Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z185

Padi1, Protein-arginine deiminase type-1, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Padi1Q9Z185 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Padi1Q9Z185 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Padi1Q9Z185 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Padi1Q9Z185 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Padi1Q9Z185 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Padi1Q9Z185 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Padi1Q9Z185 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Padi1Q9Z185 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Padi1Q9Z185 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Padi1Q9Z185 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Padi1Q9Z185 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Padi1Q9Z185 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Padi1Q9Z185 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Padi1Q9Z185 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Padi1Q9Z185 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Padi1Q9Z185 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Padi1Q9Z185 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Padi1Q9Z185 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Padi1Q9Z185 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Padi1Q9Z185 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Padi1Q9Z185 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Padi1Q9Z185 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Padi1Q9Z185 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Padi1Q9Z185 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Padi1Q9Z185 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Padi1Q9Z185 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Padi1Q9Z185 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Padi1Q9Z185 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Padi1Q9Z185 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Padi1Q9Z185 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Padi1Q9Z185 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Padi1Q9Z185 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Padi1Q9Z185 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Padi1Q9Z185 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Padi1Q9Z185 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Padi1Q9Z185 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Padi1Q9Z185 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Padi1Q9Z185 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Padi1Q9Z185 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Padi1Q9Z185 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Padi1Q9Z185 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Padi1Q9Z185 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Padi1Q9Z185 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Padi1Q9Z185 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Padi1Q9Z185 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Padi1Q9Z185 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Padi1Q9Z185 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Padi1Q9Z185 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Padi1Q9Z185 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Padi1Q9Z185 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Padi1Q9Z185 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Padi1Q9Z185 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Padi1Q9Z185 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Padi1Q9Z185 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Padi1Q9Z185 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Padi1Q9Z185 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Padi1Q9Z185 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Padi1Q9Z185 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Padi1Q9Z185 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Padi1Q9Z185 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Padi1Q9Z185 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Padi1Q9Z185 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Padi1Q9Z185 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Padi1Q9Z185 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Padi1Q9Z185 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Padi1Q9Z185 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Padi1Q9Z185 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Padi1Q9Z185 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Padi1Q9Z185 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Padi1Q9Z185 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Padi1Q9Z185 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Padi1Q9Z185 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Padi1Q9Z185 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Padi1Q9Z185 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Padi1Q9Z185 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Padi1Q9Z185 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Padi1Q9Z185 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Padi1Q9Z185 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Padi1Q9Z185 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Padi1Q9Z185 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Padi1Q9Z185 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Padi1Q9Z185 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Padi1Q9Z185 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Padi1Q9Z185 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Padi1Q9Z185 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Padi1Q9Z185 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Padi1Q9Z185 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Padi1Q9Z185 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Padi1Q9Z185 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Padi1Q9Z185 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Padi1Q9Z185 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Padi1Q9Z185 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Padi1Q9Z185 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Padi1Q9Z185 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Padi1Q9Z185 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Padi1Q9Z185 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Padi1Q9Z185 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Padi1Q9Z185 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Padi1Q9Z185 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Padi1Q9Z185 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms