Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mbd1Q9Z2E2 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mbd1Q9Z2E2 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mbd1Q9Z2E2 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mbd1Q9Z2E2 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mbd1Q9Z2E2 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mbd1Q9Z2E2 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mbd1Q9Z2E2 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mbd1Q9Z2E2 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mbd1Q9Z2E2 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Mbd1Q9Z2E2 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Mbd1Q9Z2E2 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mbd1Q9Z2E2 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mbd1Q9Z2E2 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mbd1Q9Z2E2 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mbd1Q9Z2E2 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mbd1Q9Z2E2 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mbd1Q9Z2E2 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mbd1Q9Z2E2 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mbd1Q9Z2E2 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mbd1Q9Z2E2 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mbd1Q9Z2E2 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mbd1Q9Z2E2 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mbd1Q9Z2E2 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mbd1Q9Z2E2 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mbd1Q9Z2E2 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mbd1Q9Z2E2 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mbd1Q9Z2E2 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mbd1Q9Z2E2 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mbd1Q9Z2E2 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mbd1Q9Z2E2 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mbd1Q9Z2E2 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mbd1Q9Z2E2 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mbd1Q9Z2E2 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Mbd1Q9Z2E2 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mbd1Q9Z2E2 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mbd1Q9Z2E2 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mbd1Q9Z2E2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mbd1Q9Z2E2 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mbd1Q9Z2E2 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mbd1Q9Z2E2 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mbd1Q9Z2E2 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mbd1Q9Z2E2 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mbd1Q9Z2E2 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mbd1Q9Z2E2 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mbd1Q9Z2E2 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mbd1Q9Z2E2 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mbd1Q9Z2E2 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mbd1Q9Z2E2 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mbd1Q9Z2E2 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mbd1Q9Z2E2 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mbd1Q9Z2E2 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mbd1Q9Z2E2 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mbd1Q9Z2E2 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mbd1Q9Z2E2 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mbd1Q9Z2E2 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mbd1Q9Z2E2 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mbd1Q9Z2E2 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mbd1Q9Z2E2 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mbd1Q9Z2E2 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mbd1Q9Z2E2 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Mbd1Q9Z2E2 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mbd1Q9Z2E2 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mbd1Q9Z2E2 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mbd1Q9Z2E2 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mbd1Q9Z2E2 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Mbd1Q9Z2E2 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Mbd1Q9Z2E2 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mbd1Q9Z2E2 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mbd1Q9Z2E2 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mbd1Q9Z2E2 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mbd1Q9Z2E2 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mbd1Q9Z2E2 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mbd1Q9Z2E2 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mbd1Q9Z2E2 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mbd1Q9Z2E2 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mbd1Q9Z2E2 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mbd1Q9Z2E2 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mbd1Q9Z2E2 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mbd1Q9Z2E2 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Mbd1Q9Z2E2 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mbd1Q9Z2E2 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Mbd1Q9Z2E2 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mbd1Q9Z2E2 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mbd1Q9Z2E2 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mbd1Q9Z2E2 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mbd1Q9Z2E2 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mbd1Q9Z2E2 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mbd1Q9Z2E2 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mbd1Q9Z2E2 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mbd1Q9Z2E2 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mbd1Q9Z2E2 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mbd1Q9Z2E2 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mbd1Q9Z2E2 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mbd1Q9Z2E2 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mbd1Q9Z2E2 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mbd1Q9Z2E2 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mbd1Q9Z2E2 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mbd1Q9Z2E2 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mbd1Q9Z2E2 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms