Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V9

Ccni, Cyclin-I, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcniQ9Z2V9 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CcniQ9Z2V9 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CcniQ9Z2V9 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CcniQ9Z2V9 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CcniQ9Z2V9 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CcniQ9Z2V9 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CcniQ9Z2V9 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CcniQ9Z2V9 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CcniQ9Z2V9 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CcniQ9Z2V9 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CcniQ9Z2V9 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CcniQ9Z2V9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CcniQ9Z2V9 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CcniQ9Z2V9 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CcniQ9Z2V9 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CcniQ9Z2V9 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CcniQ9Z2V9 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CcniQ9Z2V9 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CcniQ9Z2V9 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CcniQ9Z2V9 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CcniQ9Z2V9 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CcniQ9Z2V9 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CcniQ9Z2V9 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CcniQ9Z2V9 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CcniQ9Z2V9 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CcniQ9Z2V9 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CcniQ9Z2V9 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CcniQ9Z2V9 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CcniQ9Z2V9 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CcniQ9Z2V9 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CcniQ9Z2V9 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CcniQ9Z2V9 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CcniQ9Z2V9 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CcniQ9Z2V9 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CcniQ9Z2V9 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CcniQ9Z2V9 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CcniQ9Z2V9 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CcniQ9Z2V9 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CcniQ9Z2V9 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CcniQ9Z2V9 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CcniQ9Z2V9 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CcniQ9Z2V9 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CcniQ9Z2V9 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CcniQ9Z2V9 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CcniQ9Z2V9 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CcniQ9Z2V9 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CcniQ9Z2V9 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CcniQ9Z2V9 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CcniQ9Z2V9 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CcniQ9Z2V9 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CcniQ9Z2V9 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CcniQ9Z2V9 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CcniQ9Z2V9 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CcniQ9Z2V9 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CcniQ9Z2V9 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CcniQ9Z2V9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CcniQ9Z2V9 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CcniQ9Z2V9 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CcniQ9Z2V9 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CcniQ9Z2V9 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CcniQ9Z2V9 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CcniQ9Z2V9 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CcniQ9Z2V9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CcniQ9Z2V9 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CcniQ9Z2V9 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CcniQ9Z2V9 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CcniQ9Z2V9 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CcniQ9Z2V9 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CcniQ9Z2V9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CcniQ9Z2V9 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CcniQ9Z2V9 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CcniQ9Z2V9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CcniQ9Z2V9 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CcniQ9Z2V9 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CcniQ9Z2V9 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CcniQ9Z2V9 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CcniQ9Z2V9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CcniQ9Z2V9 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CcniQ9Z2V9 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CcniQ9Z2V9 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CcniQ9Z2V9 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CcniQ9Z2V9 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CcniQ9Z2V9 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CcniQ9Z2V9 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CcniQ9Z2V9 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CcniQ9Z2V9 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CcniQ9Z2V9 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CcniQ9Z2V9 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CcniQ9Z2V9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CcniQ9Z2V9 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CcniQ9Z2V9 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CcniQ9Z2V9 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CcniQ9Z2V9 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CcniQ9Z2V9 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CcniQ9Z2V9 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CcniQ9Z2V9 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CcniQ9Z2V9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CcniQ9Z2V9 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CcniQ9Z2V9 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CcniQ9Z2V9 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms