Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z238

Ccne2, G1/S-specific cyclin-E2, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne2Q9Z238 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ccne2Q9Z238 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccne2Q9Z238 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccne2Q9Z238 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccne2Q9Z238 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccne2Q9Z238 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccne2Q9Z238 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccne2Q9Z238 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccne2Q9Z238 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ccne2Q9Z238 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccne2Q9Z238 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccne2Q9Z238 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccne2Q9Z238 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccne2Q9Z238 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccne2Q9Z238 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccne2Q9Z238 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccne2Q9Z238 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ccne2Q9Z238 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccne2Q9Z238 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccne2Q9Z238 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccne2Q9Z238 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccne2Q9Z238 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccne2Q9Z238 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccne2Q9Z238 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccne2Q9Z238 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccne2Q9Z238 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccne2Q9Z238 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccne2Q9Z238 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccne2Q9Z238 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ccne2Q9Z238 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccne2Q9Z238 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccne2Q9Z238 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccne2Q9Z238 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccne2Q9Z238 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccne2Q9Z238 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccne2Q9Z238 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccne2Q9Z238 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccne2Q9Z238 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccne2Q9Z238 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccne2Q9Z238 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccne2Q9Z238 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccne2Q9Z238 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccne2Q9Z238 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccne2Q9Z238 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccne2Q9Z238 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccne2Q9Z238 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccne2Q9Z238 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccne2Q9Z238 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccne2Q9Z238 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ccne2Q9Z238 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccne2Q9Z238 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccne2Q9Z238 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccne2Q9Z238 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccne2Q9Z238 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccne2Q9Z238 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccne2Q9Z238 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccne2Q9Z238 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccne2Q9Z238 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccne2Q9Z238 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccne2Q9Z238 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccne2Q9Z238 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccne2Q9Z238 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccne2Q9Z238 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccne2Q9Z238 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccne2Q9Z238 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccne2Q9Z238 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccne2Q9Z238 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccne2Q9Z238 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccne2Q9Z238 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccne2Q9Z238 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccne2Q9Z238 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccne2Q9Z238 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccne2Q9Z238 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccne2Q9Z238 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccne2Q9Z238 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccne2Q9Z238 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccne2Q9Z238 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccne2Q9Z238 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccne2Q9Z238 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccne2Q9Z238 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccne2Q9Z238 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccne2Q9Z238 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccne2Q9Z238 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccne2Q9Z238 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccne2Q9Z238 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccne2Q9Z238 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccne2Q9Z238 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccne2Q9Z238 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccne2Q9Z238 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccne2Q9Z238 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccne2Q9Z238 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccne2Q9Z238 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccne2Q9Z238 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccne2Q9Z238 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccne2Q9Z238 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccne2Q9Z238 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccne2Q9Z238 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccne2Q9Z238 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccne2Q9Z238 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccne2Q9Z238 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms