Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2S7

Tsc22d3, TSC22 domain family protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsc22d3Q9Z2S7 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tsc22d3Q9Z2S7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tsc22d3Q9Z2S7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tsc22d3Q9Z2S7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tsc22d3Q9Z2S7 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tsc22d3Q9Z2S7 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tsc22d3Q9Z2S7 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tsc22d3Q9Z2S7 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tsc22d3Q9Z2S7 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tsc22d3Q9Z2S7 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tsc22d3Q9Z2S7 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsc22d3Q9Z2S7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsc22d3Q9Z2S7 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsc22d3Q9Z2S7 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsc22d3Q9Z2S7 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsc22d3Q9Z2S7 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsc22d3Q9Z2S7 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsc22d3Q9Z2S7 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsc22d3Q9Z2S7 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsc22d3Q9Z2S7 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsc22d3Q9Z2S7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsc22d3Q9Z2S7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsc22d3Q9Z2S7 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsc22d3Q9Z2S7 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsc22d3Q9Z2S7 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsc22d3Q9Z2S7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsc22d3Q9Z2S7 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsc22d3Q9Z2S7 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsc22d3Q9Z2S7 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsc22d3Q9Z2S7 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsc22d3Q9Z2S7 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsc22d3Q9Z2S7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsc22d3Q9Z2S7 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsc22d3Q9Z2S7 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsc22d3Q9Z2S7 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsc22d3Q9Z2S7 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsc22d3Q9Z2S7 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsc22d3Q9Z2S7 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsc22d3Q9Z2S7 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsc22d3Q9Z2S7 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsc22d3Q9Z2S7 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsc22d3Q9Z2S7 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tsc22d3Q9Z2S7 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tsc22d3Q9Z2S7 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tsc22d3Q9Z2S7 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tsc22d3Q9Z2S7 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tsc22d3Q9Z2S7 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tsc22d3Q9Z2S7 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tsc22d3Q9Z2S7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tsc22d3Q9Z2S7 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tsc22d3Q9Z2S7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tsc22d3Q9Z2S7 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tsc22d3Q9Z2S7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tsc22d3Q9Z2S7 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tsc22d3Q9Z2S7 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tsc22d3Q9Z2S7 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tsc22d3Q9Z2S7 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tsc22d3Q9Z2S7 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tsc22d3Q9Z2S7 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tsc22d3Q9Z2S7 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tsc22d3Q9Z2S7 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tsc22d3Q9Z2S7 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tsc22d3Q9Z2S7 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tsc22d3Q9Z2S7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tsc22d3Q9Z2S7 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tsc22d3Q9Z2S7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tsc22d3Q9Z2S7 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tsc22d3Q9Z2S7 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tsc22d3Q9Z2S7 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tsc22d3Q9Z2S7 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tsc22d3Q9Z2S7 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tsc22d3Q9Z2S7 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms