Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Olfr107-204ENSMUST00000215974 2282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Gm19272-201ENSMUST00000184133 1753 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Olfr770-202ENSMUST00000203887 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Il1rapl1-203ENSMUST00000113966 9133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Rnf148-201ENSMUST00000104979 1239 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Macrod2-203ENSMUST00000110061 887 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Tmsb15b1-201ENSMUST00000113071 439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Gm11911-201ENSMUST00000117938 1023 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Ube2v2-204ENSMUST00000118236 893 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Gm14874-201ENSMUST00000118995 438 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Gm12507-201ENSMUST00000119155 415 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Gm13077-201ENSMUST00000121941 484 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 n-R5s24-201ENSMUST00000122518 117 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 4930587A21Rik-201ENSMUST00000128588 851 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Scarna13-201ENSMUST00000158164 275 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 B230110C06Rik-202ENSMUST00000181936 938 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Gm26972-201ENSMUST00000183218 344 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Zcchc10-201ENSMUST00000018383 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Gm27315-201ENSMUST00000183977 154 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Mir6398-201ENSMUST00000184541 102 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Gm37241-201ENSMUST00000191736 523 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 C030032O16Rik-201ENSMUST00000196427 716 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Gm42625-201ENSMUST00000198611 922 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Gm2622-201ENSMUST00000200018 471 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Nts-201ENSMUST00000020040 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Gm5-202ENSMUST00000202386 420 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Gm44281-201ENSMUST00000203090 166 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Klra14-ps-202ENSMUST00000203601 1104 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Zfand4-204ENSMUST00000221069 501 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Gm34719-201ENSMUST00000222231 382 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Smr3a-201ENSMUST00000031211 635 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Prl3b1-201ENSMUST00000035273 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Olfr866-201ENSMUST00000062248 1077 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Olfr801-201ENSMUST00000072063 957 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Gm23511-201ENSMUST00000083084 164 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Gm21269-201ENSMUST00000206521 12456 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 A230107N01Rik-201ENSMUST00000180894 2348 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Olfr655-204ENSMUST00000216750 2010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Il18r1-206ENSMUST00000195684 2850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Ncoa7-208ENSMUST00000215926 2875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Olfr1283-202ENSMUST00000204064 1625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Ifi205-201ENSMUST00000059226 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Mme-205ENSMUST00000194134 8039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Olfr635-202ENSMUST00000209473 8565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Tmem74-201ENSMUST00000067469 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Hc-201ENSMUST00000028233 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 B130006D01Rik-201ENSMUST00000100534 3124 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Zkscan8-204ENSMUST00000224362 6954 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Olfr984-203ENSMUST00000214856 5025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Gm45424-201ENSMUST00000210575 3300 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Mmp12-203ENSMUST00000120655 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Gm28673-201ENSMUST00000186562 1498 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Gm37344-203ENSMUST00000195490 1498 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Olfr432-202ENSMUST00000213211 4435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Usp29-204ENSMUST00000200535 7540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Kcnrg-202ENSMUST00000225582 1821 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Ighv5-9-1-201ENSMUST00000103452 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Gm22272-201ENSMUST00000104039 134 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Gm24429-201ENSMUST00000104076 132 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Gm15480-201ENSMUST00000120442 519 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Mageb6-ps-201ENSMUST00000126612 1032 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Gm12256-201ENSMUST00000132394 446 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Gm11846-201ENSMUST00000155156 515 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Vmn1r-ps75-201ENSMUST00000174316 920 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Gm16456-201ENSMUST00000174431 920 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Vmn1r-ps17-201ENSMUST00000175797 894 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Gm20674-201ENSMUST00000177452 369 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Gm26954-201ENSMUST00000182106 622 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Mir7012-201ENSMUST00000183900 64 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 2010005H15Rik-202ENSMUST00000187183 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Gm28835-202ENSMUST00000189206 543 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Gm34176-201ENSMUST00000192621 474 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Igkv2-107-201ENSMUST00000196000 313 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Gm17775-201ENSMUST00000198542 258 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Gm43698-202ENSMUST00000202864 555 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Gm43262-201ENSMUST00000202970 1219 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Gm44717-201ENSMUST00000208133 578 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Gm45883-201ENSMUST00000210131 853 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Gm5457-201ENSMUST00000022260 333 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 AC154335.1-201ENSMUST00000224744 395 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 AC154184.2-201ENSMUST00000225335 349 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 AC154626.1-201ENSMUST00000226070 311 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Bcl2l15-201ENSMUST00000062945 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Olfr1451-201ENSMUST00000063144 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Gm4861-201ENSMUST00000068546 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Olfr68-201ENSMUST00000072513 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Olfr749-201ENSMUST00000074674 1016 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Olfr792-201ENSMUST00000076575 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Snord15b-201ENSMUST00000083032 145 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Olfr640-201ENSMUST00000084799 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Olfr111-201ENSMUST00000097325 1041 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Gm29293-201ENSMUST00000189416 2188 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Fmo9-201ENSMUST00000027843 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Gm20644-201ENSMUST00000176721 2063 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Olfr767-202ENSMUST00000213579 5493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Gm13575-201ENSMUST00000142353 1520 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Gm43874-201ENSMUST00000204853 2798 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Olfr417-203ENSMUST00000220394 6080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Rfx3-202ENSMUST00000165566 9146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Opn1mwO35599 Gm37079-201ENSMUST00000194114 2135 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.6 ms