Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Shprh-201ENSMUST00000044053 9271 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
P10404 4921534A09Rik-201ENSMUST00000213976 2495 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
P10404 Kidins220-201ENSMUST00000066652 7409 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
P10404 Dlg2-204ENSMUST00000107196 7490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
P10404 Mir708-201ENSMUST00000102189 109 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
P10404 Igkv5-37-201ENSMUST00000103372 359 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
P10404 Gm22781-201ENSMUST00000104083 137 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
P10404 Smim24-202ENSMUST00000118206 949 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
P10404 Olfr383-ps1-201ENSMUST00000118895 935 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
P10404 Gm15149-201ENSMUST00000119370 360 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
P10404 Gm7700-201ENSMUST00000120273 970 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
P10404 Gm5287-201ENSMUST00000120666 598 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
P10404 Gm12900-201ENSMUST00000120919 573 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
P10404 Gm15141-201ENSMUST00000121860 729 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
P10404 Gm13746-201ENSMUST00000133981 605 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
P10404 Gm26321-201ENSMUST00000157740 242 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
P10404 Gm23762-201ENSMUST00000158348 106 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
P10404 Ccdc152-201ENSMUST00000165386 798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
P10404 Gm9672-201ENSMUST00000166437 425 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
P10404 Gm9613-201ENSMUST00000171662 196 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
P10404 Vmn1r-ps59-201ENSMUST00000172698 199 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
P10404 Hspe1-ps3-201ENSMUST00000172726 277 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
P10404 Gm21815-201ENSMUST00000178213 664 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
P10404 Gm27342-201ENSMUST00000183530 109 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
P10404 Gm27957-201ENSMUST00000184054 127 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
P10404 Mir7033-201ENSMUST00000184259 81 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
P10404 Scgb3a2-202ENSMUST00000187157 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
P10404 Gm9114-201ENSMUST00000188558 997 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
P10404 A430093F15Rik-206ENSMUST00000189565 651 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
P10404 Gm18291-201ENSMUST00000190791 301 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
P10404 7330423F06Rik-201ENSMUST00000197499 301 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
P10404 Gm42999-201ENSMUST00000198049 786 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
P10404 Rpl9-ps8-201ENSMUST00000198343 562 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
P10404 1700028E10Rik-204ENSMUST00000201853 767 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
P10404 Ndufa4-204ENSMUST00000204714 452 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
P10404 Gm44984-201ENSMUST00000207802 394 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
P10404 Gm2774-201ENSMUST00000213650 1165 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
P10404 Gm46203-201ENSMUST00000218130 478 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
P10404 Erh-204ENSMUST00000218364 665 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
P10404 Olfr1324-203ENSMUST00000219631 1152 ntAPPRIS P2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
P10404 Gm46430-203ENSMUST00000221389 1049 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
P10404 AC154558.1-201ENSMUST00000222278 415 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
P10404 Vmn1r31-204ENSMUST00000226390 912 ntAPPRIS P2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
P10404 AC135292.2-201ENSMUST00000227559 367 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
P10404 Olfr1324-201ENSMUST00000050044 1152 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
P10404 Vmn1r230-201ENSMUST00000053974 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
P10404 1700014D04Rik-201ENSMUST00000055343 795 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
P10404 Olfr1206-201ENSMUST00000077302 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
P10404 Gm14851-201ENSMUST00000077452 351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
P10404 Olfr382-201ENSMUST00000092921 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
P10404 Gm10794-201ENSMUST00000099624 207 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
P10404 Vmn2r104-201ENSMUST00000168050 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
P10404 4932435O22Rik-202ENSMUST00000148405 3406 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
P10404 Them5-202ENSMUST00000198083 1378 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
P10404 Awat1-201ENSMUST00000096361 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
P10404 9230020A06Rik-201ENSMUST00000151841 2051 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
P10404 Trps1-207ENSMUST00000184885 3492 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
P10404 Ms4a18-201ENSMUST00000177684 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
P10404 Gm21750-201ENSMUST00000098874 1497 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
P10404 Gm37132-201ENSMUST00000195553 2238 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
P10404 Fcrl5-202ENSMUST00000166297 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
P10404 Csde1-206ENSMUST00000197488 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
P10404 Ube2n-201ENSMUST00000099329 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
P10404 E430024I08Rik-208ENSMUST00000223312 1573 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
P10404 Qsox2-202ENSMUST00000091263 4011 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
P10404 Olfr535-203ENSMUST00000213715 5033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
P10404 CT009734.1-201ENSMUST00000227657 1687 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
P10404 9430053O09Rik-201ENSMUST00000192654 2570 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
P10404 Slc25a40-202ENSMUST00000170496 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
P10404 Olfr348-204ENSMUST00000215199 3557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
P10404 Eif4a2-203ENSMUST00000115341 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
P10404 Gm38062-201ENSMUST00000192541 1856 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
P10404 A730091E23Rik-201ENSMUST00000221700 3825 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
P10404 Fgb-201ENSMUST00000048246 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
P10404 Gm17435-201ENSMUST00000181452 2994 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
P10404 Vmn1r34-207ENSMUST00000228647 2979 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
P10404 AC163354.1-204ENSMUST00000222226 2033 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
P10404 Pramel5-201ENSMUST00000035757 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
P10404 Gm43880-201ENSMUST00000203635 2162 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
P10404 Ndst3-203ENSMUST00000132112 4460 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
P10404 Dock7-205ENSMUST00000127417 6796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
P10404 Vmn1r6-204ENSMUST00000227188 8185 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
P10404 Nlrp1b-201ENSMUST00000094046 3525 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
P10404 AC165260.6-206ENSMUST00000223884 3698 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
P10404 Macf1-202ENSMUST00000084301 23398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
P10404 Arhgef9-203ENSMUST00000113878 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
P10404 Gm9144-201ENSMUST00000101625 1008 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
P10404 Snord116l9-201ENSMUST00000101891 94 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
P10404 Gm26002-201ENSMUST00000101915 107 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
P10404 Gm26504-201ENSMUST00000102033 94 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
P10404 Igkv3-5-201ENSMUST00000103400 382 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
P10404 Gm25344-201ENSMUST00000104503 132 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
P10404 Gm14756-201ENSMUST00000116395 240 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
P10404 Gm12447-201ENSMUST00000119110 470 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
P10404 Gm14331-201ENSMUST00000120396 409 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
P10404 Gm14070-201ENSMUST00000120773 428 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
P10404 Gm14530-201ENSMUST00000122391 333 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
P10404 4930423M02Rik-202ENSMUST00000156903 1205 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
P10404 Cfap61-214ENSMUST00000167179 183 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
P10404 Cd200r3-210ENSMUST00000171779 1223 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.3 ms