Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2B9

Rps6ka4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka4Q9Z2B9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rps6ka4Q9Z2B9 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rps6ka4Q9Z2B9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rps6ka4Q9Z2B9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rps6ka4Q9Z2B9 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rps6ka4Q9Z2B9 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rps6ka4Q9Z2B9 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rps6ka4Q9Z2B9 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Rps6ka4Q9Z2B9 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rps6ka4Q9Z2B9 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Rps6ka4Q9Z2B9 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rps6ka4Q9Z2B9 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rps6ka4Q9Z2B9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rps6ka4Q9Z2B9 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rps6ka4Q9Z2B9 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rps6ka4Q9Z2B9 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rps6ka4Q9Z2B9 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rps6ka4Q9Z2B9 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rps6ka4Q9Z2B9 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rps6ka4Q9Z2B9 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Rps6ka4Q9Z2B9 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rps6ka4Q9Z2B9 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rps6ka4Q9Z2B9 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rps6ka4Q9Z2B9 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Rps6ka4Q9Z2B9 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rps6ka4Q9Z2B9 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rps6ka4Q9Z2B9 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rps6ka4Q9Z2B9 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rps6ka4Q9Z2B9 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rps6ka4Q9Z2B9 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rps6ka4Q9Z2B9 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rps6ka4Q9Z2B9 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Rps6ka4Q9Z2B9 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rps6ka4Q9Z2B9 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rps6ka4Q9Z2B9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rps6ka4Q9Z2B9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rps6ka4Q9Z2B9 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rps6ka4Q9Z2B9 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rps6ka4Q9Z2B9 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rps6ka4Q9Z2B9 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Rps6ka4Q9Z2B9 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rps6ka4Q9Z2B9 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rps6ka4Q9Z2B9 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rps6ka4Q9Z2B9 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rps6ka4Q9Z2B9 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rps6ka4Q9Z2B9 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rps6ka4Q9Z2B9 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rps6ka4Q9Z2B9 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rps6ka4Q9Z2B9 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rps6ka4Q9Z2B9 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rps6ka4Q9Z2B9 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rps6ka4Q9Z2B9 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rps6ka4Q9Z2B9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rps6ka4Q9Z2B9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rps6ka4Q9Z2B9 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rps6ka4Q9Z2B9 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rps6ka4Q9Z2B9 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rps6ka4Q9Z2B9 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rps6ka4Q9Z2B9 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Rps6ka4Q9Z2B9 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rps6ka4Q9Z2B9 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Rps6ka4Q9Z2B9 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rps6ka4Q9Z2B9 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rps6ka4Q9Z2B9 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Rps6ka4Q9Z2B9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rps6ka4Q9Z2B9 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms