Protein–RNA interactions for Protein: P48678

Lmna, Prelamin-A/C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LmnaP48678 Olfr1048-202ENSMUST00000215607 2981 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
LmnaP48678 Gm18726-201ENSMUST00000218175 2010 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
LmnaP48678 Serpinb1c-201ENSMUST00000021834 1633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
LmnaP48678 Ctnna2-206ENSMUST00000162273 3277 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
LmnaP48678 Olfr1513-202ENSMUST00000215147 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
LmnaP48678 AC122346.1-201ENSMUST00000225266 3732 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
LmnaP48678 Olfr571-202ENSMUST00000214160 4999 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
LmnaP48678 Fam49a-202ENSMUST00000069066 9452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
LmnaP48678 Dnase1-201ENSMUST00000006136 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
LmnaP48678 Olfr212-203ENSMUST00000220134 2349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
LmnaP48678 Gm12887-201ENSMUST00000106265 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
LmnaP48678 Gm10241-201ENSMUST00000117664 286 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
LmnaP48678 Gm7189-201ENSMUST00000119811 429 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
LmnaP48678 Gm14638-201ENSMUST00000121338 216 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
LmnaP48678 Gm16346-201ENSMUST00000129158 937 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
LmnaP48678 Mup-ps2-201ENSMUST00000142602 533 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
LmnaP48678 Gm14747-201ENSMUST00000149888 984 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
LmnaP48678 Grip1os2-201ENSMUST00000153898 722 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
LmnaP48678 Gm22882-201ENSMUST00000157749 124 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
LmnaP48678 Gm24875-201ENSMUST00000158888 104 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
LmnaP48678 Gm29160-201ENSMUST00000190094 699 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
LmnaP48678 Gm18699-201ENSMUST00000190713 243 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
LmnaP48678 Gm38127-201ENSMUST00000191978 468 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
LmnaP48678 Gm37418-201ENSMUST00000195031 274 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
LmnaP48678 Igkv12-67-201ENSMUST00000197806 354 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
LmnaP48678 Ube2l3-ps1-201ENSMUST00000199777 436 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
LmnaP48678 AC099934.1-201ENSMUST00000200493 79 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
LmnaP48678 Gm44472-201ENSMUST00000204922 943 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
LmnaP48678 Gm9357-201ENSMUST00000207138 805 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
LmnaP48678 Gm18562-201ENSMUST00000209949 915 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
LmnaP48678 Gm2829-201ENSMUST00000213121 499 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
LmnaP48678 AC164881.1-201ENSMUST00000215648 664 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
LmnaP48678 4930543I11Rik-201ENSMUST00000219006 959 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
LmnaP48678 Gm4263-202ENSMUST00000221392 667 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
LmnaP48678 AC155634.2-201ENSMUST00000222001 489 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
LmnaP48678 AC170086.1-201ENSMUST00000225190 497 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
LmnaP48678 CT025630.2-201ENSMUST00000228293 487 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
LmnaP48678 AC125539.2-201ENSMUST00000228339 753 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
LmnaP48678 Dynlrb2-201ENSMUST00000078170 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
LmnaP48678 Olfr715b-201ENSMUST00000081044 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
LmnaP48678 Fpr-rs4-201ENSMUST00000095651 972 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
LmnaP48678 Gm38026-201ENSMUST00000193284 3880 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
LmnaP48678 A630072L19Rik-202ENSMUST00000221309 1519 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
LmnaP48678 Cbll1-202ENSMUST00000085487 1332 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
LmnaP48678 Ftx-205ENSMUST00000156211 4215 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
LmnaP48678 Olfr122-204ENSMUST00000217119 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
LmnaP48678 Trim60-201ENSMUST00000048565 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
LmnaP48678 Gm36981-201ENSMUST00000192340 4485 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
LmnaP48678 Gm4319-201ENSMUST00000191139 2048 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
LmnaP48678 Srrm1-201ENSMUST00000030613 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
LmnaP48678 Olfr1045-202ENSMUST00000215763 2960 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
LmnaP48678 Wfdc8-203ENSMUST00000109339 3227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
LmnaP48678 Vmn1r218-205ENSMUST00000227741 9624 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
LmnaP48678 AC122263.1-201ENSMUST00000228636 2805 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
LmnaP48678 Gm37903-201ENSMUST00000192122 2381 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
LmnaP48678 4930595M18Rik-201ENSMUST00000080083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
LmnaP48678 Gm26530-201ENSMUST00000180969 3941 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
LmnaP48678 Gm10062-201ENSMUST00000072180 1470 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
LmnaP48678 Zfp345-201ENSMUST00000109914 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
LmnaP48678 Bnip3l-201ENSMUST00000022634 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
LmnaP48678 Exoc2-201ENSMUST00000021785 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
LmnaP48678 4930505O20Rik-201ENSMUST00000142188 1758 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
LmnaP48678 Fmr1-203ENSMUST00000114654 4061 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
LmnaP48678 Tlr4-201ENSMUST00000048096 4077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
LmnaP48678 Slmap-202ENSMUST00000090359 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
LmnaP48678 Gm10840-201ENSMUST00000100326 309 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
LmnaP48678 Gm25785-201ENSMUST00000104129 125 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
LmnaP48678 Gm26416-201ENSMUST00000104280 134 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
LmnaP48678 C87499-202ENSMUST00000107142 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
LmnaP48678 Trappc1-204ENSMUST00000108662 635 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
LmnaP48678 Gm15533-201ENSMUST00000126205 465 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
LmnaP48678 Gm11714-201ENSMUST00000136927 876 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
LmnaP48678 Gm26169-201ENSMUST00000158420 135 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
LmnaP48678 Gm16226-201ENSMUST00000159950 760 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
LmnaP48678 Gm3216-201ENSMUST00000166927 486 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
LmnaP48678 Fth-ps2-201ENSMUST00000168364 516 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
LmnaP48678 Rian-214ENSMUST00000183026 596 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
LmnaP48678 Gm29048-201ENSMUST00000185342 615 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
LmnaP48678 Gm29403-201ENSMUST00000185491 615 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
LmnaP48678 Gm28234-201ENSMUST00000185657 615 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
LmnaP48678 Gm3605-201ENSMUST00000185858 440 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
LmnaP48678 Gm28248-201ENSMUST00000186093 615 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
LmnaP48678 Gm29633-202ENSMUST00000186217 615 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
LmnaP48678 Gm28829-201ENSMUST00000186231 615 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
LmnaP48678 Gm28261-201ENSMUST00000186417 615 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
LmnaP48678 Gm28815-201ENSMUST00000186751 615 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
LmnaP48678 Gm28608-201ENSMUST00000186860 615 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
LmnaP48678 Gm28122-201ENSMUST00000187088 615 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
LmnaP48678 Gm28420-201ENSMUST00000187340 615 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
LmnaP48678 Gm28106-201ENSMUST00000187640 615 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
LmnaP48678 Gm5116-201ENSMUST00000187732 463 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
LmnaP48678 Gm28698-201ENSMUST00000187734 615 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
LmnaP48678 Gm29224-201ENSMUST00000187965 615 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
LmnaP48678 Gm29627-201ENSMUST00000187984 463 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
LmnaP48678 Gm29189-201ENSMUST00000188018 615 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
LmnaP48678 Gm29476-201ENSMUST00000188397 615 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
LmnaP48678 Gm29505-201ENSMUST00000188424 615 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
LmnaP48678 Gm28125-201ENSMUST00000188470 615 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
LmnaP48678 Gm29391-201ENSMUST00000188545 615 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
LmnaP48678 Gm29280-201ENSMUST00000188571 615 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.2 ms