Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn8Q9Z260 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn8Q9Z260 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn8Q9Z260 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn8Q9Z260 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn8Q9Z260 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn8Q9Z260 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn8Q9Z260 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn8Q9Z260 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn8Q9Z260 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn8Q9Z260 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms