Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N5

Ddx39b, Spliceosome RNA helicase Ddx39b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx39bQ9Z1N5 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ddx39bQ9Z1N5 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ddx39bQ9Z1N5 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ddx39bQ9Z1N5 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ddx39bQ9Z1N5 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ddx39bQ9Z1N5 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ddx39bQ9Z1N5 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ddx39bQ9Z1N5 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ddx39bQ9Z1N5 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ddx39bQ9Z1N5 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ddx39bQ9Z1N5 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ddx39bQ9Z1N5 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ddx39bQ9Z1N5 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ddx39bQ9Z1N5 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ddx39bQ9Z1N5 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ddx39bQ9Z1N5 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ddx39bQ9Z1N5 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ddx39bQ9Z1N5 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ddx39bQ9Z1N5 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ddx39bQ9Z1N5 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ddx39bQ9Z1N5 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ddx39bQ9Z1N5 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ddx39bQ9Z1N5 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ddx39bQ9Z1N5 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ddx39bQ9Z1N5 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ddx39bQ9Z1N5 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ddx39bQ9Z1N5 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ddx39bQ9Z1N5 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ddx39bQ9Z1N5 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ddx39bQ9Z1N5 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ddx39bQ9Z1N5 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ddx39bQ9Z1N5 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ddx39bQ9Z1N5 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ddx39bQ9Z1N5 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ddx39bQ9Z1N5 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ddx39bQ9Z1N5 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ddx39bQ9Z1N5 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ddx39bQ9Z1N5 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ddx39bQ9Z1N5 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ddx39bQ9Z1N5 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ddx39bQ9Z1N5 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ddx39bQ9Z1N5 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ddx39bQ9Z1N5 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ddx39bQ9Z1N5 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ddx39bQ9Z1N5 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ddx39bQ9Z1N5 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ddx39bQ9Z1N5 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ddx39bQ9Z1N5 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ddx39bQ9Z1N5 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ddx39bQ9Z1N5 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ddx39bQ9Z1N5 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ddx39bQ9Z1N5 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ddx39bQ9Z1N5 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ddx39bQ9Z1N5 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ddx39bQ9Z1N5 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ddx39bQ9Z1N5 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ddx39bQ9Z1N5 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ddx39bQ9Z1N5 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ddx39bQ9Z1N5 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ddx39bQ9Z1N5 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ddx39bQ9Z1N5 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ddx39bQ9Z1N5 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ddx39bQ9Z1N5 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ddx39bQ9Z1N5 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ddx39bQ9Z1N5 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ddx39bQ9Z1N5 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ddx39bQ9Z1N5 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ddx39bQ9Z1N5 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ddx39bQ9Z1N5 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ddx39bQ9Z1N5 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ddx39bQ9Z1N5 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ddx39bQ9Z1N5 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ddx39bQ9Z1N5 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ddx39bQ9Z1N5 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ddx39bQ9Z1N5 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ddx39bQ9Z1N5 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ddx39bQ9Z1N5 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ddx39bQ9Z1N5 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ddx39bQ9Z1N5 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ddx39bQ9Z1N5 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ddx39bQ9Z1N5 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ddx39bQ9Z1N5 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ddx39bQ9Z1N5 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ddx39bQ9Z1N5 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ddx39bQ9Z1N5 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ddx39bQ9Z1N5 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ddx39bQ9Z1N5 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ddx39bQ9Z1N5 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ddx39bQ9Z1N5 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ddx39bQ9Z1N5 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ddx39bQ9Z1N5 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ddx39bQ9Z1N5 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ddx39bQ9Z1N5 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ddx39bQ9Z1N5 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ddx39bQ9Z1N5 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ddx39bQ9Z1N5 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ddx39bQ9Z1N5 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ddx39bQ9Z1N5 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms