Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D7

Mbd4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd4Q9Z2D7 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mbd4Q9Z2D7 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mbd4Q9Z2D7 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mbd4Q9Z2D7 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mbd4Q9Z2D7 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mbd4Q9Z2D7 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mbd4Q9Z2D7 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mbd4Q9Z2D7 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mbd4Q9Z2D7 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mbd4Q9Z2D7 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Mbd4Q9Z2D7 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mbd4Q9Z2D7 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mbd4Q9Z2D7 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mbd4Q9Z2D7 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mbd4Q9Z2D7 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mbd4Q9Z2D7 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mbd4Q9Z2D7 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Mbd4Q9Z2D7 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mbd4Q9Z2D7 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mbd4Q9Z2D7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mbd4Q9Z2D7 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mbd4Q9Z2D7 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Mbd4Q9Z2D7 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mbd4Q9Z2D7 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mbd4Q9Z2D7 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mbd4Q9Z2D7 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mbd4Q9Z2D7 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mbd4Q9Z2D7 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mbd4Q9Z2D7 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mbd4Q9Z2D7 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mbd4Q9Z2D7 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mbd4Q9Z2D7 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mbd4Q9Z2D7 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mbd4Q9Z2D7 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mbd4Q9Z2D7 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Mbd4Q9Z2D7 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mbd4Q9Z2D7 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mbd4Q9Z2D7 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mbd4Q9Z2D7 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mbd4Q9Z2D7 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mbd4Q9Z2D7 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mbd4Q9Z2D7 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mbd4Q9Z2D7 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mbd4Q9Z2D7 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mbd4Q9Z2D7 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mbd4Q9Z2D7 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mbd4Q9Z2D7 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mbd4Q9Z2D7 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mbd4Q9Z2D7 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mbd4Q9Z2D7 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mbd4Q9Z2D7 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mbd4Q9Z2D7 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mbd4Q9Z2D7 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mbd4Q9Z2D7 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mbd4Q9Z2D7 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mbd4Q9Z2D7 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mbd4Q9Z2D7 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mbd4Q9Z2D7 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mbd4Q9Z2D7 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mbd4Q9Z2D7 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mbd4Q9Z2D7 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mbd4Q9Z2D7 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mbd4Q9Z2D7 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mbd4Q9Z2D7 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mbd4Q9Z2D7 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mbd4Q9Z2D7 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mbd4Q9Z2D7 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mbd4Q9Z2D7 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mbd4Q9Z2D7 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mbd4Q9Z2D7 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mbd4Q9Z2D7 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mbd4Q9Z2D7 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mbd4Q9Z2D7 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mbd4Q9Z2D7 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mbd4Q9Z2D7 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mbd4Q9Z2D7 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Mbd4Q9Z2D7 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Mbd4Q9Z2D7 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Mbd4Q9Z2D7 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Mbd4Q9Z2D7 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mbd4Q9Z2D7 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mbd4Q9Z2D7 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mbd4Q9Z2D7 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mbd4Q9Z2D7 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mbd4Q9Z2D7 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mbd4Q9Z2D7 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mbd4Q9Z2D7 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mbd4Q9Z2D7 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mbd4Q9Z2D7 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mbd4Q9Z2D7 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mbd4Q9Z2D7 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mbd4Q9Z2D7 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mbd4Q9Z2D7 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mbd4Q9Z2D7 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mbd4Q9Z2D7 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mbd4Q9Z2D7 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mbd4Q9Z2D7 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mbd4Q9Z2D7 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mbd4Q9Z2D7 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mbd4Q9Z2D7 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms