201ENSMUST00000197635 339 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Ctdnep1Q3TP92 Gm8929-201ENSMUST00000197781 1132 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Ctdnep1Q3TP92 Gm42452-201ENSMUST00000199749 617 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Ctdnep1Q3TP92 Gm9038-201ENSMUST00000203400 604 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Ctdnep1Q3TP92 Gm43945-201ENSMUST00000203595 754 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
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