Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z275

Rlbp1, Retinaldehyde-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rlbp1Q9Z275 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rlbp1Q9Z275 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rlbp1Q9Z275 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rlbp1Q9Z275 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rlbp1Q9Z275 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rlbp1Q9Z275 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rlbp1Q9Z275 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Rlbp1Q9Z275 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rlbp1Q9Z275 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rlbp1Q9Z275 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rlbp1Q9Z275 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Rlbp1Q9Z275 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Rlbp1Q9Z275 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Rlbp1Q9Z275 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rlbp1Q9Z275 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Rlbp1Q9Z275 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rlbp1Q9Z275 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rlbp1Q9Z275 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Rlbp1Q9Z275 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rlbp1Q9Z275 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rlbp1Q9Z275 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rlbp1Q9Z275 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rlbp1Q9Z275 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rlbp1Q9Z275 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rlbp1Q9Z275 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rlbp1Q9Z275 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rlbp1Q9Z275 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rlbp1Q9Z275 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rlbp1Q9Z275 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rlbp1Q9Z275 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rlbp1Q9Z275 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rlbp1Q9Z275 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rlbp1Q9Z275 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rlbp1Q9Z275 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rlbp1Q9Z275 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rlbp1Q9Z275 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rlbp1Q9Z275 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Rlbp1Q9Z275 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Rlbp1Q9Z275 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Rlbp1Q9Z275 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rlbp1Q9Z275 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Rlbp1Q9Z275 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rlbp1Q9Z275 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rlbp1Q9Z275 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Rlbp1Q9Z275 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rlbp1Q9Z275 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rlbp1Q9Z275 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rlbp1Q9Z275 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rlbp1Q9Z275 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rlbp1Q9Z275 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rlbp1Q9Z275 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rlbp1Q9Z275 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rlbp1Q9Z275 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rlbp1Q9Z275 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rlbp1Q9Z275 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rlbp1Q9Z275 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rlbp1Q9Z275 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rlbp1Q9Z275 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rlbp1Q9Z275 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rlbp1Q9Z275 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rlbp1Q9Z275 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rlbp1Q9Z275 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rlbp1Q9Z275 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Rlbp1Q9Z275 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rlbp1Q9Z275 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rlbp1Q9Z275 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rlbp1Q9Z275 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rlbp1Q9Z275 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rlbp1Q9Z275 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rlbp1Q9Z275 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rlbp1Q9Z275 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rlbp1Q9Z275 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rlbp1Q9Z275 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rlbp1Q9Z275 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rlbp1Q9Z275 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rlbp1Q9Z275 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rlbp1Q9Z275 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rlbp1Q9Z275 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rlbp1Q9Z275 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rlbp1Q9Z275 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rlbp1Q9Z275 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rlbp1Q9Z275 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Rlbp1Q9Z275 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rlbp1Q9Z275 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rlbp1Q9Z275 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rlbp1Q9Z275 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rlbp1Q9Z275 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rlbp1Q9Z275 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rlbp1Q9Z275 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rlbp1Q9Z275 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rlbp1Q9Z275 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rlbp1Q9Z275 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rlbp1Q9Z275 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rlbp1Q9Z275 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rlbp1Q9Z275 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rlbp1Q9Z275 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rlbp1Q9Z275 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rlbp1Q9Z275 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rlbp1Q9Z275 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rlbp1Q9Z275 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms