Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trip6Q9Z1Y4 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Trip6Q9Z1Y4 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Trip6Q9Z1Y4 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trip6Q9Z1Y4 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trip6Q9Z1Y4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trip6Q9Z1Y4 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trip6Q9Z1Y4 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trip6Q9Z1Y4 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trip6Q9Z1Y4 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trip6Q9Z1Y4 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trip6Q9Z1Y4 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trip6Q9Z1Y4 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trip6Q9Z1Y4 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trip6Q9Z1Y4 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trip6Q9Z1Y4 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trip6Q9Z1Y4 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trip6Q9Z1Y4 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Trip6Q9Z1Y4 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trip6Q9Z1Y4 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trip6Q9Z1Y4 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trip6Q9Z1Y4 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trip6Q9Z1Y4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trip6Q9Z1Y4 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trip6Q9Z1Y4 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Trip6Q9Z1Y4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trip6Q9Z1Y4 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trip6Q9Z1Y4 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trip6Q9Z1Y4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trip6Q9Z1Y4 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trip6Q9Z1Y4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trip6Q9Z1Y4 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trip6Q9Z1Y4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trip6Q9Z1Y4 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trip6Q9Z1Y4 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trip6Q9Z1Y4 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trip6Q9Z1Y4 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Trip6Q9Z1Y4 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Trip6Q9Z1Y4 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trip6Q9Z1Y4 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trip6Q9Z1Y4 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trip6Q9Z1Y4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trip6Q9Z1Y4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trip6Q9Z1Y4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trip6Q9Z1Y4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trip6Q9Z1Y4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trip6Q9Z1Y4 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trip6Q9Z1Y4 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trip6Q9Z1Y4 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Trip6Q9Z1Y4 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trip6Q9Z1Y4 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trip6Q9Z1Y4 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trip6Q9Z1Y4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trip6Q9Z1Y4 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Trip6Q9Z1Y4 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trip6Q9Z1Y4 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trip6Q9Z1Y4 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trip6Q9Z1Y4 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Trip6Q9Z1Y4 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Trip6Q9Z1Y4 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Trip6Q9Z1Y4 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trip6Q9Z1Y4 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Trip6Q9Z1Y4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trip6Q9Z1Y4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trip6Q9Z1Y4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trip6Q9Z1Y4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trip6Q9Z1Y4 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trip6Q9Z1Y4 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trip6Q9Z1Y4 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trip6Q9Z1Y4 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trip6Q9Z1Y4 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trip6Q9Z1Y4 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trip6Q9Z1Y4 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Trip6Q9Z1Y4 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trip6Q9Z1Y4 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trip6Q9Z1Y4 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trip6Q9Z1Y4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trip6Q9Z1Y4 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trip6Q9Z1Y4 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trip6Q9Z1Y4 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trip6Q9Z1Y4 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trip6Q9Z1Y4 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trip6Q9Z1Y4 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trip6Q9Z1Y4 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trip6Q9Z1Y4 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trip6Q9Z1Y4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trip6Q9Z1Y4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trip6Q9Z1Y4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trip6Q9Z1Y4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trip6Q9Z1Y4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trip6Q9Z1Y4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trip6Q9Z1Y4 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trip6Q9Z1Y4 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trip6Q9Z1Y4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trip6Q9Z1Y4 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trip6Q9Z1Y4 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trip6Q9Z1Y4 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trip6Q9Z1Y4 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trip6Q9Z1Y4 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Trip6Q9Z1Y4 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms