Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z320

Krt27, Keratin, type I cytoskeletal 27, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt27Q9Z320 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt27Q9Z320 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt27Q9Z320 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt27Q9Z320 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt27Q9Z320 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt27Q9Z320 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt27Q9Z320 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt27Q9Z320 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt27Q9Z320 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt27Q9Z320 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt27Q9Z320 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt27Q9Z320 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt27Q9Z320 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt27Q9Z320 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt27Q9Z320 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt27Q9Z320 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt27Q9Z320 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt27Q9Z320 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt27Q9Z320 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt27Q9Z320 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt27Q9Z320 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt27Q9Z320 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt27Q9Z320 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt27Q9Z320 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt27Q9Z320 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt27Q9Z320 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt27Q9Z320 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt27Q9Z320 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt27Q9Z320 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt27Q9Z320 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt27Q9Z320 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt27Q9Z320 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt27Q9Z320 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt27Q9Z320 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt27Q9Z320 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt27Q9Z320 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt27Q9Z320 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt27Q9Z320 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt27Q9Z320 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt27Q9Z320 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt27Q9Z320 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt27Q9Z320 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt27Q9Z320 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt27Q9Z320 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt27Q9Z320 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt27Q9Z320 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt27Q9Z320 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt27Q9Z320 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt27Q9Z320 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt27Q9Z320 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt27Q9Z320 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt27Q9Z320 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt27Q9Z320 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krt27Q9Z320 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krt27Q9Z320 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krt27Q9Z320 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krt27Q9Z320 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Krt27Q9Z320 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krt27Q9Z320 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krt27Q9Z320 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Krt27Q9Z320 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krt27Q9Z320 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krt27Q9Z320 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Krt27Q9Z320 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krt27Q9Z320 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krt27Q9Z320 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krt27Q9Z320 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Krt27Q9Z320 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krt27Q9Z320 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krt27Q9Z320 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krt27Q9Z320 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krt27Q9Z320 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krt27Q9Z320 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krt27Q9Z320 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krt27Q9Z320 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krt27Q9Z320 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krt27Q9Z320 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krt27Q9Z320 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krt27Q9Z320 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krt27Q9Z320 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krt27Q9Z320 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krt27Q9Z320 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krt27Q9Z320 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krt27Q9Z320 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krt27Q9Z320 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krt27Q9Z320 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krt27Q9Z320 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krt27Q9Z320 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krt27Q9Z320 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krt27Q9Z320 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krt27Q9Z320 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krt27Q9Z320 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krt27Q9Z320 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Krt27Q9Z320 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krt27Q9Z320 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krt27Q9Z320 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krt27Q9Z320 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krt27Q9Z320 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt27Q9Z320 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt27Q9Z320 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms