Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lgr5Q9Z1P4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lgr5Q9Z1P4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lgr5Q9Z1P4 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lgr5Q9Z1P4 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Lgr5Q9Z1P4 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lgr5Q9Z1P4 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Lgr5Q9Z1P4 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lgr5Q9Z1P4 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lgr5Q9Z1P4 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lgr5Q9Z1P4 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lgr5Q9Z1P4 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lgr5Q9Z1P4 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lgr5Q9Z1P4 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lgr5Q9Z1P4 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lgr5Q9Z1P4 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lgr5Q9Z1P4 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lgr5Q9Z1P4 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lgr5Q9Z1P4 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lgr5Q9Z1P4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lgr5Q9Z1P4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lgr5Q9Z1P4 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lgr5Q9Z1P4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lgr5Q9Z1P4 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lgr5Q9Z1P4 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lgr5Q9Z1P4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lgr5Q9Z1P4 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lgr5Q9Z1P4 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lgr5Q9Z1P4 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lgr5Q9Z1P4 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lgr5Q9Z1P4 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lgr5Q9Z1P4 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lgr5Q9Z1P4 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lgr5Q9Z1P4 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lgr5Q9Z1P4 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lgr5Q9Z1P4 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lgr5Q9Z1P4 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lgr5Q9Z1P4 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lgr5Q9Z1P4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lgr5Q9Z1P4 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lgr5Q9Z1P4 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lgr5Q9Z1P4 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lgr5Q9Z1P4 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lgr5Q9Z1P4 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lgr5Q9Z1P4 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lgr5Q9Z1P4 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lgr5Q9Z1P4 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lgr5Q9Z1P4 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lgr5Q9Z1P4 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Lgr5Q9Z1P4 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lgr5Q9Z1P4 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lgr5Q9Z1P4 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Lgr5Q9Z1P4 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Lgr5Q9Z1P4 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Lgr5Q9Z1P4 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lgr5Q9Z1P4 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Lgr5Q9Z1P4 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lgr5Q9Z1P4 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lgr5Q9Z1P4 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lgr5Q9Z1P4 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lgr5Q9Z1P4 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lgr5Q9Z1P4 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lgr5Q9Z1P4 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lgr5Q9Z1P4 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Lgr5Q9Z1P4 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lgr5Q9Z1P4 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lgr5Q9Z1P4 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lgr5Q9Z1P4 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Lgr5Q9Z1P4 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Lgr5Q9Z1P4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lgr5Q9Z1P4 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lgr5Q9Z1P4 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Lgr5Q9Z1P4 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lgr5Q9Z1P4 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lgr5Q9Z1P4 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Lgr5Q9Z1P4 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lgr5Q9Z1P4 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Lgr5Q9Z1P4 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lgr5Q9Z1P4 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lgr5Q9Z1P4 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lgr5Q9Z1P4 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lgr5Q9Z1P4 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Lgr5Q9Z1P4 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Lgr5Q9Z1P4 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lgr5Q9Z1P4 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lgr5Q9Z1P4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lgr5Q9Z1P4 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Lgr5Q9Z1P4 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lgr5Q9Z1P4 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lgr5Q9Z1P4 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lgr5Q9Z1P4 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Lgr5Q9Z1P4 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lgr5Q9Z1P4 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lgr5Q9Z1P4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lgr5Q9Z1P4 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Lgr5Q9Z1P4 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lgr5Q9Z1P4 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lgr5Q9Z1P4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lgr5Q9Z1P4 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lgr5Q9Z1P4 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms