Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Gm26691-201ENSMUST00000180471 4401 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm18432-201ENSMUST00000195568 1451 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm43319-201ENSMUST00000198036 2270 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Ptch1-202ENSMUST00000192155 7002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Zzz3-210ENSMUST00000200570 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Hspa13-202ENSMUST00000114244 2674 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Olfr1426-203ENSMUST00000217952 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Il7r-204ENSMUST00000228782 3516 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Ms4a4c-201ENSMUST00000072729 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Zfp113-204ENSMUST00000165640 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Vmn2r114-201ENSMUST00000168033 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm3182-201ENSMUST00000167902 1753 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm8246-202ENSMUST00000180788 1753 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Ift80-202ENSMUST00000107812 4063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm15348-201ENSMUST00000151188 3655 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Mtrr-201ENSMUST00000045827 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Focad-201ENSMUST00000097992 5791 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm29968-201ENSMUST00000222815 1387 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 B130024G19Rik-203ENSMUST00000190320 5451 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Ank3-230ENSMUST00000182795 3557 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 4921511C20Rik-201ENSMUST00000051530 1606 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Lcp1-209ENSMUST00000145303 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 AC158115.1-201ENSMUST00000222830 3182 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Tex28-202ENSMUST00000114328 1421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Ppp1r42-201ENSMUST00000027049 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm10855-201ENSMUST00000100426 2541 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Itpr1-205ENSMUST00000203615 9761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Olfr1155-203ENSMUST00000215903 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Srgap1-201ENSMUST00000020322 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm37086-201ENSMUST00000193082 3452 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Sin3a-201ENSMUST00000049169 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm43335-201ENSMUST00000198299 3276 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Ubxn7-201ENSMUST00000115151 10318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Ncr1-201ENSMUST00000006792 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Tek-203ENSMUST00000102798 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 AC163660.4-201ENSMUST00000224983 2171 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm24079-201ENSMUST00000104352 132 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm2178-201ENSMUST00000104927 357 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Krtap9-5-201ENSMUST00000105052 1077 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm3940-201ENSMUST00000105087 432 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Magea6-202ENSMUST00000112562 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm13835-201ENSMUST00000118459 685 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm16373-201ENSMUST00000129517 303 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 1700061H18Rik-202ENSMUST00000147221 564 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm22361-201ENSMUST00000158435 176 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gml-202ENSMUST00000164026 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm17217-201ENSMUST00000166613 469 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Trat1-201ENSMUST00000170861 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm20490-201ENSMUST00000173622 198 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm21094-201ENSMUST00000177842 498 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm20837-201ENSMUST00000178446 498 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm21739-201ENSMUST00000178639 498 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm28891-201ENSMUST00000178751 498 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm28490-201ENSMUST00000179076 498 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm21861-201ENSMUST00000179480 498 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm21256-201ENSMUST00000179672 498 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm20838-201ENSMUST00000179884 498 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm21679-201ENSMUST00000180373 498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm5734-201ENSMUST00000189787 913 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Sytl2-206ENSMUST00000190731 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm36891-201ENSMUST00000191995 655 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Ighv1-79-201ENSMUST00000200152 350 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm30646-201ENSMUST00000207662 180 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm46146-201ENSMUST00000217483 346 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 AC153821.2-201ENSMUST00000220253 468 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 CT030170.6-203ENSMUST00000222523 1295 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
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Hoxd9P28357 AC159188.3-201ENSMUST00000224199 880 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Olfr39-201ENSMUST00000071725 1098 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Olfr1353-201ENSMUST00000039718 1992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm9408-201ENSMUST00000197375 1505 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Zfp935-202ENSMUST00000221747 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Olfr1037-204ENSMUST00000216886 1755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm8853-201ENSMUST00000198366 1344 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 AC139750.1-201ENSMUST00000223962 1300 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm26994-201ENSMUST00000182027 1571 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Zc4h2-202ENSMUST00000119640 2075 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm20489-201ENSMUST00000117736 1350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Olfr1037-202ENSMUST00000213333 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Hsf2-201ENSMUST00000079833 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Adam21-201ENSMUST00000008582 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm10735-201ENSMUST00000099162 2943 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Golph3l-201ENSMUST00000060323 2652 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm28940-201ENSMUST00000187929 1682 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 CT009765.1-201ENSMUST00000219088 2705 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Olfr656-202ENSMUST00000215575 4091 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Olfr821-202ENSMUST00000205181 1993 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Vmn2r-ps94-201ENSMUST00000116665 1456 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Ide-201ENSMUST00000131070 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Akap9-201ENSMUST00000044492 13123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gabpb2-202ENSMUST00000098873 8272 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Exoc2-201ENSMUST00000021785 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm16325-201ENSMUST00000141199 3174 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Gm31805-201ENSMUST00000211921 4031 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Adam30-201ENSMUST00000050342 3510 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Ighv1-31-201ENSMUST00000103511 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Ighv1-42-201ENSMUST00000103516 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Ighv1-43-201ENSMUST00000103517 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxd9P28357 Ighv1-66-201ENSMUST00000103537 399 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms