Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mbd3Q9Z2D8 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mbd3Q9Z2D8 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Mbd3Q9Z2D8 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Mbd3Q9Z2D8 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Mbd3Q9Z2D8 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Mbd3Q9Z2D8 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mbd3Q9Z2D8 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mbd3Q9Z2D8 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mbd3Q9Z2D8 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mbd3Q9Z2D8 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mbd3Q9Z2D8 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mbd3Q9Z2D8 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mbd3Q9Z2D8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mbd3Q9Z2D8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mbd3Q9Z2D8 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mbd3Q9Z2D8 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mbd3Q9Z2D8 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mbd3Q9Z2D8 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mbd3Q9Z2D8 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Mbd3Q9Z2D8 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mbd3Q9Z2D8 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mbd3Q9Z2D8 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mbd3Q9Z2D8 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mbd3Q9Z2D8 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mbd3Q9Z2D8 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mbd3Q9Z2D8 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mbd3Q9Z2D8 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mbd3Q9Z2D8 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mbd3Q9Z2D8 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Mbd3Q9Z2D8 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Mbd3Q9Z2D8 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Mbd3Q9Z2D8 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mbd3Q9Z2D8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mbd3Q9Z2D8 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mbd3Q9Z2D8 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mbd3Q9Z2D8 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mbd3Q9Z2D8 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mbd3Q9Z2D8 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mbd3Q9Z2D8 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Mbd3Q9Z2D8 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mbd3Q9Z2D8 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mbd3Q9Z2D8 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mbd3Q9Z2D8 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mbd3Q9Z2D8 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mbd3Q9Z2D8 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mbd3Q9Z2D8 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mbd3Q9Z2D8 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mbd3Q9Z2D8 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mbd3Q9Z2D8 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mbd3Q9Z2D8 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mbd3Q9Z2D8 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mbd3Q9Z2D8 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mbd3Q9Z2D8 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mbd3Q9Z2D8 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mbd3Q9Z2D8 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mbd3Q9Z2D8 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mbd3Q9Z2D8 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Mbd3Q9Z2D8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mbd3Q9Z2D8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mbd3Q9Z2D8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mbd3Q9Z2D8 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mbd3Q9Z2D8 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mbd3Q9Z2D8 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mbd3Q9Z2D8 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mbd3Q9Z2D8 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mbd3Q9Z2D8 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mbd3Q9Z2D8 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mbd3Q9Z2D8 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mbd3Q9Z2D8 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mbd3Q9Z2D8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mbd3Q9Z2D8 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mbd3Q9Z2D8 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Mbd3Q9Z2D8 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mbd3Q9Z2D8 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mbd3Q9Z2D8 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mbd3Q9Z2D8 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mbd3Q9Z2D8 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mbd3Q9Z2D8 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mbd3Q9Z2D8 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mbd3Q9Z2D8 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mbd3Q9Z2D8 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mbd3Q9Z2D8 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mbd3Q9Z2D8 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mbd3Q9Z2D8 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mbd3Q9Z2D8 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mbd3Q9Z2D8 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mbd3Q9Z2D8 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mbd3Q9Z2D8 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mbd3Q9Z2D8 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mbd3Q9Z2D8 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mbd3Q9Z2D8 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mbd3Q9Z2D8 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mbd3Q9Z2D8 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Mbd3Q9Z2D8 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mbd3Q9Z2D8 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mbd3Q9Z2D8 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mbd3Q9Z2D8 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mbd3Q9Z2D8 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mbd3Q9Z2D8 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms