Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W3

Nup160, Nuclear pore complex protein Nup160, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup160Q9Z0W3 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Nup160Q9Z0W3 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nup160Q9Z0W3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nup160Q9Z0W3 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nup160Q9Z0W3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nup160Q9Z0W3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nup160Q9Z0W3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nup160Q9Z0W3 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nup160Q9Z0W3 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nup160Q9Z0W3 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nup160Q9Z0W3 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nup160Q9Z0W3 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nup160Q9Z0W3 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nup160Q9Z0W3 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nup160Q9Z0W3 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nup160Q9Z0W3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nup160Q9Z0W3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nup160Q9Z0W3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nup160Q9Z0W3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nup160Q9Z0W3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nup160Q9Z0W3 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nup160Q9Z0W3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nup160Q9Z0W3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nup160Q9Z0W3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nup160Q9Z0W3 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nup160Q9Z0W3 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nup160Q9Z0W3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nup160Q9Z0W3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nup160Q9Z0W3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nup160Q9Z0W3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nup160Q9Z0W3 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nup160Q9Z0W3 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nup160Q9Z0W3 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Nup160Q9Z0W3 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Nup160Q9Z0W3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Nup160Q9Z0W3 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Nup160Q9Z0W3 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Nup160Q9Z0W3 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Nup160Q9Z0W3 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Nup160Q9Z0W3 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Nup160Q9Z0W3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nup160Q9Z0W3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nup160Q9Z0W3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Nup160Q9Z0W3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nup160Q9Z0W3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nup160Q9Z0W3 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nup160Q9Z0W3 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nup160Q9Z0W3 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nup160Q9Z0W3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nup160Q9Z0W3 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nup160Q9Z0W3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Nup160Q9Z0W3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Nup160Q9Z0W3 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Nup160Q9Z0W3 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Nup160Q9Z0W3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Nup160Q9Z0W3 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Nup160Q9Z0W3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nup160Q9Z0W3 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nup160Q9Z0W3 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Nup160Q9Z0W3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nup160Q9Z0W3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nup160Q9Z0W3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nup160Q9Z0W3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nup160Q9Z0W3 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nup160Q9Z0W3 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nup160Q9Z0W3 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Nup160Q9Z0W3 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Nup160Q9Z0W3 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Nup160Q9Z0W3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nup160Q9Z0W3 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nup160Q9Z0W3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nup160Q9Z0W3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nup160Q9Z0W3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nup160Q9Z0W3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Nup160Q9Z0W3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Nup160Q9Z0W3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Nup160Q9Z0W3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Nup160Q9Z0W3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Nup160Q9Z0W3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Nup160Q9Z0W3 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Nup160Q9Z0W3 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Nup160Q9Z0W3 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Nup160Q9Z0W3 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Nup160Q9Z0W3 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Nup160Q9Z0W3 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Nup160Q9Z0W3 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Nup160Q9Z0W3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Nup160Q9Z0W3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Nup160Q9Z0W3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Nup160Q9Z0W3 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Nup160Q9Z0W3 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Nup160Q9Z0W3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Nup160Q9Z0W3 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Nup160Q9Z0W3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Nup160Q9Z0W3 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Nup160Q9Z0W3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Nup160Q9Z0W3 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Nup160Q9Z0W3 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Nup160Q9Z0W3 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Nup160Q9Z0W3 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms