Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z309

Cib2, Calcium and integrin-binding family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cib2Q9Z309 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cib2Q9Z309 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cib2Q9Z309 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cib2Q9Z309 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cib2Q9Z309 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cib2Q9Z309 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cib2Q9Z309 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cib2Q9Z309 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cib2Q9Z309 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cib2Q9Z309 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cib2Q9Z309 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cib2Q9Z309 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cib2Q9Z309 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cib2Q9Z309 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cib2Q9Z309 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cib2Q9Z309 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cib2Q9Z309 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cib2Q9Z309 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cib2Q9Z309 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cib2Q9Z309 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cib2Q9Z309 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cib2Q9Z309 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cib2Q9Z309 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cib2Q9Z309 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cib2Q9Z309 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cib2Q9Z309 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cib2Q9Z309 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cib2Q9Z309 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cib2Q9Z309 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cib2Q9Z309 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cib2Q9Z309 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cib2Q9Z309 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cib2Q9Z309 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cib2Q9Z309 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cib2Q9Z309 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cib2Q9Z309 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cib2Q9Z309 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cib2Q9Z309 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cib2Q9Z309 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cib2Q9Z309 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cib2Q9Z309 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cib2Q9Z309 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cib2Q9Z309 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cib2Q9Z309 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cib2Q9Z309 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cib2Q9Z309 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cib2Q9Z309 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cib2Q9Z309 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cib2Q9Z309 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cib2Q9Z309 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cib2Q9Z309 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cib2Q9Z309 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cib2Q9Z309 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cib2Q9Z309 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cib2Q9Z309 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cib2Q9Z309 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cib2Q9Z309 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cib2Q9Z309 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cib2Q9Z309 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cib2Q9Z309 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cib2Q9Z309 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cib2Q9Z309 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cib2Q9Z309 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cib2Q9Z309 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cib2Q9Z309 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cib2Q9Z309 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cib2Q9Z309 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cib2Q9Z309 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cib2Q9Z309 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cib2Q9Z309 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cib2Q9Z309 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cib2Q9Z309 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cib2Q9Z309 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cib2Q9Z309 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cib2Q9Z309 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cib2Q9Z309 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cib2Q9Z309 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cib2Q9Z309 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cib2Q9Z309 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cib2Q9Z309 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cib2Q9Z309 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Cib2Q9Z309 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cib2Q9Z309 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cib2Q9Z309 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cib2Q9Z309 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cib2Q9Z309 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cib2Q9Z309 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cib2Q9Z309 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cib2Q9Z309 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cib2Q9Z309 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cib2Q9Z309 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cib2Q9Z309 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cib2Q9Z309 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cib2Q9Z309 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cib2Q9Z309 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cib2Q9Z309 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cib2Q9Z309 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cib2Q9Z309 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cib2Q9Z309 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cib2Q9Z309 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms