Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S5

Cldn15, Claudin-15, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn15Q9Z0S5 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn15Q9Z0S5 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn15Q9Z0S5 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn15Q9Z0S5 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn15Q9Z0S5 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn15Q9Z0S5 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn15Q9Z0S5 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn15Q9Z0S5 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Cldn15Q9Z0S5 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn15Q9Z0S5 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn15Q9Z0S5 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn15Q9Z0S5 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Cldn15Q9Z0S5 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Cldn15Q9Z0S5 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Cldn15Q9Z0S5 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Cldn15Q9Z0S5 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Cldn15Q9Z0S5 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
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Cldn15Q9Z0S5 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Cldn15Q9Z0S5 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Cldn15Q9Z0S5 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn15Q9Z0S5 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn15Q9Z0S5 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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Cldn15Q9Z0S5 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Cldn15Q9Z0S5 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cldn15Q9Z0S5 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cldn15Q9Z0S5 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cldn15Q9Z0S5 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn15Q9Z0S5 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Cldn15Q9Z0S5 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn15Q9Z0S5 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn15Q9Z0S5 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn15Q9Z0S5 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn15Q9Z0S5 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn15Q9Z0S5 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn15Q9Z0S5 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn15Q9Z0S5 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn15Q9Z0S5 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn15Q9Z0S5 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn15Q9Z0S5 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn15Q9Z0S5 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn15Q9Z0S5 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn15Q9Z0S5 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn15Q9Z0S5 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn15Q9Z0S5 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn15Q9Z0S5 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn15Q9Z0S5 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn15Q9Z0S5 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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