Protein–RNA interactions for Protein: O55203

Ldb2, LIM domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb2O55203 CT030238.4-203ENSMUST00000227343 836 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Ldb2O55203 Olfr204-201ENSMUST00000072517 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Ldb2O55203 Gm26203-201ENSMUST00000082911 114 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Ldb2O55203 Maoa-201ENSMUST00000026013 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Ldb2O55203 Gm9408-201ENSMUST00000197375 1505 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Ldb2O55203 4933430A20Rik-201ENSMUST00000210943 1558 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Ldb2O55203 Gm46430-206ENSMUST00000222064 1647 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Ldb2O55203 Zscan4e-202ENSMUST00000210521 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Ldb2O55203 Gm20287-201ENSMUST00000172848 2367 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Ldb2O55203 Gm14886-201ENSMUST00000117208 2629 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Ldb2O55203 Olfr537-ps1-201ENSMUST00000209871 2792 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Ldb2O55203 Vmn1r34-202ENSMUST00000226262 2952 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Ldb2O55203 Olfr906-202ENSMUST00000214344 3775 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Ldb2O55203 Fam205a3-201ENSMUST00000178192 3927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Ldb2O55203 Fam205a2-202ENSMUST00000180201 3927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Ldb2O55203 Tlr13-201ENSMUST00000040065 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Ldb2O55203 Rgs17-204ENSMUST00000131996 8107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Ldb2O55203 Chd9-201ENSMUST00000048665 12008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Ldb2O55203 Olfr536-201ENSMUST00000064392 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ldb2O55203 Ogt-202ENSMUST00000119299 3840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ldb2O55203 Zbed4-ps1-201ENSMUST00000186734 3466 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Ldb2O55203 Olfr1427-202ENSMUST00000215374 3342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ldb2O55203 Gm17017-201ENSMUST00000161540 2405 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ldb2O55203 Slc22a29-201ENSMUST00000113298 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ldb2O55203 Rbm46-202ENSMUST00000182637 2058 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ldb2O55203 Gm43682-201ENSMUST00000202150 2090 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Ldb2O55203 Olfr1214-203ENSMUST00000217469 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ldb2O55203 Gm35842-201ENSMUST00000207859 4464 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ldb2O55203 AW551984-202ENSMUST00000119722 4224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ldb2O55203 Odam-202ENSMUST00000129757 1370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ldb2O55203 AC117608.2-201ENSMUST00000224124 1363 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Ldb2O55203 Gm8660-201ENSMUST00000105187 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ldb2O55203 Gm4177-201ENSMUST00000105196 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ldb2O55203 Vmn1r127-201ENSMUST00000105199 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ldb2O55203 Gm5728-201ENSMUST00000105209 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ldb2O55203 Spin2d-201ENSMUST00000114517 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ldb2O55203 Gm11433-201ENSMUST00000118318 228 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Ldb2O55203 Gm13579-201ENSMUST00000118519 517 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Ldb2O55203 Gm12465-201ENSMUST00000118591 300 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Ldb2O55203 Gm13059-201ENSMUST00000119881 398 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Ldb2O55203 Gm14831-201ENSMUST00000120253 409 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Ldb2O55203 Mup-ps19-201ENSMUST00000120390 519 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Ldb2O55203 Gm13430-201ENSMUST00000121366 288 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Ldb2O55203 Eif1-ps3-201ENSMUST00000121450 342 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Ldb2O55203 Gm12413-201ENSMUST00000121508 312 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Ldb2O55203 Gm12701-201ENSMUST00000134206 659 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ldb2O55203 Far1os-201ENSMUST00000138253 893 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ldb2O55203 Gm14223-201ENSMUST00000146060 517 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ldb2O55203 Gm24236-201ENSMUST00000157794 134 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Ldb2O55203 Gm17555-201ENSMUST00000164042 1113 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ldb2O55203 Vmn1r5-201ENSMUST00000164307 1056 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ldb2O55203 Vmn1r94-201ENSMUST00000164526 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ldb2O55203 Gm4216-201ENSMUST00000168926 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ldb2O55203 Vmn1r142-201ENSMUST00000169697 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ldb2O55203 Gm21756-201ENSMUST00000178380 930 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Ldb2O55203 Gm21405-201ENSMUST00000179024 930 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Ldb2O55203 Gm26554-201ENSMUST00000180801 845 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ldb2O55203 Gm21191-201ENSMUST00000186484 930 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Ldb2O55203 Gm20561-201ENSMUST00000188131 292 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Ldb2O55203 Gm28803-201ENSMUST00000190385 764 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Ldb2O55203 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ldb2O55203 Gm28490-202ENSMUST00000190946 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ldb2O55203 Gm29503-201ENSMUST00000191044 930 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Ldb2O55203 Gm37681-201ENSMUST00000193880 727 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Ldb2O55203 Gm9317-201ENSMUST00000197055 862 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Ldb2O55203 Igkv3-8-201ENSMUST00000197635 339 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Ldb2O55203 Gm35648-201ENSMUST00000202304 475 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Ldb2O55203 Gm44796-201ENSMUST00000205272 626 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ldb2O55203 Gm44969-201ENSMUST00000207829 549 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ldb2O55203 Gm44992-209ENSMUST00000209680 1083 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ldb2O55203 Gm45247-201ENSMUST00000210757 309 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Ldb2O55203 Gm45721-201ENSMUST00000212267 607 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ldb2O55203 AC159819.1-201ENSMUST00000213911 328 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
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Ldb2O55203 AC156572.1-201ENSMUST00000221040 1161 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ldb2O55203 AC164164.2-201ENSMUST00000221809 785 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Ldb2O55203 Gm36501-201ENSMUST00000221857 745 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Ldb2O55203 AC154184.2-201ENSMUST00000225335 349 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Ldb2O55203 AC154239.1-201ENSMUST00000228565 406 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Ldb2O55203 Sprr2d-201ENSMUST00000047477 681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ldb2O55203 4930578G10Rik-201ENSMUST00000068158 614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ldb2O55203 Olfr871-201ENSMUST00000073122 1147 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ldb2O55203 Gm25799-201ENSMUST00000082643 107 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Ldb2O55203 Tas2r140-201ENSMUST00000095391 1000 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ldb2O55203 Zfp867-201ENSMUST00000057799 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ldb2O55203 Olfr1204-202ENSMUST00000213283 6935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ldb2O55203 Olfr877-202ENSMUST00000213956 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ldb2O55203 Vmn2r79-201ENSMUST00000164462 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ldb2O55203 Vmn1r200-205ENSMUST00000228726 5525 ntAPPRIS P2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ldb2O55203 Cntnap5c-201ENSMUST00000076038 3931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ldb2O55203 Gm43333-201ENSMUST00000198340 2262 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Ldb2O55203 Gm38029-201ENSMUST00000192669 2090 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Ldb2O55203 R3hdm1-201ENSMUST00000036288 4795 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ldb2O55203 Gm35256-201ENSMUST00000212780 3269 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ldb2O55203 Olfr1385-202ENSMUST00000214948 4412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Ldb2O55203 Gm15182-201ENSMUST00000120832 1676 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Ldb2O55203 Nfia-201ENSMUST00000052018 9249 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Ldb2O55203 Gm38299-201ENSMUST00000193214 3789 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Ldb2O55203 Npsr1-201ENSMUST00000059650 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Ldb2O55203 AI987944-201ENSMUST00000071804 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
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