Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ap3b1Q9Z1T1 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ap3b1Q9Z1T1 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Ap3b1Q9Z1T1 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ap3b1Q9Z1T1 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ap3b1Q9Z1T1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ap3b1Q9Z1T1 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ap3b1Q9Z1T1 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ap3b1Q9Z1T1 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ap3b1Q9Z1T1 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ap3b1Q9Z1T1 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ap3b1Q9Z1T1 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ap3b1Q9Z1T1 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ap3b1Q9Z1T1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ap3b1Q9Z1T1 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ap3b1Q9Z1T1 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ap3b1Q9Z1T1 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ap3b1Q9Z1T1 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ap3b1Q9Z1T1 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ap3b1Q9Z1T1 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ap3b1Q9Z1T1 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ap3b1Q9Z1T1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ap3b1Q9Z1T1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ap3b1Q9Z1T1 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ap3b1Q9Z1T1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ap3b1Q9Z1T1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ap3b1Q9Z1T1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ap3b1Q9Z1T1 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ap3b1Q9Z1T1 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ap3b1Q9Z1T1 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Ap3b1Q9Z1T1 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ap3b1Q9Z1T1 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ap3b1Q9Z1T1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ap3b1Q9Z1T1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ap3b1Q9Z1T1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ap3b1Q9Z1T1 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ap3b1Q9Z1T1 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ap3b1Q9Z1T1 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ap3b1Q9Z1T1 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ap3b1Q9Z1T1 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Ap3b1Q9Z1T1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ap3b1Q9Z1T1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ap3b1Q9Z1T1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ap3b1Q9Z1T1 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ap3b1Q9Z1T1 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ap3b1Q9Z1T1 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ap3b1Q9Z1T1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ap3b1Q9Z1T1 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ap3b1Q9Z1T1 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ap3b1Q9Z1T1 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ap3b1Q9Z1T1 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ap3b1Q9Z1T1 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ap3b1Q9Z1T1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ap3b1Q9Z1T1 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ap3b1Q9Z1T1 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ap3b1Q9Z1T1 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ap3b1Q9Z1T1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ap3b1Q9Z1T1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ap3b1Q9Z1T1 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ap3b1Q9Z1T1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ap3b1Q9Z1T1 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ap3b1Q9Z1T1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ap3b1Q9Z1T1 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ap3b1Q9Z1T1 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ap3b1Q9Z1T1 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ap3b1Q9Z1T1 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Ap3b1Q9Z1T1 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ap3b1Q9Z1T1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ap3b1Q9Z1T1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ap3b1Q9Z1T1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Ap3b1Q9Z1T1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ap3b1Q9Z1T1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ap3b1Q9Z1T1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ap3b1Q9Z1T1 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Ap3b1Q9Z1T1 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ap3b1Q9Z1T1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ap3b1Q9Z1T1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ap3b1Q9Z1T1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ap3b1Q9Z1T1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ap3b1Q9Z1T1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ap3b1Q9Z1T1 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ap3b1Q9Z1T1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ap3b1Q9Z1T1 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ap3b1Q9Z1T1 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Ap3b1Q9Z1T1 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ap3b1Q9Z1T1 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Ap3b1Q9Z1T1 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ap3b1Q9Z1T1 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ap3b1Q9Z1T1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ap3b1Q9Z1T1 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ap3b1Q9Z1T1 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ap3b1Q9Z1T1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ap3b1Q9Z1T1 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ap3b1Q9Z1T1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ap3b1Q9Z1T1 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Ap3b1Q9Z1T1 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ap3b1Q9Z1T1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ap3b1Q9Z1T1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms