Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q9

Vars, Valine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VarsQ9Z1Q9 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VarsQ9Z1Q9 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VarsQ9Z1Q9 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VarsQ9Z1Q9 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
VarsQ9Z1Q9 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VarsQ9Z1Q9 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VarsQ9Z1Q9 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VarsQ9Z1Q9 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VarsQ9Z1Q9 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VarsQ9Z1Q9 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VarsQ9Z1Q9 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
VarsQ9Z1Q9 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VarsQ9Z1Q9 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
VarsQ9Z1Q9 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VarsQ9Z1Q9 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VarsQ9Z1Q9 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VarsQ9Z1Q9 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VarsQ9Z1Q9 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VarsQ9Z1Q9 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VarsQ9Z1Q9 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VarsQ9Z1Q9 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VarsQ9Z1Q9 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VarsQ9Z1Q9 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VarsQ9Z1Q9 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VarsQ9Z1Q9 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VarsQ9Z1Q9 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VarsQ9Z1Q9 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VarsQ9Z1Q9 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
VarsQ9Z1Q9 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VarsQ9Z1Q9 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
VarsQ9Z1Q9 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VarsQ9Z1Q9 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VarsQ9Z1Q9 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VarsQ9Z1Q9 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VarsQ9Z1Q9 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VarsQ9Z1Q9 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VarsQ9Z1Q9 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VarsQ9Z1Q9 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VarsQ9Z1Q9 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VarsQ9Z1Q9 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VarsQ9Z1Q9 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VarsQ9Z1Q9 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
VarsQ9Z1Q9 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VarsQ9Z1Q9 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VarsQ9Z1Q9 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VarsQ9Z1Q9 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VarsQ9Z1Q9 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VarsQ9Z1Q9 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
VarsQ9Z1Q9 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VarsQ9Z1Q9 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VarsQ9Z1Q9 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VarsQ9Z1Q9 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VarsQ9Z1Q9 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VarsQ9Z1Q9 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VarsQ9Z1Q9 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VarsQ9Z1Q9 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VarsQ9Z1Q9 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VarsQ9Z1Q9 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VarsQ9Z1Q9 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VarsQ9Z1Q9 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VarsQ9Z1Q9 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VarsQ9Z1Q9 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VarsQ9Z1Q9 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VarsQ9Z1Q9 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
VarsQ9Z1Q9 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VarsQ9Z1Q9 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VarsQ9Z1Q9 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VarsQ9Z1Q9 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
VarsQ9Z1Q9 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VarsQ9Z1Q9 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VarsQ9Z1Q9 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VarsQ9Z1Q9 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VarsQ9Z1Q9 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
VarsQ9Z1Q9 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VarsQ9Z1Q9 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VarsQ9Z1Q9 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VarsQ9Z1Q9 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VarsQ9Z1Q9 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VarsQ9Z1Q9 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VarsQ9Z1Q9 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VarsQ9Z1Q9 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VarsQ9Z1Q9 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VarsQ9Z1Q9 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VarsQ9Z1Q9 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VarsQ9Z1Q9 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VarsQ9Z1Q9 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VarsQ9Z1Q9 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VarsQ9Z1Q9 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VarsQ9Z1Q9 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VarsQ9Z1Q9 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VarsQ9Z1Q9 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VarsQ9Z1Q9 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VarsQ9Z1Q9 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VarsQ9Z1Q9 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VarsQ9Z1Q9 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VarsQ9Z1Q9 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VarsQ9Z1Q9 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VarsQ9Z1Q9 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VarsQ9Z1Q9 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VarsQ9Z1Q9 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms