Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Z3

Skp2, S-phase kinase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp2Q9Z0Z3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Skp2Q9Z0Z3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Skp2Q9Z0Z3 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Skp2Q9Z0Z3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Skp2Q9Z0Z3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Skp2Q9Z0Z3 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Skp2Q9Z0Z3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Skp2Q9Z0Z3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Skp2Q9Z0Z3 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Skp2Q9Z0Z3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Skp2Q9Z0Z3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Skp2Q9Z0Z3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Skp2Q9Z0Z3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Skp2Q9Z0Z3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Skp2Q9Z0Z3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Skp2Q9Z0Z3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Skp2Q9Z0Z3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Skp2Q9Z0Z3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Skp2Q9Z0Z3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Skp2Q9Z0Z3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Skp2Q9Z0Z3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Skp2Q9Z0Z3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Skp2Q9Z0Z3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Skp2Q9Z0Z3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Skp2Q9Z0Z3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Skp2Q9Z0Z3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Skp2Q9Z0Z3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Skp2Q9Z0Z3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Skp2Q9Z0Z3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Skp2Q9Z0Z3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Skp2Q9Z0Z3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Skp2Q9Z0Z3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Skp2Q9Z0Z3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Skp2Q9Z0Z3 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Skp2Q9Z0Z3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Skp2Q9Z0Z3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Skp2Q9Z0Z3 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Skp2Q9Z0Z3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Skp2Q9Z0Z3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Skp2Q9Z0Z3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Skp2Q9Z0Z3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Skp2Q9Z0Z3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Skp2Q9Z0Z3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Skp2Q9Z0Z3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Skp2Q9Z0Z3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Skp2Q9Z0Z3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Skp2Q9Z0Z3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Skp2Q9Z0Z3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Skp2Q9Z0Z3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Skp2Q9Z0Z3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Skp2Q9Z0Z3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Skp2Q9Z0Z3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Skp2Q9Z0Z3 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Skp2Q9Z0Z3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Skp2Q9Z0Z3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Skp2Q9Z0Z3 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Skp2Q9Z0Z3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Skp2Q9Z0Z3 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Skp2Q9Z0Z3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Skp2Q9Z0Z3 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Skp2Q9Z0Z3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Skp2Q9Z0Z3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Skp2Q9Z0Z3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Skp2Q9Z0Z3 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Skp2Q9Z0Z3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Skp2Q9Z0Z3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Skp2Q9Z0Z3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Skp2Q9Z0Z3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Skp2Q9Z0Z3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Skp2Q9Z0Z3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Skp2Q9Z0Z3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Skp2Q9Z0Z3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Skp2Q9Z0Z3 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Skp2Q9Z0Z3 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Skp2Q9Z0Z3 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Skp2Q9Z0Z3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Skp2Q9Z0Z3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Skp2Q9Z0Z3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Skp2Q9Z0Z3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Skp2Q9Z0Z3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Skp2Q9Z0Z3 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Skp2Q9Z0Z3 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Skp2Q9Z0Z3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Skp2Q9Z0Z3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Skp2Q9Z0Z3 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Skp2Q9Z0Z3 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Skp2Q9Z0Z3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Skp2Q9Z0Z3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Skp2Q9Z0Z3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Skp2Q9Z0Z3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Skp2Q9Z0Z3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Skp2Q9Z0Z3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Skp2Q9Z0Z3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Skp2Q9Z0Z3 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Skp2Q9Z0Z3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Skp2Q9Z0Z3 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Skp2Q9Z0Z3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Skp2Q9Z0Z3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Skp2Q9Z0Z3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Skp2Q9Z0Z3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms