Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrit3W8DXL4 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrit3W8DXL4 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrit3W8DXL4 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrit3W8DXL4 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrit3W8DXL4 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrit3W8DXL4 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrit3W8DXL4 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrit3W8DXL4 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrit3W8DXL4 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrit3W8DXL4 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrit3W8DXL4 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrit3W8DXL4 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrit3W8DXL4 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrit3W8DXL4 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrit3W8DXL4 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrit3W8DXL4 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrit3W8DXL4 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrit3W8DXL4 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrit3W8DXL4 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrit3W8DXL4 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrit3W8DXL4 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrit3W8DXL4 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrit3W8DXL4 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrit3W8DXL4 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrit3W8DXL4 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrit3W8DXL4 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrit3W8DXL4 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrit3W8DXL4 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrit3W8DXL4 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrit3W8DXL4 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrit3W8DXL4 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrit3W8DXL4 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrit3W8DXL4 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrit3W8DXL4 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrit3W8DXL4 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrit3W8DXL4 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrit3W8DXL4 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrit3W8DXL4 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrit3W8DXL4 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrit3W8DXL4 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrit3W8DXL4 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrit3W8DXL4 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrit3W8DXL4 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrit3W8DXL4 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrit3W8DXL4 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrit3W8DXL4 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrit3W8DXL4 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrit3W8DXL4 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrit3W8DXL4 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrit3W8DXL4 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrit3W8DXL4 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrit3W8DXL4 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrit3W8DXL4 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrit3W8DXL4 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrit3W8DXL4 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrit3W8DXL4 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrit3W8DXL4 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrit3W8DXL4 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrit3W8DXL4 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrit3W8DXL4 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrit3W8DXL4 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrit3W8DXL4 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrit3W8DXL4 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrit3W8DXL4 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrit3W8DXL4 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrit3W8DXL4 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrit3W8DXL4 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrit3W8DXL4 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrit3W8DXL4 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrit3W8DXL4 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrit3W8DXL4 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrit3W8DXL4 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrit3W8DXL4 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrit3W8DXL4 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrit3W8DXL4 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrit3W8DXL4 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrit3W8DXL4 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrit3W8DXL4 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrit3W8DXL4 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrit3W8DXL4 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lrit3W8DXL4 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lrit3W8DXL4 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrit3W8DXL4 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrit3W8DXL4 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrit3W8DXL4 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrit3W8DXL4 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrit3W8DXL4 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrit3W8DXL4 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrit3W8DXL4 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrit3W8DXL4 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrit3W8DXL4 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrit3W8DXL4 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrit3W8DXL4 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrit3W8DXL4 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrit3W8DXL4 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrit3W8DXL4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrit3W8DXL4 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrit3W8DXL4 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrit3W8DXL4 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
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